En la década de 1920 aparecieron varios clubes en la localidad de Estella; El Club Deportivo Estellés, CD Iberia, Unión Deportiva Estellesa y CD La Estrella a los que se enfrentaron junto a soldados de las Órdenes Militares disputando torneos locales.
Finalmente aparece el CD Izarra. El club se funda el 6 de enero de 1924 y se une al resto de equipos en la disputa del torneo. En 1943 se produce su primer ascenso a la División Tercera . Después de varias décadas jugando entre división nacional y regional. Desde la temporada 1983/84 se consolida en tercera división, se obtiene un subcampeonato en 1984/85 y en 1989/90 es campeón del grupo y logra ascender a Segunda División B . Logró permanecer en Segunda División B durante 8 temporadas durante la década de los noventa. Desciende de nuevo a Tercera División en 1999/2000. Tras temporadas irregulares, consigue en dos ocasiones convertirse en campeón del grupo 15 de Tercera División. Desde la temporada 2009/10 vuelve a jugar en Segunda División B . Esa temporada no fue exitosa ya que el club terminó 18º y regresó a Tercera. [3]
Otro paso para la Segunda División B en 2012 y a partir de 2015 el equipo vuelve a situarse en la categoría de bronce del fútbol español durante seis temporadas consecutivas.
Nota: esta lista incluye jugadores que han jugado al menos 100 partidos de liga y / o han alcanzado el estatus internacional.
- Juan Arza (juvenil)
- Carlos Gurpegui (juvenil)
- Javi Martínez (juvenil)
- José Javier Basarte
- Enrique Jurío
- Jorge Barbarín
- Eugenio Bustingorri
| - Roberto Toledo
- José Javier Belloso
- Jorge Barrena
- Eduardo Conget
- José Javier Etxarri
- Sergio Valencia
- Iñaki Casado
| - Alex Guembe
- David Lizoain
- Alejandro Palacios
- Mikel Ziganda
- Ibai Ardanaz
- Samuel Piette
- Bruno Araiz
| - Pito Camacho
- Javier Briñol
- Alex Maestresalas
- Alex Cacho
- Juan Antonio Cabrera
- Eneko Martínez
- Alex Hinojosa
| - Aritz Eguaras
- Gorka Laborda
- Julio Iricibar
- Yoel Sola
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