La genotipificación es el proceso de determinar diferencias en la composición genética ( genotipo ) de un individuo examinando la secuencia de ADN del individuo mediante ensayos biológicos y comparándola con la secuencia de otro individuo o una secuencia de referencia. Revela los alelos que un individuo ha heredado de sus padres. [1] Tradicionalmente, el genotipado es el uso de secuencias de ADN para definir poblaciones biológicas mediante el uso de herramientas moleculares. Por lo general, no implica definir los genes de un individuo.
Los métodos actuales de genotipado incluyen identificación de polimorfismo de longitud de fragmento de restricción (RFLPI) de ADN genómico, detección polimórfica amplificada aleatoria (RAPD) de ADN genómico, detección de polimorfismo de longitud de fragmento amplificado (AFLPD), reacción en cadena de la polimerasa (PCR), secuenciación de ADN , oligonucleótido específico de alelo (ASO) e hibridación con microarrays de ADNo perlas. La genotipificación es importante en la investigación de genes y variantes de genes asociados con enfermedades. Debido a las limitaciones tecnológicas actuales, casi todos los genotipos son parciales. Es decir, solo se determina una pequeña fracción del genotipo de un individuo, como con (epi) GBS ( Genotipado por secuenciación ) o RADseq . Las nuevas [2] tecnologías de secuenciación masiva prometen proporcionar genotipificación del genoma completo (o secuenciación del genoma completo ) en el futuro.
La genotipificación se aplica a una amplia gama de individuos, incluidos los microorganismos. Por ejemplo, los virus y las bacterias pueden genotiparse. La genotipificación en este contexto puede ayudar a controlar la propagación de patógenos, al rastrear el origen de los brotes. Esta área a menudo se conoce como epidemiología molecular o microbiología forense .
Los humanos también pueden genotiparse. Por ejemplo, al evaluar la paternidad o la maternidad, los científicos generalmente solo necesitan examinar 10 o 20 regiones genómicas (como el polimorfismo de un solo nucleótido (SNP)), que representan una pequeña fracción del genoma humano .
Al genotipar organismos transgénicos , una sola región genómica puede ser todo lo que necesita ser examinado para determinar el genotipo. Un único ensayo de PCR suele ser suficiente para genotipar un ratón transgénico ; el ratón es el modelo de mamífero elegido para gran parte de la investigación médica actual.
Ver también
Referencias
- ^ "Definición de genotipado" . NIH. 2011-09-21 . Consultado el 21 de septiembre de 2011 .
- ^ "Genotipado en Illumina, Inc" . Illumina.com. Archivado desde el original el 16 de abril de 2011 . Consultado el 4 de diciembre de 2010 .