Las Actinobacterias son un filo de bacterias en su mayoría Gram-positivas . Pueden ser terrestres o acuáticos . [1] Son de gran importancia económica para los humanos porque la agricultura y los bosques dependen de sus contribuciones a los sistemas del suelo . En el suelo, ayudan a descomponer la materia orgánica de los organismos muertos para que las plantas puedan volver a absorber las moléculas . Si bien este papel también lo desempeñan los hongos , las actinobacterias son mucho más pequeñas y probablemente no ocupen el mismo nicho ecológico . En este papel elLas colonias a menudo desarrollan micelios extensos , como lo haría un hongo, y el nombre de un orden importante del filo, Actinomycetales (los actinomicetos), refleja que durante mucho tiempo se creyó que eran hongos. Algunas actinobacterias del suelo (como Frankia ) viven simbióticamente con las plantas cuyas raíces impregnan el suelo, fijando nitrógeno para las plantas a cambio de acceso a algunos de los sacáridos de la planta . Otras especies, como muchos miembros del género Mycobacterium , son patógenos importantes .
Actinobacterias | |
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Micrografía electrónica de barrido de Actinomyces israelii . | |
clasificación cientifica | |
Dominio: | Bacterias |
(no clasificado): | Terrabacterias |
Filo: | Actinobacteria Goodfellow, 2012 |
Clases | |
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Sinónimos | |
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Más allá del gran interés en Actinobacteria por su papel en el suelo, aún queda mucho por aprender sobre ellas. Aunque actualmente se entienden principalmente como bacterias del suelo, podrían ser más abundantes en aguas dulces. [2] Actinobacteria es uno de los filos bacterianos dominantes y contiene uno de los géneros bacterianos más grandes, Streptomyces . [3] Streptomyces y otras actinobacterias son los principales contribuyentes a la amortiguación biológica de los suelos. [4] También son la fuente de muchos antibióticos .
El género Actinobateria Bifidobacterium es la bacteria más común en el microbioma de los bebés humanos. [5] Aunque los adultos tienen menos bifidobacterias, las bifidobacterias intestinales ayudan a mantener la barrera mucosa y reducen los lipopolisacáridos en el intestino. [6]
Aunque algunas de las células bacterianas más grandes y complejas pertenecen a las Actinobacterias, se ha descrito que el grupo de Actinomarinales marinos posee las células procariotas de vida libre más pequeñas . [7]
Se dice que algunas Actinobacterias siberianas o antárticas son el organismo vivo más antiguo de la Tierra, congelado en el permafrost hace alrededor de medio millón de años. [8] [9] Los síntomas de la vida fueron detectados por CO
2liberación de muestras de permafrost de 640 kya o menos. [10]
General
La mayoría de las Actinobacterias de importancia médica o económica pertenecen a la subclase Actinobacteridae y pertenecen al orden Actinomycetales . Si bien muchos de estos causan enfermedades en humanos, Streptomyces es notable como fuente de antibióticos . [ cita requerida ]
De las Actinobacterias que no se encuentran en los Actinomycetales, Gardnerella es una de las más investigadas. La clasificación de Gardnerella es controvertida, y MeSH lo cataloga como un organismo Gram-positivo y Gram-negativo . [11]
Las actinobacterias, especialmente Streptomyces spp., Son reconocidas como productoras de muchos metabolitos bioactivos que son útiles para los seres humanos en medicina, como antibacterianos, [12] antifúngicos, [13] antivirales, antitrombóticos, inmunomodificadores, fármacos antitumorales e inhibidores de enzimas; y en agricultura, incluidos insecticidas, herbicidas, fungicidas y sustancias promotoras del crecimiento para plantas y animales. [14] [15] Los antibióticos derivados de actinobacterias que son importantes en medicina incluyen aminoglucósidos, antraciclinas, cloranfenicol, macrólidos, tetraciclinas, etc.
Las actinobacterias tienen un alto contenido de guanina y citosina en su ADN . [16] El contenido de G + C de Actinobacteria puede ser tan alto como 70%, aunque algunas pueden tener un bajo contenido de G + C. [17]
Se ha sugerido el análisis de la secuencia de glutamina sintetasa para el análisis filogenético de Actinobacteria. [18]
Filogenia
La filogenia se basa en la liberación 123 de LTP basada en ARNr 16S del proyecto 'The All-Species Living Tree' . [19]
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Taxonomía
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) [20] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [21]
- Especie " Cathayosporangium alboflavum " ♠ Runmao et al . 1995
- Especie " Candidatus Planktophila limnetica " Jezbera et al . 2009
- Especie " Tonsillophilus suis " ♠ Azuma y Bak 1980
- Clase Rubrobacteria Suzuki 2013 ( Rubrobacteridae Rainey et al . 1997 enmienda. Zhi et al . 2009 )
- Orden Rubrobacterales Rainey et al . 1997 enmienda. Zhi y col . 2009
- Familia Rubrobacteraceae Rainey et al. 1997
- Orden Rubrobacterales Rainey et al . 1997 enmienda. Zhi y col . 2009
- Clase Thermoleophilia Suzuki & Whitman 2013 ( Thermoleophilidae )
- Solicite Gaiellales Albuquerque et al . 2012
- Familia Gaiellaceae Albuquerque et al. 2012
- Orden Thermoleophilales Reddy & Garcia-Pichel 2009
- Familia Thermoleophilaceae Stackebrandt 2005 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009
- Orden Solirubrobacterales Reddy & Garcia-Pichel 2009
- Familia Conexibacteraceae Stackebrandt 2005 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009
- Familia Patulibacteraceae Takahashi et al. 2006 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009
- Familia Solirubrobacteraceae Stackebrandt 2005 emend. Zhi y col. 2009
- Solicite Gaiellales Albuquerque et al . 2012
- Clase Coriobacteriia Konig 2013 enmienda. Gupta y col. 2013 ( Coriobacteridae Stackebrandt et al . 1997 enmienda. Zhi et al . 2009 )
- Orden Coriobacteriales Stackebrandt et al . 1997 enmienda. Gupta y col. 2013
- Familia Atopobiaceae Gupta et al. 2013
- Familia Coriobacteriaceae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009
- Solicite Eggerthellales Gupta et al. 2013
- Familia Eggerthellaceae Gupta et al. 2013
- Orden Coriobacteriales Stackebrandt et al . 1997 enmienda. Gupta y col. 2013
- Clase Acidimicrobiia Norris 2013 ( Acidimicrobidae Stackebrandt et al . 1997 enmienda. Zhi et al . 2009 )
- Orden Acidimicrobiales Stackebrandt et al . 1997 enmienda. Zhi y col . 2009 [Acidimicrobineae Garrity, Bell & Lilburn 2003 ]
- Familia Acidimicrobiaceae Stackebrandt et al. 1997 enmienda. Zhi y col. 2009
- Familia Iamiaceae Kurahashi et al. 2009
- Familia " Microthrixaceae " Joseph et al. 2003
- Orden Acidimicrobiales Stackebrandt et al . 1997 enmienda. Zhi y col . 2009 [Acidimicrobineae Garrity, Bell & Lilburn 2003 ]
- Clase Nitriliruptoria Ludwig et al. 2013 ( nitriliruptoridae Kurahashi et al . 2010 )
- Orden Egibacterales Zhang et al. 2016
- Familia Egibacteraceae Zhang et al. 2016
- Solicite Egicoccales Zhang et al. 2015
- Familia Egicoccaceae Zhang et al. 2015
- Solicite Euzebyales Kurahashi et al . 2010
- Familia Euzebyaceae Kurahashi et al. 2010
- Solicite Nitriliruptorales Sorokin et al . 2009
- Familia Nitriliruptoraceae Sorokin et al. 2009
- Orden Egibacterales Zhang et al. 2016
- Clase Actinobacteria Stackebrandt et al. 1997 ( Actinobacteridae Stackebrandt et al . 1997 enmienda. Zhi et al . 2009 )
- ¿Especies? " Boyliae praeputiale " ♠ Yates et al. 2002
- ¿Orden? " Actinomarinales " Ghai et al. 2013 ["Actinomarinidae" Ghai et al. 2013 ]
- Familia " Actinomarinaceae " Ghai et al. 2013
- Solicite Acidothermales Sen et al. 2014
- Familia Acidothermaceae Rainey, Ward-Rainey y Stackebrandt 1997 enmienda. Zhi y col. 2009
- Orden " Catenulisporales " Donadio et al. 2012 ( Catenulisporineae Cavaletti et al. 2006 enmienda. Zhi et al. 2009 )
- Familia Actinospicaceae Cavaletti et al. 2006 enmienda. Zhi y col. 2009
- Familia Catenulisporaceae Busti et al. 2006 enmienda. Zhi y col. 2009
- Orden " Streptomycetales " Kampfer 2012 ( Streptomycetineae Rainey et al. 1997 enmienda. Zhi et al. 2009 )
- Familia Streptomycetaceae Waksman & Henrici 1943 enmienda. Zhi y col. 2009
- Solicite Geodermatophilales Sen et al. 2014
- Familia Geodermatophilaceae Normand 2006 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009
- Orden Frankiales Sen et al. 2014 ( Frankineae Stackebrandt, Rainey y Ward-Rainey 1997 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009 )
- Familia Motilibacteraceae Lee 2013
- Familia Cryptosporangiaceae Zhi, Li y Stackebrandt 2009
- Familia Frankiaceae Becking 1970 enmienda. Zhi y col. 2009
- Familia Sporichthyaceae Rainey et al. 1997 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009
- Solicite Nakamurellales Sen et al. 2014
- Familia Nakamurellaceae Tao et al. 2004 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009 [Microsphaeraceae Rainey et al. 1997 ]
- Orden " Kineosporiales " Kampfer 2012 ( Kineosporineae Zhi, Li & Stackebrandt 2009 )
- Familia Kineosporiaceae Zhi, Li y Stackebrandt 2009
- Solicite Micrococcales Prevot 1940 [Arthrobacteria; Micrococcineae Stackebrandt y col. 1997 enmienda. Yassin y col. 2011 ; incl. Flavobacterium oceanosedimentum ; Bifidobacteriales Stackebrandt et al . 1997 enmienda. Zhi y col . 2009 ; Actinomycetales Buchanan 1917 enmienda. Zhi y col . 2009 ]
- Familia Intrasporangiaceae
- Familia Microbacteriaceae
- Familia Cellulomonadceae
- Familia Promicromonosporaceae
- Familia Sanguibacteraceae
- Familia Rarobacteraceae
- Familia Jonesiaceae
- Familia Bogoriellaceae
- Familia Beutenbergiaceae
- Familia Ruaniaceae
- Familia Actinomycetaceae
- Familia Demequinaceae
- Familia Dermabacteraceae
- Familia Brevibacteriaceae
- Familia Micrococcaceae {incl. Bifidobacteriaceae]])
- Orden " Propionibacteriales " Patrick & McDowell 2012 ( Propionibacterineae Rainey et al. 1997 enmienda. Zhi et al. 2009 )
- Familia Nocardioidaceae
- Familia Propionibacteriaceae
- Orden " Streptosporangiales " Goodfellow 2012 ( Streptosporangineae Ward-Rainey et al. 1997 enmienda. Zhi, Li & Stackebrandt 2009 )
- Familia Streptosporangiaceae
- Familia Nocardiopsaceae
- Familia Thermomonosporaceae
- Orden " Jiangellales " Tang et al. 2012 ( Jiangellineae Tang et al. 2011 )
- Familia Jiangellaceae Tang et al. 2011
- Orden " Glycomycetales " Labeda 2012 ( Glycomycetineae Rainey, Ward-Rainey y Stackebrandt 1997 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009 )
- Familia Glycomycetaceae Rainey, Ward-Rainey y Stackebrandt 1997 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009
- Orden " Micromonosporales " Genilloud 2012 ( Micromonosporineae Stackebrandt et al. 1997 enmienda. Zhi et al. 2009 ; Actinoplanales]
- Familia Micromonosporaceae
- Orden " Pseudonocardiales " Labeda & Goodfellow 2012 ( Pseudonocardineae Stackebrandt et al. 1997 enmienda. Labeda et al. 2011 )
- Familia Pseudonocardiaceae
- Orden " Corynebacteriales " Goodfellow & Jones 2012 ( Corynebacterineae Stackebrandt et al. 1997 enmienda. Zhi et al. 2009; Mycobacteria)
- Familia Segniliparaceae
- Familia Nocardiaceae [Gordoniaceae; Williamsiaceae]
- Familia Dietziaceae
- Familia Corynebacteriaceae
- Familia Tsukamurellaceae
- Familia Mycobacteriaceae
Notas:
♠ Cepas encontradas en el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) pero no incluidas en la Lista de nombres de procariotas con posición en la nomenclatura (LSPN)
Ver también
- Lista de microbiota bacteriana de la vaginosis
Referencias
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Otras lecturas
- Pandey, B .; Ghimire, P .; Agrawal, VP (12 al 15 de enero de 2004). Estudios sobre la actividad antibacteriana de los actinomicetos aislados de la región de Khumbu en Nepal (PDF) . Conferencia Internacional sobre el Gran Himalaya: Clima, Salud, Ecología, Manejo y Conservación. Katmandú. Archivado desde el original (PDF) el 10 de agosto de 2013.
- Baltz, RH (2005). "Descubrimiento de antibióticos a partir de actinomicetos: ¿seguirá un renacimiento el declive y la caída?". Noticias SIM . 55 : 186-196.
- Baltz, RH (2007). "Antimicrobianos de actinomicetos: Regreso al futuro" . Microbio . 2 (3): 125-131. Archivado desde el original el 31 de diciembre de 2013.
enlaces externos
- Base de datos del genoma de actinomicetos