De Wikipedia, la enciclopedia libre
Saltar a navegación Saltar a búsqueda
ADN polimerasa dirigida por ADN
ADN polimerasa.png
Estructura 3D de los motivos de hélice-giro-hélice de unión al ADN en la ADN polimerasa beta humana (basada en el archivo PDB 7ICG )
Identificadores
CE no.2.7.7.7
No CAS.9012-90-2
Bases de datos
IntEnzVista IntEnz
BRENDAEntrada BRENDA
FÁCILNiceZyme vista
KEGGEntrada KEGG
MetaCyccamino metabólico
PRIAMperfil
Estructuras PDBRCSB PDB PDBe PDBsum
Ontología de genesAmiGO / QuickGO
Buscar
PMCartículos
PubMedartículos
NCBIproteinas

Una ADN polimerasa es un miembro de una familia de enzimas que catalizan la síntesis de moléculas de ADN a partir de nucleósidos trifosfatos , los precursores moleculares del ADN. Estas enzimas son esenciales para la replicación del ADN y generalmente trabajan en grupos para crear dos dúplex de ADN idénticos a partir de un solo dúplex de ADN original. Durante este proceso, la ADN polimerasa "lee" las cadenas de ADN existentes para crear dos nuevas cadenas que coinciden con las existentes. [1] [2] [3] [4] [5] [6] Estas enzimas catalizan la reacción química

desoxinucleósido trifosfato + ADN n ⇌ pirofosfato + ADN n + 1 .

La ADN polimerasa agrega nucleótidos a los tres extremos primarios (3 ') de una hebra de ADN, un nucleótido a la vez. Cada vez que una célula se divide , se requieren ADN polimerasas para duplicar el ADN de la célula, de modo que se pueda pasar una copia de la molécula de ADN original a cada célula hija. De esta forma, la información genética se transmite de generación en generación.

Antes de que pueda tener lugar la replicación, una enzima llamada helicasa desenrolla la molécula de ADN de su forma de tejido apretado, rompiendo en el proceso los enlaces de hidrógeno entre las bases de nucleótidos . Esto abre o "descomprime" el ADN de doble hebra para dar dos hebras simples de ADN que pueden usarse como plantillas para la replicación en la reacción anterior.

Historia [ editar ]

En 1956, Arthur Kornberg y sus colegas descubrieron la ADN polimerasa I (Pol I) en Escherichia coli . Describieron el proceso de replicación del ADN mediante el cual la ADN polimerasa copia la secuencia de bases de una hebra de ADN molde. Posteriormente, Kornberg recibió el Premio Nobel de Fisiología o Medicina en 1959 por este trabajo. [7] La ADN polimerasa II fue descubierta por Thomas Kornberg (el hijo de Arthur Kornberg ) y Malcolm E. Gefter en 1970 mientras aclaraban aún más el papel de Pol I en la replicación del ADN de E. coli . [8] Se han encontrado tres ADN polimerasas más en E. coli , incluidasADN polimerasa III (descubierta en la década de 1970) y ADN polimerasas IV y V (descubiertas en 1999). [9]

Función [ editar ]

La ADN polimerasa se mueve a lo largo de la cadena vieja en la dirección 3'-5 ', creando una nueva cadena que tiene una dirección 5'-3'.
ADN polimerasa con capacidad de corrección de pruebas

La función principal de la ADN polimerasa es sintetizar ADN a partir de desoxirribonucleótidos , los componentes básicos del ADN. Las copias de ADN se crean mediante el emparejamiento de nucleótidos con bases presentes en cada hebra de la molécula de ADN original. Este emparejamiento siempre ocurre en combinaciones específicas, con citosina junto con guanina y timina junto con adenina , formando dos pares separados, respectivamente. Por el contrario, las ARN polimerasas sintetizan ARN a partir de ribonucleótidos de ARN o ADN.

Al sintetizar nuevo ADN, la ADN polimerasa puede agregar nucleótidos libres solo al extremo 3 ' de la hebra recién formada. Esto da como resultado el alargamiento de la hebra recién formada en una dirección de 5 'a 3'.

Es importante señalar que la direccionalidad de la hebra recién formada (la hebra hija) es opuesta a la dirección en la que la ADN polimerasa se mueve a lo largo de la hebra plantilla. Dado que la ADN polimerasa requiere un grupo OH 3 'libre para el inicio de la síntesis, se puede sintetizar en una sola dirección al extender el extremo 3' de la cadena de nucleótidos preexistente. Por tanto, la ADN polimerasa se mueve a lo largo de la hebra plantilla en una dirección 3'-5 'y la hebra hija se forma en una dirección 5'-3'. Esta diferencia permite que el ADN de doble hebra resultante formado esté compuesto por dos hebras de ADN que son antiparalelas entre sí.

La función de la ADN polimerasa no es del todo perfecta, ya que la enzima comete un error por cada mil millones de pares de bases copiados. La corrección de errores es una propiedad de algunas ADN polimerasas, pero no de todas. Este proceso corrige errores en el ADN recién sintetizado. Cuando se reconoce un par de bases incorrecto, la ADN polimerasa retrocede un par de bases de ADN. La actividad exonucleasa 3'-5 ' de la enzima permite eliminar el par de bases incorrecto (esta actividad se conoce como corrección de pruebas ). Después de la escisión de la base, la polimerasa puede volver a insertar la base correcta y la replicación puede continuar hacia adelante. Esto preserva la integridad de la cadena de ADN original que pasa a las células hijas.

La fidelidad es muy importante en la replicación del ADN. Los desajustes en el emparejamiento de bases de ADN pueden potencialmente resultar en proteínas disfuncionales y podrían conducir al cáncer. Muchas ADN polimerasas contienen un dominio de exonucleasa, que actúa en la detección de errores de emparejamiento de pares de bases y además actúa en la eliminación del nucleótido incorrecto para ser reemplazado por el correcto. [10]La forma y las interacciones que se adaptan al par de bases de Watson y Crick son las que contribuyen principalmente a la detección o al error. Los enlaces de hidrógeno juegan un papel clave en la unión e interacción de los pares de bases. Se dice que la pérdida de una interacción, que ocurre en un desajuste, desencadena un cambio en el equilibrio, para la unión de la plantilla-cebador, desde la polimerasa, al dominio exonucleasa. Además, la incorporación de un nucleótido incorrecto provoca un retraso en la polimerización del ADN. Este retraso da tiempo para que el ADN cambie del sitio de la polimerasa al sitio de la exonucleasa. Diferentes cambios conformacionales y pérdida de interacción ocurren en diferentes desajustes. En un desajuste purina: pirimidina hay un desplazamiento de la pirimidina hacia el surco mayor y la purina hacia el surco menor. Relativo a la forma de la ADN polimerasa 's bolsa de unión, se producen choques estéricos entre la purina y los residuos en el surco menor, y son importantesvan der Waals y las interacciones electrostáticas se pierden por la pirimidina. [11] Pirimidina: pirimidina y purina: los desajustes de purina presentan cambios menos notables ya que las bases se desplazan hacia el surco principal y se experimenta menos impedimento estérico. Sin embargo, aunque los diferentes desajustes dan como resultado diferentes propiedades estéricas, la ADN polimerasa todavía es capaz de detectarlos y diferenciarlos de manera tan uniforme y mantener la fidelidad en la replicación del ADN. [12] La polimerización del ADN también es fundamental para muchos procesos de mutagénesis y se emplea ampliamente en biotecnologías.

Estructura [ editar ]

Las ADN polimerasas conocidas tienen una estructura muy conservada, lo que significa que sus subunidades catalíticas generales varían muy poco de una especie a otra, independientemente de sus estructuras de dominio. Las estructuras conservadas suelen indicar funciones importantes e insustituibles de la célula, cuyo mantenimiento proporciona ventajas evolutivas. La forma se puede describir como una mano derecha con dominios de pulgar, dedo y palma. El dominio de la palma parece funcionar catalizando la transferencia de grupos fosforilo en la reacción de transferencia de fosforilo. El ADN se une a la palma cuando la enzima está activa. Se cree que esta reacción está catalizada por un mecanismo de iones de dos metales. El dominio de los dedos funciona para unir los nucleósidos trifosfatos.con la base de la plantilla. El dominio del pulgar juega un papel potencial en la procesividad, la translocación y el posicionamiento del ADN. [13]

Procesividad [ editar ]

La rápida catálisis de la ADN polimerasa se debe a su naturaleza procesiva. La procesividad es una característica de las enzimas que funcionan sobre sustratos poliméricos. En el caso de la ADN polimerasa, el grado de procesividad se refiere al número medio de nucleótidos añadidos cada vez que la enzima se une a una plantilla. La ADN polimerasa promedio requiere aproximadamente un segundo para localizar y unir una unión cebador / molde. Una vez que se une, una ADN polimerasa no procesadora agrega nucleótidos a una velocidad de un nucleótido por segundo. [14] : 207–208Sin embargo, las ADN polimerasas procesivas agregan múltiples nucleótidos por segundo, lo que aumenta drásticamente la tasa de síntesis de ADN. El grado de procesividad es directamente proporcional a la tasa de síntesis de ADN. La tasa de síntesis de ADN en una célula viva se determinó primero como la tasa de elongación del ADN del fago T4 en E. coli infectada con fagos . Durante el período de aumento exponencial del ADN a 37 ° C, la tasa fue de 749 nucleótidos por segundo. [15]

La capacidad de la ADN polimerasa para deslizarse a lo largo de la plantilla de ADN permite una mayor procesividad. Hay un aumento dramático en la procesividad en la bifurcación de replicación . Este aumento se ve facilitado por la asociación de la ADN polimerasa con proteínas conocidas como abrazadera deslizante de ADN . Las pinzas son múltiples subunidades de proteínas asociadas en forma de anillo. Usando la hidrólisis de ATP, una clase de proteínas conocidas como proteínas de carga de abrazadera deslizante abren la estructura de anillo de las abrazaderas deslizantes de ADN permitiendo la unión y liberación de la hebra de ADN. Interacción proteína-proteínacon la pinza evita que la ADN polimerasa se difunda desde la plantilla de ADN, lo que garantiza que la enzima se una a la misma unión cebador / plantilla y continúe la replicación. [14] : 207-208 La ADN polimerasa cambia de conformación, aumentando la afinidad por la pinza cuando se asocia con ella y disminuyendo la afinidad cuando completa la replicación de un tramo de ADN para permitir la liberación de la pinza.

Variación entre especies [ editar ]

Familia de ADN polimerasa A
c: par de o6-metil-guanina en la posición del par de bases de la polimerasa-2
Identificadores
SímboloDNA_pol_A
PfamPF00476
InterProIPR001098
INTELIGENTE-
PROSITEPDOC00412
SCOP21 ppp / SCOPe / SUPFAM
Estructuras proteicas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumresumen de estructura
Familia de ADN polimerasa B
estructura cristalina de rb69 gp43 en complejo con adn que contiene timina glicol
Identificadores
SímboloDNA_pol_B
PfamPF00136
Clan pfamCL0194
InterProIPR006134
PROSITEPDOC00107
SCOP21noy / SCOPe / SUPFAM
Estructuras proteicas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumresumen de estructura
ADN polimerasa tipo B, organelar y viral
polimerasa de adn phi29, forma cristalina ortorrómbica, complejo ssdna
Identificadores
SímboloDNA_pol_B_2
PfamPF03175
Clan pfamCL0194
InterProIPR004868
Estructuras proteicas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumresumen de estructura

Según la homología de secuencia, las ADN polimerasas se pueden subdividir en siete familias diferentes: A, B, C, D, X, Y y RT.

Algunos virus también codifican las ADN polimerasas especiales, tales como la Hepatitis B virus DNA polimerasa . Estos pueden replicar selectivamente el ADN viral a través de una variedad de mecanismos. Los retrovirus codifican una ADN polimerasa inusual llamada transcriptasa inversa , que es una ADN polimerasa dependiente de ARN (RdDp). Polimeriza el ADN a partir de una plantilla de ARN .

Familia [16]Tipos de ADN polimerasaTaxaEjemplos deCaracterística
APolimerasas replicativas y reparadorasEucariotas y ProcariotasT7 ADN polimerasa, Pol I, Pol γ, θ y νDos dominios de exonucleasa (3'-5 'y 5'-3')
BPolimerasas replicativas y reparadorasEucariotas y ProcariotasPol II, Pol B, Pol ζ, Pol α, δ y εExonucleasa 3'-5 (corrección de pruebas); los virales usan imprimación de proteínas
CPolimerasas replicativasProcariotaPol IIIExonucleasa 3'-5 (corrección de pruebas)
DPolimerasas replicativasEuryarchaeotaPolD (heterodímero DP1 / DP2) [17]Sin característica de "mano", similar a la polimerasa de ARN de doble barril ; Exonucleasa 3'-5 (corrección de pruebas)
XPolimerasas replicativas y reparadorasEucariotaPol β, Pol σ, Pol λ, Pol μ y desoxinucleotidil transferasa terminalplantilla opcional; 5 'fosfatasa (solo Pol β); característica de "mano" débil
YPolimerasas replicativas y reparadorasEucariotas y ProcariotasPol ι, Pol κ, Pol η, [18] Pol IV y Pol VSíntesis de translesión [19]
RTPolimerasas replicativas y reparadorasVirus, retrovirus y eucariotasTelomerasa , virus de la hepatitis BDependiente de ARN

Polimerasa procariota [ editar ]

Las polimerasas procariotas existen en dos formas: polimerasa central y holoenzima. La polimerasa central sintetiza ADN a partir de la plantilla de ADN, pero no puede iniciar la síntesis sola o con precisión. La holoenzima inicia la síntesis con precisión.

Pol I [ editar ]

Las polimerasas procariotas de la familia A incluyen la enzima ADN polimerasa I (Pol I), que está codificada por el gen polA y es ubicua entre los procariotas . Esta polimerasa reparadora participa en la reparación por escisión con actividad exonucleasa 3'-5 'y 5'-3' y en el procesamiento de los fragmentos de Okazaki generados durante la síntesis de la hebra retrasada. [20] Pol I es la polimerasa más abundante y representa> 95% de la actividad de la polimerasa en E. coli.; sin embargo, se han encontrado células que carecen de Pol I, lo que sugiere que la actividad de Pol I puede reemplazarse por las otras cuatro polimerasas. Pol I agrega ~ 15-20 nucleótidos por segundo, mostrando así una pobre procesividad. En cambio, Pol I comienza a agregar nucleótidos en el cebador de ARN: unión de plantilla conocida como el origen de replicación (ori). Aproximadamente 400 pb aguas abajo del origen, la holoenzima Pol III se ensambla y se hace cargo de la replicación a una velocidad y naturaleza altamente procesivas. [21]

La polimerasa Taq es una enzima termoestable de esta familia que carece de capacidad de corrección de pruebas. [22]

Pol II [ editar ]

La ADN polimerasa II es una polimerasa de la familia B codificada por el gen polB. Pol II tiene actividad de exonucleasa 3'-5 'y participa en la reparación del ADN , el reinicio de la replicación para evitar lesiones, y su presencia celular puede saltar de ~ 30-50 copias por célula a ~ 200-300 durante la inducción de SOS. También se cree que Pol II es una copia de seguridad de Pol III, ya que puede interactuar con proteínas holoenzimáticas y asumir un alto nivel de procesividad. Se cree que el papel principal de Pol II es la capacidad de dirigir la actividad de la polimerasa en la bifurcación de replicación y ayudar a detener los desajustes terminales de derivación de Pol III. [23]

La ADN polimerasa de Pfu es una enzima termoestable de esta familia que se encuentra en el arqueo hipertermofílico Pyrococcus furiosus . [24] Una clasificación detallada divide a la familia B de las arqueas en B1, B2, B3, en las que B2 es un grupo de pseudoenzimas . Pfu pertenece a la familia B3. Otros PolBs encontrados en arqueas son parte de "Casposons",transposones dependientes de Cas1 . [25] Algunos virus (incluida la ADN polimerasa Φ29 ) y los plásmidos mitocondriales también transportan polB. [26]

Pol III [ editar ]

La holoenzima de la ADN polimerasa III es la enzima principal involucrada en la replicación del ADN en E. coli y pertenece a las polimerasas de la familia C. Consta de tres conjuntos: el núcleo pol III, el factor de procesividad de la abrazadera deslizante beta y el complejo de carga de la abrazadera. El núcleo consta de tres subunidades: α, el centro de actividad de la polimerasa, ɛ, corrector de pruebas exonucleolítico y θ, que puede actuar como estabilizador de ɛ. El factor de procesividad de la abrazadera deslizante beta también está presente por duplicado, uno para cada núcleo, para crear una abrazadera que encierra el ADN, lo que permite una alta procesividad. [27] El tercer conjunto es un complejo cargador de pinzas de siete subunidades (τ2γδδ′χψ).

El viejo "modelo de trombón" del libro de texto describe un complejo de elongación con dos equivalentes de la enzima central en cada horquilla de replicación (RF), uno para cada hebra, el rezagado y el adelantado. [23] Sin embargo, evidencia reciente de estudios de una sola molécula indica un promedio de tres equivalentes estequiométricos de enzima central en cada RF tanto para Pol III como para su contraparte en B. subtilis, PolC. [28] La microscopía fluorescente en la célula ha revelado que la síntesis de la cadena principal puede no ser completamente continua, y Pol III * (es decir, las subunidades α, ε, τ, δ y χ de la holoenzima sin la abrazadera deslizante ß2) tiene una alta frecuencia de disociación de los RF activos. [29] En estos estudios, la tasa de rotación de la horquilla de replicación fue de aproximadamente 10 s para Pol III *, 47 s para la pinza deslizante ß2 y 15 m para la helicasa DnaB. Esto sugiere que la helicasa DnaB puede permanecer asociada de manera estable en los RF y servir como un punto de nucleación para la holoenzima competente. Los estudios in vitro de una sola molécula han demostrado que Pol III * tiene una alta tasa de renovación de RF cuando está en exceso, pero permanece asociada de manera estable con horquillas de replicación cuando la concentración es limitante. [29] Otro estudio de una sola molécula mostró que la actividad helicasa de DnaB y el alargamiento de la hebra pueden proceder con una cinética estocástica desacoplada. [29]

Pol IV [ editar ]

En E. coli , la ADN polimerasa IV (Pol IV) es una ADN polimerasa propensa a errores involucrada en mutagénesis no dirigida. [30] Pol IV es una polimerasa de la familia Y expresada por el gen dinB que se enciende mediante la inducción de SOS causada por polimerasas estancadas en la bifurcación de replicación. Durante la inducción de SOS, la producción de Pol IV se multiplica por diez y una de las funciones durante este tiempo es interferir con la procesividad de la holoenzima Pol III. Esto crea un punto de control, detiene la replicación y da tiempo para reparar las lesiones del ADN a través de la vía de reparación adecuada. [31] Otra función de Pol IV es realizar la síntesis de translesiones.en la bifurcación de replicación estancada como, por ejemplo, eludir los aductos de N2-desoxiguanina a un ritmo más rápido que atravesar el ADN no dañado. Las células que carecen del gen dinB tienen una mayor tasa de mutagénesis causada por agentes que dañan el ADN. [32]

Pol V [ editar ]

La ADN polimerasa V (Pol V) es una ADN polimerasa de la familia Y que participa en la respuesta SOS y en los mecanismos de reparación del ADN de la síntesis de translesión . [33] La transcripción de Pol V a través de los genes umuDC está altamente regulada para producir solo Pol V cuando el ADN dañado está presente en la célula, lo que genera una respuesta SOS. Las polimerasas estancadas hacen que RecA se una al ssDNA, lo que hace que la proteína LexA se digiera automáticamente. LexA pierde entonces su capacidad para reprimir la transcripción del operón umuDC. La misma nucleoproteína RecA-ssDNA modifica postraduccionalmente la proteína UmuD en proteína UmuD '. UmuD y UmuD 'forman un heterodímero que interactúa con UmuC, que a su vez activa la actividad catalítica de la polimerasa de umuC en el ADN dañado. [34]En E. coli, se ha propuesto un modelo de "cinturón de herramientas" de polimerasa para cambiar la pol III por la pol IV en una horquilla de replicación bloqueada, donde ambas polimerasas se unen simultáneamente a la pinza β. [35] Sin embargo, la participación de más de una polimerasa TLS trabajando en sucesión para evitar una lesión aún no se ha demostrado en E. coli. Además, Pol IV puede catalizar tanto la inserción como la extensión con alta eficiencia, mientras que pol V se considera la principal polimerasa SOS TLS. Un ejemplo es el desvío de la reticulación de guanina timina intracatenaria donde se demostró sobre la base de la diferencia en las firmas mutacionales de las dos polimerasas, que pol IV y pol V compiten por TLS de la reticulación intracatenaria. [35]

Familia D [ editar ]

En 1998, se descubrió la familia D de la ADN polimerasa en Pyrococcus furiosus y Methanococcus jannaschii . [36] El complejo PolD es un heterodímero de dos cadenas, cada una codificada por DP1 (corrección pequeña) y DP2 (catalítico grande). A diferencia de otras ADN polimerasas, la estructura y el mecanismo del núcleo catalítico DP2 se parecen a los de las ARN polimerasas de múltiples subunidades . La interfaz DP1-DP2 se parece a la del dedo de zinc de polimerasa eucariota de clase B y su pequeña subunidad. [17] DP1, una exonucleasa similar a Mre11 , [37] es probablemente el precursor de una pequeña subunidad de Pol α y ε, proporcionando capacidades de corrección de pruebas que ahora se pierden en los eucariotas. [25] Su dominio HSH N-terminal es similar a las proteínas AAA , especialmente la subunidad δ y RuvB de Pol III , en estructura. [38] DP2 tiene un dominio KH de Clase II . [17] Pyrococcus abyssi polD es más estable al calor y más preciso que la polimerasa Taq , pero aún no se ha comercializado. [39] Se ha propuesto que la ADN polimerasa de la familia D fue la primera en evolucionar en organismos celulares y que la polimerasa replicativa del Último Ancestro Celular Universal (LUCA) pertenecía a la familia D. [40]

ADN polimerasa eucariota [ editar ]

Polimerasas β, λ, σ, μ (beta, lambda, sigma, mu) y TdT [ editar ]

Las polimerasas de la familia X contienen la polimerasa eucariota pol β (beta) bien conocida , así como otras polimerasas eucariotas como Pol σ (sigma), Pol λ (lambda) , Pol μ (mu) y desoxinucleotidil transferasa terminal (TdT) . Las polimerasas de la familia X se encuentran principalmente en vertebrados y algunas se encuentran en plantas y hongos. Estas polimerasas tienen regiones altamente conservadas que incluyen dos motivos hélice-horquilla-hélice que son imperativos en las interacciones ADN-polimerasa. Un motivo está ubicado en el dominio de 8 kDa que interactúa con el ADN corriente abajo y un motivo está ubicado en el dominio del pulgar que interactúa con la cadena del cebador. Pol β, codificado por el gen POLB, es necesario para la reparación por escisión de la base de parche corto, una vía de reparación del ADN que es esencial para reparar bases alquiladas u oxidadas, así como sitios abásicos . Pol λ y Pol μ, codificados por los genes POLL y POLM respectivamente, están involucrados en la unión de extremos no homólogos , un mecanismo para volver a unir las roturas de doble cadena del ADN debido al peróxido de hidrógeno y la radiación ionizante, respectivamente. TdT se expresa sólo en tejido linfoide y añade "n nucleótidos" a las roturas de doble hebra formadas durante la recombinación V (D) J para promover la diversidad inmunológica. [41]

Polimerasas α, δ y ε (alfa, delta y épsilon) [ editar ]

Pol α (alfa) , Pol δ (delta) y Pol ε (épsilon) son miembros de las polimerasas de la familia B y son las principales polimerasas implicadas en la replicación del ADN nuclear. El complejo Pol α (complejo pol α-ADN primasa) consta de cuatro subunidades: la subunidad catalítica POLA1 , la subunidad reguladora POLA2 y las subunidades primasa pequeña y grande PRIM1 y PRIM2, respectivamente. Una vez que la primasa ha creado el cebador de ARN, Pol α comienza la replicación alargando el cebador con ~ 20 nucleótidos. [42] Debido a su alta procesividad, Pol δ se hace cargo de la síntesis de las cadenas principales y retrasadas de Pol α. [14] : 218–219Pol δ se expresa por los genes POLD1 , creando la subunidad catalítica, POLD2 , POLD3 y POLD4 creando las otras subunidades que interactúan con el antígeno nuclear de células proliferantes (PCNA), que es una abrazadera de ADN que permite que Pol δ posea procesividad. [43] Pol ε está codificado por el gen POLE1 , la subunidad catalítica, POLE2 y POLE3 . Se ha informado que la función de Pol ε es extender la cadena principal durante la replicación, [44] [45]mientras que Pol δ replica principalmente la hebra rezagada; sin embargo, la evidencia reciente sugirió que Pol δ también podría tener un papel en la replicación de la cadena principal de ADN. [46] Se cree que la región de la "reliquia de la polimerasa" del extremo C de Pol ε, a pesar de ser innecesaria para la actividad de la polimerasa, [47] es esencial para la vitalidad celular. Se cree que la región C-terminal proporciona un punto de control antes de entrar en anafase, proporciona estabilidad a la holoenzima y agrega proteínas a la holoenzima necesarias para el inicio de la replicación. [48] Pol ε tiene un dominio "palma" más grande que proporciona una alta procesividad independientemente del PCNA. [47]

En comparación con otras polimerasas de la familia B, la familia de exonucleasas DEDD responsable de la corrección de pruebas está inactivada en Pol α. [25] Pol ε es único porque tiene dos dominios con dedos de zinc y una copia inactiva de otra polimerasa de la familia B en su C-terminal. La presencia de este dedo de zinc tiene implicaciones en los orígenes de Eukaryota, que en este caso se coloca en el grupo Asgard con polimerasa archaeal B3. [49]

Polimerasas η, ι y κ (eta, iota y kappa) [ editar ]

Pol η (eta) , Pol ι (iota) y Pol κ (kappa), son ADN polimerasas de la familia Y implicadas en la reparación del ADN por síntesis de traducción y codificadas por los genes POLH, POLI y POLK, respectivamente. Los miembros de la familia Y tienen cinco motivos comunes para ayudar a unir el sustrato y el extremo del cebador y todos incluyen los dominios típicos del pulgar, la palma y el dedo de la mano derecha con dominios agregados como el dedo meñique (LF), el dominio asociado a la polimerasa (PAD) o muñeca. El sitio activo, sin embargo, difiere entre los miembros de la familia debido a las diferentes lesiones que se reparan. Las polimerasas de la familia Y son polimerasas de baja fidelidad, pero se ha demostrado que hacen más bien que mal, ya que las mutaciones que afectan a la polimerasa pueden causar diversas enfermedades, como cáncer de piel yVariante de Xeroderma Pigmentosum (XPS). La importancia de estas polimerasas se evidencia por el hecho de que el gen que codifica la ADN polimerasa η se denomina XPV, porque la pérdida de este gen da como resultado la variante Xeroderma Pigmentosum de la enfermedad. Pol η es particularmente importante para permitir una síntesis de translesión precisa del daño del ADN resultante de la radiación ultravioleta.. La funcionalidad de Pol κ no se comprende completamente, pero los investigadores han encontrado dos funciones probables. Se cree que Pol κ actúa como un extensor o un insertador de una base específica en ciertas lesiones del ADN. Las tres polimerasas de síntesis de translesión, junto con Rev1, se reclutan en las lesiones dañadas a través de ADN polimerasas replicativas estancadas. Hay dos vías de reparación de daños que llevan a los investigadores a concluir que la vía elegida depende de qué hebra contiene el daño, la hebra principal o la rezagada. [50]

Polimerasas Rev1 y ζ (zeta) [ editar ]

Pol, otra polimerasa de la familia B, está formada por dos subunidades Rev3 , la subunidad catalítica, y Rev7 ( MAD2L2 ), que aumenta la función catalítica de la polimerasa y participa en la síntesis de translesiones. Pol ζ carece de actividad exonucleasa 3 'a 5', es único porque puede extender cebadores con desajustes terminales. Rev1 tiene tres regiones de interés en el dominio BRCT , dominio de unión a ubiquitina, y el dominio C-terminal y tiene la capacidad de dCMP transferasa, que agrega lesiones opuestas de desoxicitidina que detendrían las polimerasas replicativas Pol δ y Pol ε. Estas polimerasas estancadas activan complejos de ubiquitina que a su vez disocian las polimerasas de replicación y reclutan Pol ζ y Rev1. Juntos, Pol ζ y Rev1 añaden desoxicitidina y Pol ζ se extiende más allá de la lesión. A través de un proceso aún indeterminado, Pol ζ se disocia y las polimerasas de replicación se reasocian y continúan la replicación. Pol ζ y Rev1 no son necesarios para la replicación, pero la pérdida del gen REV3 en la levadura en ciernes puede causar una mayor sensibilidad a los agentes que dañan el ADN debido al colapso de las horquillas de replicación donde las polimerasas de replicación se han estancado. [51]

Telomerasa [ editar ]

La telomerasa es una ribonucleoproteína que funciona para replicar los extremos de los cromosomas lineales, ya que la ADN polimerasa normal no puede replicar los extremos o los telómeros . El saliente 3 'monocatenario del cromosoma bicatenario con la secuencia 5'-TTAGGG-3' recluta telomerasa. La telomerasa actúa como otras ADN polimerasas al extender el extremo 3 ', pero, a diferencia de otras ADN polimerasas, la telomerasa no requiere una plantilla. La subunidad TERT, un ejemplo de transcriptasa inversa , utiliza la subunidad de ARN para formar la unión cebador-molde que permite que la telomerasa extienda el extremo 3 'de los extremos del cromosoma. Se cree que la disminución gradual del tamaño de los telómeros como resultado de muchas replicaciones a lo largo de la vida está asociada con los efectos del envejecimiento.[14] : 248–249

Polimerasas γ, θ y ν (gamma, theta y nu) [ editar ]

Más información: ADN polimerasa nu

Pol γ (gamma), Pol θ (theta) y Pol ν (nu) son polimerasas de la familia A. Durante mucho tiempo se pensó que Pol γ, codificada por el gen POLG , era la única polimerasa mitocondrial . Sin embargo, investigaciones recientes muestran que al menos Pol β (beta) , una polimerasa de la Familia X, también está presente en las mitocondrias. [52] [53] Cualquier mutación que conduzca a una Pol γ limitada o que no funcione tiene un efecto significativo sobre el ADNmt y es la causa más común de trastornos mitocondriales hereditarios autosómicos. [54] Pol γ contiene un dominio de polimerasa C-terminal y un dominio de exonucleasa 3'-5 'N-terminal que están conectados a través de la región enlazadora, que se une a la subunidad accesoria. La subunidad accesoria se une al ADN y es necesaria para la procesividad de Pol γ. La mutación puntual A467T en la región enlazadora es responsable de más de un tercio de todos los trastornos mitocondriales asociados con Pol γ. [55] Aunque muchos homólogos de Pol θ, codificados por POLQgen, se encuentran en eucariotas, su función no se comprende claramente. La secuencia de aminoácidos en el extremo C es lo que clasifica a Pol θ como polimerasa de la familia A, aunque la tasa de error de Pol θ está más estrechamente relacionada con las polimerasas de la familia Y. Pol θ extiende los extremos del cebador que no coinciden y puede eludir los sitios abásicos añadiendo un nucleótido. También tiene actividad desoxirribofosfodiesterasa (dRPasa) en el dominio de la polimerasa y puede mostrar actividad ATPasa muy cerca del ssDNA. [56] Pol ν (nu) se considera la menos eficaz de las enzimas polimerasas. [57] Sin embargo, la ADN polimerasa nu juega un papel activo en la reparación de la homología durante las respuestas celulares a los enlaces cruzados, cumpliendo su función en un complejo con helicasa.. [57]

Las plantas usan dos polimerasas de la familia A para copiar los genomas mitocrédico y plastidico. Son más similares a Pol I bacteriano que a Pol γ mamalliano. [58]

Transcriptasa inversa [ editar ]

Los retrovirus codifican una ADN polimerasa inusual llamada transcriptasa inversa , que es una ADN polimerasa dependiente de ARN (RdDp) que sintetiza ADN a partir de una plantilla de ARN. La familia de la transcriptasa inversa contiene tanto la funcionalidad de la ADN polimerasa como la funcionalidad de la ARNasa H, que degrada el ARN emparejado con el ADN. Un ejemplo de retrovirus es el VIH . [14] :La transcriptasa inversa se emplea comúnmente en la amplificación de ARN con fines de investigación. Usando una plantilla de ARN, la PCR puede utilizar la transcriptasa inversa, creando una plantilla de ADN. Esta nueva plantilla de ADN se puede utilizar para una amplificación típica por PCR. Los productos de tal experimento son, por tanto, productos de PCR amplificados a partir de ARN. [9]

Cada partícula de retrovirus del VIH contiene dos genomas de ARN , pero, después de una infección, cada virus genera solo un provirus . [59] Después de la infección, la transcripción inversa se acompaña de un cambio de plantilla entre las dos copias del genoma (recombinación por elección de copia). [59] De 5 a 14 eventos de recombinación por genoma ocurren en cada ciclo de replicación. [60] El cambio de plantilla (recombinación) parece ser necesario para mantener la integridad del genoma y como mecanismo de reparación para salvar los genomas dañados. [61] [59]

Bacteriófago T4 ADN polimerasa [ editar ]

El bacteriófago (fago) T4 codifica una ADN polimerasa que cataliza la síntesis de ADN en una dirección de 5 'a 3'. [62] La fago polimerasa también tiene una actividad exonucleasa que actúa en una dirección 3 'a 5', [63] y esta actividad se emplea en la corrección y edición de bases recién insertadas. [64] Se observó que un fago mutante con una ADN polimerasa sensible a la temperatura , cuando se cultivó a temperaturas permisivas, experimentó recombinación a frecuencias que son aproximadamente dos veces más altas que las del fago de tipo salvaje. [sesenta y cinco]

Se propuso que una alteración mutacional en la ADN polimerasa del fago puede estimular el cambio de cadena de molde (recombinación por elección de copia) durante la replicación . [sesenta y cinco]

Ver también [ editar ]

  • Máquinas biológicas
  • secuencia ADN
  • Catálisis enzimática
  • Recombinación genética
  • Clonación molecular
  • Reacción en cadena de la polimerasa
  • Dinámica del dominio de proteínas
  • Transcripción inversa
  • Polimerasa de ARN
  • Taq ADN polimerasa

Referencias [ editar ]

  1. ^ Bollum FJ (agosto de 1960). "Polimerasa de timo de ternera" . La Revista de Química Biológica . 235 (8): 2399–403. doi : 10.1016 / S0021-9258 (18) 64634-4 . PMID  13802334 .
  2. ^ Falaschi A, Kornberg A (abril de 1966). "Estudios bioquímicos de esporulación bacteriana. II. Ácido desoxirribonucleico polimerasa en esporas de Bacillus subtilis" . La Revista de Química Biológica . 241 (7): 1478–82. doi : 10.1016 / S0021-9258 (18) 96736-0 . PMID 4957767 . 
  3. ^ Lehman IR, Bessman MJ, Simms ES, Kornberg A (julio de 1958). "Síntesis enzimática de ácido desoxirribonucleico. I. Preparación de sustratos y purificación parcial de una enzima de Escherichia coli" . La Revista de Química Biológica . 233 (1): 163–70. doi : 10.1016 / S0021-9258 (19) 68048-8 . PMID 13563462 . 
  4. ^ Richardson CC, Schildkraut CL, Aposhian HV, Kornberg A (enero de 1964). "Síntesis enzimática del ácido desoxirribonucleico. XIV. Purificación adicional y propiedades del ácido desoxirribonucleico polimerasa de Escherichia coli " . La Revista de Química Biológica . 239 : 222–32. doi : 10.1016 / S0021-9258 (18) 51772-5 . PMID 14114848 . 
  5. ^ Schachman HK, Adler J, Radding CM, Lehman IR, Kornberg A (noviembre de 1960). "Síntesis enzimática de ácido desoxirribonucleico. VII. Síntesis de un polímero de desoxiadenilato y desoxitimidilato" . La Revista de Química Biológica . 235 (11): 3242–9. doi : 10.1016 / S0021-9258 (20) 81345-3 . PMID 13747134 . 
  6. ^ Zimmerman BK (mayo de 1966). "Purificación y propiedades de la polimerasa del ácido desoxirribonucleico de Micrococcus lysodeikticus" . La Revista de Química Biológica . 241 (9): 2035–41. doi : 10.1016 / S0021-9258 (18) 96662-7 . PMID 5946628 . 
  7. ^ "El Premio Nobel de Fisiología o Medicina 1959" . Fundación Nobel . Consultado el 1 de diciembre de 2012 .
  8. ^ Tessman I, Kennedy MA (febrero de 1994). "ADN polimerasa II de Escherichia coli en el bypass de sitios abásicos in vivo" . Genética . 136 (2): 439–48. doi : 10.1093 / genetics / 136.2.439 . PMC 1205799 . PMID 7908652 .  
  9. ↑ a b Lehninger AL, Cox MM, Nelson DL (2013). Principios de bioquímica de Lehninger (6ª ed.). Nueva York: WH Freeman and Company. ISBN 978-1-4292-3414-6. OCLC  824794893 .
  10. ^ Garrett G (2013). Bioquímica . Mary Finch.
  11. ^ Hunter WN, Brown T, Anand NN, Kennard O (1986). "Estructura de un par de bases de adenina-citosina en el ADN y sus implicaciones para la reparación de desajustes". Naturaleza . 320 (6062): 552–5. Código Bibliográfico : 1986Natur.320..552H . doi : 10.1038 / 320552a0 . PMID 3960137 . S2CID 4319887 .  
  12. ^ Swan MK, Johnson RE, Prakash L, Prakash S, Aggarwal AK (septiembre de 2009). "Base estructural de la síntesis de ADN de alta fidelidad por ADN polimerasa delta de levadura" . Naturaleza Biología Molecular y Estructural . 16 (9): 979–86. doi : 10.1038 / nsmb.1663 . PMC 3055789 . PMID 19718023 .  
  13. ^ Steitz TA (junio de 1999). "ADN polimerasas: diversidad estructural y mecanismos comunes" . La Revista de Química Biológica . 274 (25): 17395–8. doi : 10.1074 / jbc.274.25.17395 . PMID 10364165 . 
  14. ↑ a b c d e Losick R, Watson JD, Baker TA, Bell S, Gann A, Levine MW (2008). Biología molecular del gen (6ª ed.). San Francisco: Pearson / Benjamin Cummings. ISBN 978-0-8053-9592-1.
  15. ^ McCarthy D, Minner C, Bernstein H, Bernstein C (octubre de 1976). "Tasas de alargamiento del ADN y distribuciones de puntos de crecimiento del fago T4 de tipo salvaje y un mutante ámbar retardado en el ADN". Revista de Biología Molecular . 106 (4): 963–81. doi : 10.1016 / 0022-2836 (76) 90346-6 . PMID 789903 . 
  16. ^ Filée J, Forterre P, Sen-Lin T, Laurent J (junio de 2002). "Evolución de las familias de ADN polimerasa: evidencias de intercambio de genes múltiples entre proteínas celulares y virales" (PDF) . Revista de evolución molecular . 54 (6): 763–73. Código bibliográfico : 2002JMolE..54..763F . CiteSeerX 10.1.1.327.4738 . doi : 10.1007 / s00239-001-0078-x . PMID 12029358 . S2CID 15852365 .    
  17. ^ a b c Raia P, Carroni M, Henry E, Pehau-Arnaudet G, Brûlé S, Béguin P, Henneke G, Lindahl E, Delarue M, Sauguet L (enero de 2019). "Estructura del complejo DP1-DP2 PolD unido al ADN y sus implicaciones para la historia evolutiva de las polimerasas de ADN y ARN" . PLOS Biología . 17 (1): e3000122. doi : 10.1371 / journal.pbio.3000122 . PMC 6355029 . PMID 30657780 .  
  18. ^ Boehm EM, Powers KT, Kondratick CM, Spies M, Houtman JC, Washington MT (abril de 2016). "El motivo de la proteína de interacción del antígeno nuclear de células proliferantes (PCNA) (PIP) de la ADN polimerasa η media su interacción con el dominio C-terminal de Rev1" . La Revista de Química Biológica . 291 (16): 8735–44. doi : 10.1074 / jbc.M115.697938 . PMC 4861442 . PMID 26903512 .  
  19. ^ Yang W (mayo de 2014). "Una descripción general de las ADN polimerasas de la familia Y y un estudio de caso de la ADN polimerasa humana η" . Bioquímica . 53 (17): 2793–803. doi : 10.1021 / bi500019s . PMC 4018060 . PMID 24716551 .  
  20. ^ Maga G, Hubscher U, Spadari S, Villani G (2010). ADN polimerasas: descubrimiento, funciones de caracterización en transacciones de ADN celular . Compañía Editorial Científica Mundial. ISBN 978-981-4299-16-9.
  21. ^ Choi CH, Burton ZF, Usheva A (febrero de 2004). "Autoacetilación de factores de transcripción como mecanismo de control en la expresión génica" . Ciclo celular . 3 (2): 114–5. doi : 10.4161 / cc.3.2.651 . PMID 14712067 . 
  22. ^ Chien A, Edgar DB, Trela ​​JM (septiembre de 1976). "Polimerasa de ácido desoxirribonucleico del termófilo extremo Thermus aquaticus" . Revista de bacteriología . 127 (3): 1550–7. doi : 10.1128 / JB.127.3.1550-1557.1976 . PMC 232952 . PMID 8432 .  
  23. ↑ a b Banach-Orlowska M, Fijalkowska IJ, Schaaper RM, Jonczyk P (octubre de 2005). "ADN polimerasa II como factor de fidelidad en la síntesis de ADN cromosómico en Escherichia coli" . Microbiología molecular . 58 (1): 61–70. doi : 10.1111 / j.1365-2958.2005.04805.x . PMID 16164549 . S2CID 12002486 .  
  24. ^ Vista de proteína InterPro: P61875
  25. ↑ a b c Makarova KS, Krupovic M, Koonin EV (2014). "Evolución de las ADN polimerasas replicativas en arqueas y sus contribuciones a la maquinaria de replicación eucariota" . Fronteras en microbiología . 5 : 354. doi : 10.3389 / fmicb.2014.00354 . PMC 4104785 . PMID 25101062 .  
  26. ^ Rohe M, Schrage K, Meinhardt F (diciembre de 1991). "El plásmido lineal pMC3-2 de Morchella conica está estructuralmente relacionado con los adenovirus". Genética actual . 20 (6): 527–33. doi : 10.1007 / BF00334782 . PMID 1782679 . S2CID 35072924 .  
  27. ^ Olson MW, Dallmann HG, McHenry CS (diciembre de 1995). "Complejo DnaX de la holoenzima de la ADN polimerasa III de Escherichia coli. El complejo chi psi funciona aumentando la afinidad de tau y gamma por delta.delta 'a un rango fisiológicamente relevante" . La Revista de Química Biológica . 270 (49): 29570–7. doi : 10.1074 / jbc.270.49.29570 . PMID 7494000 . 
  28. ^ Liao Y, Li Y, Schroeder JW, Simmons LA, Biteen JS (diciembre de 2016). "Dinámica de ADN polimerasa de molécula única en un replisoma bacteriano en células vivas" . Revista biofísica . 111 (12): 2562-2569. Código bibliográfico : 2016BpJ ... 111.2562L . doi : 10.1016 / j.bpj.2016.11.006 . PMC 5192695 . PMID 28002733 .  
  29. ^ a b c Xu ZQ, Dixon NE (diciembre de 2018). "Replisomas bacterianos" . Opinión actual en biología estructural . 53 : 159-168. doi : 10.1016 / j.sbi.2018.09.006 . PMID 30292863 . 
  30. ^ Goodman MF (2002). "ADN polimerasas de reparación propensas a errores en procariotas y eucariotas". Revisión anual de bioquímica . 71 : 17–50. doi : 10.1146 / annurev.biochem.71.083101.124707 . PMID 12045089 . S2CID 1979429 .  
  31. ↑ Mori T, Nakamura T, Okazaki N, Furukohri A, Maki H, Akiyama MT (2012). "Escherichia coli DinB inhibe la progresión de la horquilla de replicación sin inducir significativamente la respuesta SOS" . Genes y sistemas genéticos . 87 (2): 75–87. doi : 10.1266 / ggs.87.75 . PMID 22820381 . 
  32. ^ Jarosz DF, Godoy VG, Walker GC (abril de 2007). "Bypass competente y preciso de las lesiones persistentes del ADN por ADN polimerasas DinB" . Ciclo celular . 6 (7): 817–22. doi : 10.4161 / cc.6.7.4065 . PMID 17377496 . 
  33. ^ Patel M, Jiang Q, Woodgate R, Cox MM, Goodman MF (junio de 2010). "Un nuevo modelo de mutagénesis inducida por SOS: cómo la proteína RecA activa la ADN polimerasa V" . Revisiones críticas en bioquímica y biología molecular . 45 (3): 171–84. doi : 10.3109 / 10409238.2010.480968 . PMC 2874081 . PMID 20441441 .  
  34. ^ Sutton MD, Walker GC (julio de 2001). "Manejo de ADN polimerasas: coordinación de la replicación del ADN, reparación del ADN y recombinación del ADN" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 98 (15): 8342–9. Código Bibliográfico : 2001PNAS ... 98.8342S . doi : 10.1073 / pnas.111036998 . PMC 37441 . PMID 11459973 .  
  35. ↑ a b Raychaudhury P, Basu AK (marzo de 2011). "Requisito genético para la mutagénesis de la reticulación de G [8,5-Me] T en Escherichia coli: las ADN polimerasas IV y V compiten por el bypass propenso a errores" . Bioquímica . 50 (12): 2330–8. doi : 10.1021 / bi102064z . PMC 3062377 . PMID 21302943 .  
  36. ^ Ishino Y, Komori K, Cann IK, Koga Y (abril de 1998). "Una nueva familia de ADN polimerasa encontrada en Archaea" . Revista de bacteriología . 180 (8): 2232–6. doi : 10.1128 / JB.180.8.2232-2236.1998 . PMC 107154 . PMID 9555910 .  
  37. ^ Sauguet L, Raia P, Henneke G, Delarue M (2016). "Arquitectura de sitio activo compartido entre Archaeal PolD y polimerasas de ARN de múltiples subunidades reveladas por cristalografía de rayos X" . Comunicaciones de la naturaleza . 7 : 12227. Bibcode : 2016NatCo ... 712227S . doi : 10.1038 / ncomms12227 . PMC 4996933 . PMID 27548043 .  
  38. ^ Yamasaki K, Urushibata Y, Yamasaki T, Arisaka F, Matsui I (agosto de 2010). "La estructura de la solución del dominio N-terminal de la subunidad pequeña de la polimerasa de ADN de la familia D de arqueas revela una relación evolutiva con las polimerasas de la familia B eucariotas" . Cartas FEBS . 584 (15): 3370–5. doi : 10.1016 / j.febslet.2010.06.026 . PMID 20598295 . S2CID 11229530 .  
  39. ^ Ishino S, Ishino Y (2014). "ADN polimerasas como reactivos útiles para la biotecnología - la historia de la investigación del desarrollo en el campo" . Fronteras en microbiología . 5 : 465. doi : 10.3389 / fmicb.2014.00465 . PMC 4148896 . PMID 25221550 .  
  40. ^ Koonin EV, Krupovic M, Ishino S, Ishino Y (junio de 2020). "La maquinaria de replicación de LUCA: origen común de la replicación y transcripción del ADN" . Biología BMC . 18 (1): 61. doi : 10.1186 / s12915-020-00800-9 . PMC 7281927 . PMID 32517760 .  
  41. ^ Yamtich J, Sweasy JB (mayo de 2010). "Familia de ADN polimerasa X: función, estructura y roles celulares" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteínas y proteómica . 1804 (5): 1136–50. doi : 10.1016 / j.bbapap.2009.07.008 . PMC 2846199 . PMID 19631767 .  
  42. ↑ Chansky ML, Marks A, Peet A (2012). Bioquímica médica básica de Marks: un enfoque clínico (4ª ed.). Filadelfia: Wolter Kluwer Health / Lippincott Williams & Wilkins. pag. capítulo 13. ISBN 978-1608315727.
  43. ^ Chung DW, Zhang JA, Tan CK, Davie EW, So AG, Downey KM (diciembre de 1991). "Estructura primaria de la subunidad catalítica del delta de la ADN polimerasa humana y ubicación cromosómica del gen" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 88 (24): 11197–201. Código Bibliográfico : 1991PNAS ... 8811197C . doi : 10.1073 / pnas.88.24.11197 . PMC 53101 . PMID 1722322 .  
  44. ^ Pursell ZF, Isoz I, Lundström EB, Johansson E, Kunkel TA (julio de 2007). "Épsilon de la ADN polimerasa de levadura participa en la replicación del ADN de la cadena principal" . Ciencia . 317 (5834): 127–30. Código Bibliográfico : 2007Sci ... 317..127P . doi : 10.1126 / science.1144067 . PMC 2233713 . PMID 17615360 .  
  45. ^ Lujan SA, Williams JS, Kunkel TA (septiembre de 2016). "Las ADN polimerasas dividen el trabajo de replicación del genoma" . Tendencias en biología celular . 26 (9): 640–654. doi : 10.1016 / j.tcb.2016.04.012 . PMC 4993630 . PMID 27262731 .  
  46. ^ Johnson RE, Klassen R, Prakash L, Prakash S (julio de 2015). "Un papel principal de la ADN polimerasa δ en la replicación de las hebras de ADN principales y rezagadas" . Célula molecular . 59 (2): 163-175. doi : 10.1016 / j.molcel.2015.05.038 . PMC 4517859 . PMID 26145172 .  
  47. ↑ a b Doublié S, Zahn KE (2014). "Conocimientos estructurales sobre la replicación del ADN eucariota" . Fronteras en microbiología . 5 : 444. doi : 10.3389 / fmicb.2014.00444 . PMC 4142720 . PMID 25202305 .  
  48. ^ Edwards S, Li CM, Levy DL, Brown J, Snow PM, Campbell JL (abril de 2003). "Saccharomyces cerevisiae ADN polimerasa épsilon y polimerasa sigma interactúan física y funcionalmente, lo que sugiere un papel para la polimerasa épsilon en la cohesión de la cromátida hermana" . Biología Molecular y Celular . 23 (8): 2733–48. doi : 10.1128 / mcb.23.8.2733-2748.2003 . PMC 152548 . PMID 12665575 .  
  49. ^ Zaremba-Niedzwiedzka K, Caceres EF, Saw JH, Bäckström D, Juzokaite L, Vancaester E, Seitz KW, Anantharaman K, Starnawski P, Kjeldsen KU, Stott MB, Nunoura T, Banfield JF, Schramm A, Baker BJ, Spang A , Ettema TJ (enero de 2017). "Asgard archaea iluminar el origen de la complejidad celular eucariota" . Naturaleza . 541 (7637): 353–358. Código Bib : 2017Natur.541..353Z . doi : 10.1038 / nature21031 . OSTI 1580084 . PMID 28077874 . S2CID 4458094 .   
  50. ^ Ohmori H, Hanafusa T, Ohashi E, Vaziri C (2009). Funciones separadas de regiones estructuradas y no estructuradas de ADN polimerasas Y-familia . Avances en química de proteínas y biología estructural. 78 . págs. 99-146. doi : 10.1016 / S1876-1623 (08) 78004-0 . ISBN 9780123748270. PMC  3103052 . PMID  20663485 .
  51. ^ Gan GN, Wittschieben JP, Wittschieben BØ, Wood RD (enero de 2008). "ADN polimerasa zeta (pol zeta) en eucariotas superiores" . Investigación celular . 18 (1): 174–83. doi : 10.1038 / cr.2007.117 . PMID 18157155 . 
  52. ^ Bienstock R, Beard W, Wilson S (agosto de 2014). "Análisis filogenético y orígenes evolutivos de los miembros de la familia X de la ADN polimerasa" . Reparación de ADN . 22 : 77–88. doi : 10.1016 / j.dnarep.2014.07.003 . PMC 4260717 . PMID 25112931 .  
  53. ^ Prasad R, et al. (Octubre de 2017). "ADN polimerasa β: un eslabón perdido de la maquinaria de reparación de escisión de base en mitocondrias de mamíferos" . Reparación de ADN . 60 : 77–88. doi : 10.1016 / j.dnarep.2017.10.011 . PMC 5919216 . PMID 29100041 .  
  54. ^ Zhang L, Chan SS, Wolff DJ (julio de 2011). "Trastornos mitocondriales de la disfunción de la ADN polimerasa γ: del diagnóstico de patología anatómica a molecular" . Archivos de Patología y Medicina de Laboratorio . 135 (7): 925–34. doi : 10.1043 / 2010-0356-RAR.1 (inactivo 2021-01-17). PMC 3158670 . PMID 21732785 .  Mantenimiento de CS1: DOI inactivo a partir de enero de 2021 ( enlace )
  55. ^ Stumpf JD, Copeland WC (enero de 2011). "Enfermedad y replicación del ADN mitocondrial: conocimientos de las mutaciones de la ADN polimerasa γ" . Ciencias de la vida celular y molecular . 68 (2): 219–33. doi : 10.1007 / s00018-010-0530-4 . PMC 3046768 . PMID 20927567 .  
  56. ^ Hogg M, Sauer-Eriksson AE, Johansson E (marzo de 2012). "Síntesis de ADN promiscuo por ADN polimerasa humana θ" . Investigación de ácidos nucleicos . 40 (6): 2611-22. doi : 10.1093 / nar / gkr1102 . PMC 3315306 . PMID 22135286 .  
  57. ^ a b "UniProtKB - Q7Z5Q5 (DPOLN_HUMAN)" . Uniprot . Consultado el 5 de julio de 2018 .
  58. ^ Cupp JD, Nielsen BL (noviembre de 2014). "Minireview: replicación del ADN en mitocondrias de plantas" . Mitocondria . 19 Pt B: 231–7. doi : 10.1016 / j.mito.2014.03.008 . PMC 417701 . PMID 24681310 .  
  59. ^ a b c Rawson JM, Nikolaitchik OA, Keele BF, Pathak VK, Hu WS (noviembre de 2018). "La recombinación es necesaria para la replicación eficaz del VIH-1 y el mantenimiento de la integridad del genoma viral" . Investigación de ácidos nucleicos . 46 (20): 10535-10545. doi : 10.1093 / nar / gky910 . PMC 6237782 . PMID 30307534 .  
  60. ^ Cromer D, Grimm AJ, Schlub TE, Mak J, Davenport MP (enero de 2016). "Estimación de la tasa de recombinación y cambio de plantilla de VIH in vivo". AIDS (Londres, Inglaterra) . 30 (2): 185–92. doi : 10.1097 / QAD.0000000000000936 . PMID 26691546 . S2CID 20086739 .  
  61. ^ Hu WS, Temin HM (noviembre de 1990). "Recombinación retroviral y transcripción inversa". Ciencia . 250 (4985): 1227–33. Código Bibliográfico : 1990Sci ... 250.1227H . doi : 10.1126 / science.1700865 . PMID 1700865 . 
  62. ^ Goulian M, Lucas ZJ, Kornberg A. Síntesis enzimática de ácido desoxirribonucleico. XXV. Purificación y propiedades de la polimerasa de ácido desoxirribonucleico inducida por infección con fago T4. J Biol Chem. 10 de febrero de 1968; 243 (3): 627-38. PMID 4866523 . 
  63. ^ Huang WM, Lehman IR (mayo de 1972). "Sobre la actividad exonucleasa del fago T4 ácido desoxirribonucleico polimerasa" . La Revista de Química Biológica . 247 (10): 3139–46. doi : 10.1016 / S0021-9258 (19) 45224-1 . PMID 4554914 . 
  64. ^ Gillin FD, Nossal NG (septiembre de 1976). "Control de la frecuencia de mutación por la ADN polimerasa del bacteriófago T4. I. La ADN polimerasa antimutador CB120 es defectuosa en el desplazamiento de la hebra" . La Revista de Química Biológica . 251 (17): 5219–24. doi : 10.1016 / S0021-9258 (17) 33149-6 . PMID 956182 . 
  65. ↑ a b Bernstein H (agosto de 1967). "El efecto sobre la recombinación de defectos mutacionales en la ADN-polimerasa y desoxicitidilato hidroximetilasa del fago T4D" . Genética . 56 (4): 755–69. doi : 10.1093 / genetics / 56.4.755 . PMC 1211652 . PMID 6061665 .  

Lectura adicional [ editar ]

  • Hamburguesas PM, Koonin EV, Bruford E, Blanco L, Burtis KC, Christman MF, Copeland WC, Friedberg EC, Hanaoka F, Hinkle DC, Lawrence CW, Nakanishi M, Ohmori H, Prakash L, Prakash S, Reynaud CA, Sugino A , Todo T, Wang Z, Weill JC, Woodgate R (noviembre de 2001). "ADN polimerasas eucariotas: propuesta de nomenclatura revisada" . La Revista de Química Biológica . 276 (47): 43487–90. doi : 10.1074 / jbc.R100056200 . PMID  11579108 .

Enlaces externos [ editar ]

  • ADN + polimerasas en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  • PDB Molécula del Mes ADN polimerasa
  • Mecanismo de reparación inusual en la ADN polimerasa lambda , Universidad Estatal de Ohio , 25 de julio de 2006.
  • Una gran animación de la ADN polimerasa de WEHI en 1:45 minutos en
  • Estructuras macromoleculares 3D de la ADN polimerasa del EM Data Bank (EMDB)