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Este artículo trata sobre el haplogrupo de ADN Y humano. Para el haplogrupo de ADNmt humano, consulte Haplogrupo F (ADNmt) .
Haplogrupo F-M89
Haplogrupo F (ADN-Y) .PNG
Posible hora de origen57,500–62,500; (Raghavan 2014); [1]
45.000–55.700 AP (Karafet 2008); [2]
43,000–56,800 AP (Hammer & Zegura 2002). [3]
Posible lugar de origenAsia meridional [4] [5] [6] [7] o Asia sudoriental [8]
AntepasadoCF
DescendientesPrimario: F1 , F2 , F3 , GHIJK .
Definición de mutacionesM89 / PF2746, L132.1, M213 / P137 / Página 38, M235 / Página80, P14, P133, P134, P135, P136, P138, P139, P140, P141, P142, P145, P146, P148, P149, P151, P157, P158, P159, P160, P161, P163, P166, P187, P316

El haplogrupo F , también conocido como F-M89 y anteriormente como haplogrupo FT, es un haplogrupo del cromosoma Y muy común . El clado y sus subclados constituyen más del 90% de los linajes paternos fuera de África.

La gran mayoría de los machos individuales con F-M89 pertenecen a su descendiente directo Haplogroup GHIJK (F1329 / M3658 / PF2622 / YSC0001299). [9] además de GHIJK, el haplogrupo F tiene otros tres subclades descendientes inmediatos: F1 (P91 / P104), F2 (M427 / M428) y F3 (M481). Estos tres, con F * (M89 *), constituyen el paragrupo F (xGHIJK) . Se encuentran principalmente en el sur de Asia, el sudeste de Asia y partes del este de Asia.

El haplogrupo GHIJK se ramifica posteriormente en dos descendientes directos: G (M201 / PF2957) y HIJK (F929 / M578 / PF3494 / S6397). HIJK a su vez se divide en H (L901 / M2939) e IJK (F-L15). Los descendientes de la IJK haplogrupo incluyen los clados I , J , K , y, en última instancia, varios haplogrupos principales descienden de Haplogrupo K, a saber: haplogrupos M , N , O , P , Q , R , S , L , y T .

Orígenes [ editar ]

Se estima que el SNP M89 apareció hace 38,700-55,700 años, muy probablemente en el sur de Asia [2] [10] o en el sudeste asiático [11]. Investigaciones previas también sugirieron que el F-M89 apareció por primera vez en la Península Arábiga . Levante o África del Norte , hace unos 43.800–56.800 años. [3] La ubicación de la primera expansión de este linaje y el ascenso a la prevalencia parece haber sido en el subcontinente indio , o en algún lugar cercano a él, y la mayoría de los subclades y haplogrupos descendientes parecen haber irradiado hacia afuera desde el sur de Asia y / o partes vecinas. del Medio Orientey el sudeste de Asia .

Algunos linajes derivados del Haplogroup F-M89 parecen haber retrocedido a África desde el sur de Asia durante la prehistoria. Subclades de F-M89 asociados con este hipotético migración "Volver a África" incluyen J , R1b , y T .

Distribución [ editar ]

La gran mayoría de los individuos vivos que portan F-M89 pertenecen a subclades de GHIJK. En comparación, los casos del paragrupo F (xG, H, I, J, K), es decir, F * basal (M89) o los subclades primarios F1 (P91; P104), F2 (M427; M428) y F3 ( M481) - son relativamente raros en todo el mundo.

F (xG, H, I, J, K) [ editar ]

La falta de pruebas precisas de alta resolución en el pasado hace que sea difícil discutir F *, F1, F2 * y F3 * por separado. ISOGG afirma que F (xG, H, I, J, K) no ha sido bien estudiado, ocurre "con poca frecuencia" en poblaciones modernas y picos en el sur de Asia , especialmente Sri Lanka . [9] También parece haber estado presente durante mucho tiempo en el sudeste asiático . Sin embargo, la posibilidad de identificación errónea se considera relativamente alta y algunos casos pueden pertenecer a subclades identificados erróneamente del haplogrupo GHIJK. Este fue, por ejemplo, el caso del subclade Haplogroup H2 (P96), que originalmente se llamaba "F3", es decir, un nombre que desde entonces ha sido reasignado a F-M481.

Se ha informado de F (xF1, F2, F3) entre el 10% de los hombres en Sri Lanka, el 5,2% de los hombres en toda la India (incluido hasta el 10% de los hombres en el sur de la India), el 5% en Pakistán, así como niveles más bajos entre el pueblo Tamang (Nepal) y en Irán .

También se ha informado que los hombres originarios de Indonesia portan F (xG, H, I, J, K), especialmente F-M89 *, en niveles relativamente significativos. Se ha informado de tasas de 4-5% en Sulawesi y Lembata . Un estudio, que no examinó exhaustivamente otros subclades de F-M89 (incluidos algunos subclades de GHIJK), encontró que los hombres indonesios con el SNP P14 / PF2704 (que es equivalente a M89), comprenden el 1.8% de los hombres en Timor Occidental , 1,5% de Flores 5,4% de Lembata 2,3% de Sulawesi y 0,2% de Sumatra . [12] [13] F1 (P91), F2 (M427) y F3 (M481; anteriormente F5) son todos muy raros y prácticamente exclusivos de regiones / minorías étnicas en Sri Lanka, India, Nepal, sur de China , Tailandia , Birmania y Vietnam .

En Asia Central , se han informado ejemplos de F (xG, H, I, J, K) en personas de Turkmenistán y Uzbekistán . [14]

Kutanan y col. (2020) han encontrado F * -M89 en 50.0% (8/16) de una muestra de Red Lahu , 47.1% (8/17) de una muestra de Black Lahu, y 6.7% (1/15) de una muestra de Lisu en la provincia de Mae Hong Son de Tailandia. Se ha descubierto que todos estos miembros de habla loloish de F * -M89 en el noroeste de Tailandia están estrechamente relacionados en la línea paterna, con el TMRCA de su ADN-Y estimado en 584 años antes del presente. Sin embargo, los cromosomas Y mencionados anteriormente solo están relacionados de forma lejana con los casos de F * -M89 observados en muestras de otras poblaciones de Tailandia, incluido el 5,6% (1/18) de una muestra de Phuan de Tailandia central., 11,8% (2/17) de una muestra de Soa del noreste de Tailandia , y 29% (2/7) de una muestra de Saek del noreste de Tailandia . Se ha estimado que el TMRCA del grupo Loloish del norte de Tailandia y el ADN-Y del individuo Phuan del centro de Tailandia es de 12.675 años antes del presente. Se ha estimado que el TMRCA del grupo F * -M89 del noreste de Tailandia es de 6.492 años antes del presente. Se ha estimado que el TMRCA de todos estos individuos F * -M89 de Tailandia es de 16.006 años antes del presente. [15]

También hay evidencia de retromigración del Paleolítico hacia el oeste de F (xG, H, I, J, K) desde el sur de Asia, a Irán , Arabia y el noreste de África , [16] [17] así como al sureste de Europa . [18]

La migración neolítica a Europa desde el suroeste de Asia , por la primera ola de agricultores en Europa, se ha presentado como la fuente de F y G2a encontrada en restos neolíticos europeos , que datan de alrededor del 4000 a. C. Estos restos, según Herrerra et al. (2012) mostró una "mayor similitud genética" con "individuos del Cercano Oriente moderno" que con los europeos modernos. [19] F (xG, H, I, J, K) puede se han encontrado en la edad de bronce sigue siendo de Europa, es decir, los individuos conocidos como DEB 20 y DEB 38 , que vivió aproximadamente 7,000-7,210 BP, y se encontraron en el Sitio de Derenburg Meerenstieg II en Alemania. [20]

Se han encontrado tres casos menos ciertos, que no se han probado para todos los subclados de GHIJK, entre los restos neolíticos de Europa. I0411 ( Troc 4 ), que vivió entre 7.195 y 7.080 años antes de Cristo, fue encontrado en la cueva de Els Trocs , cerca de Bisaurri (España moderna), mientras que los haplogrupos G, I1 (I-M450; I-S247) J, L1b2, Q1b1, Q1a2a , R1a1a1 (R-L449), R1b1a2b1a (R-M35) y T fueron descartados, [20] I2a1b1 y R1b1a2 fueron encontrados en otros restos del mismo sitio ( Troc 5 y Troc 2 ). Del mismo modo, no se analizaron tres conjuntos de restos de Hungría para todos los subclados de GHIJK: BAM 17 , BAM 26 (ambos de Alsónyék Bátaszék, alrededor de 7.850-7.675 años AP) y TOLM 3 (7.030-7.230 AP, encontrado en Tolna-Mözs ). [20] (Un individuo conocido por los estudiosos como " Oase 1 ", que vivió alrededor de 37.800 años BP en Europa del Este, fue clasificada inicialmente como pertenecientes ya sea a paragrupo F (xGHIJK) o dentro de K . [18] Sin embargo, la investigación posterior ha demostrado que Oase 1 pertenecía a K2a * . [21] )

Algunos casos notificados entre las poblaciones modernas de europeos, nativos americanos e isleños del Pacífico pueden deberse a la migración y la mezcla de F (xG, H, I, J, K), como resultado del contacto con el sur y / o el sudeste de Asia, durante la era moderna temprana (siglos XVI-XIX). [9] Estos ejemplos incluyen:

  • niveles bajos en Polinesia ; [22]
  • algunos individuos entre los nativos americanos Seminole y Boruca ; [23]
  • casos raros en los Países Bajos ; [2]
  • dos casos en Portugal . [9]

F * (M89 *) [ editar ]

Se ha informado de F-M89 * basal entre el 5,2% de los hombres en la India. [10] Chiaroni et al (2009) proporcionaron un desglose regional: 10% en el sur de la India ; El 8% en la India central ; aproximadamente el 1,0% en el norte de la India y el oeste de la India , así como el 5% en Pakistán ; 10% en Sri Lanka ; > 4% entre la población Tamang de Nepal ; 2% en Borneo y Java ; 4-5% en Sulawesi y Lembata en el sudeste asiático . [12]

En Irán , se ha descubierto que el 2,3% de los machos Bandari de la provincia de Hormozgan son portadores de F-M89 basal. [dieciséis]

Haplogorup F * se ha encontrado en solo el 11,67% de los chinos Han de Yunnan analizados. [24] Xi'an (34/1, Kim 2011 ), [24]

Haplogrupo F-M89 también se ha observado en el noreste de África entre los dos período cristiano individuos, que fueron excavados en el Nilo 's cuarta catarata y en Meroe isla . [25] Los restos del individuo prehistórico F6-620 / AA7-738 de la cueva de Bacho-Kiro , del Paleolítico Superior Inicial , datado entre 45.930 y 42.580 años calibrados antes del presente, llevan también el linaje basal del haplogrupo F-M89 del cromosoma Y . [26]

F1 (P91) [ editar ]

Artículo principal: Haplogrupo F1 (Y-DNA)

Este subclade está definido por el SNP P91. Es más común en Sri Lanka . [2] [27]

F2 (M427) [ editar ]

Artículo principal: Haplogrupo F2 (Y-DNA)

Se han informado cromosomas Y F2 entre minorías de las zonas fronterizas del sur de China ( Yunnan y Guizhou ), Tailandia , Birmania y Vietnam , a saber, Yi y Kucong o Lahu Shi ("Lahu amarilla"), un subgrupo de Lahu . [28]

F3 (M481) [ editar ]

Artículo principal: Haplogrupo F3 (Y-DNA)

El subclade F3 recientemente definido y raro (M481; anteriormente F5) se ha encontrado en India y Nepal, entre el pueblo Tharu y en Andhra Pradesh . [29] F-M481 no debe confundirse con el haplogrupo H2 (L279, L281, L284, L285, L286, M282, P96), que anteriormente se clasificó erróneamente en F-M89, como "F3".

Haplogrupo GHIJK [ editar ]

Artículo principal: haplogrupo GHIJK

Nunca se ha encontrado GHIJK basal, ni en machos vivos ni en restos antiguos.

Los subclades, incluidos algunos de los principales haplogrupos, están muy extendidos en las poblaciones modernas del Cáucaso , Oriente Medio , Asia meridional , Europa , Asia sudoriental , las islas del Pacífico y los nativos americanos .

Filogenética [ editar ]

En la filogenia del cromosoma Y, los subclades son las ramas de los haplogrupos. Estos subclados también se definen por polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) o polimorfismos de eventos únicos (UEP).

Árboles filogenéticos [ editar ]

Hay varios árboles filogenéticos confirmados y propuestos disponibles para el haplogrupo F-M89. El científicamente aceptado es el Y-Chromosome Consortium (YCC) publicado en Karafet 2008 [2] y posteriormente actualizado. Thomas Krahn en el Centro de Investigación Genómica en Houston, Texas, proporciona un borrador del árbol que muestra la ciencia emergente . La Sociedad Internacional de Genealogía Genética (ISOGG) también proporciona un árbol de aficionados.

El borrador del árbol del Centro de Investigación Genómica [ editar ]

El proyecto de árbol del Centro de Investigación Genómica para el haplogrupo F-M89 es el siguiente. [30] (Solo se muestran los primeros tres niveles de subclades).

  • F-M89 P14, M89, M213, P133, P134, P135, P136, P138, P139, P140, P141, P142, P145, P146, P148, P149, P151, P157, P158, P159, P160, P161, P163, P166 , P187, P316, L132.1, L313, L498
    • F-P91 P91, P104
    • F-M427 M427, M428
    • F- P96 P96, M282, L279, L281, L284, L285, L286
      • F-L280 L280
    • G-M201 M201, P257, L116, L154, L204, L240, L269, L402, L605, L769, L770, L836, L837, L1258, U2, U3, U6, U7, U12, U17, U20, U21, U23, U33
    • H-M69 M69, M370, PAGES00049
    • IJK L15, L16

Árbol YCC / ISOGG [ editar ]

Este es el árbol científico oficial producido por el Y-Chromosome Consortium (YCC). La última actualización importante fue en 2008. [2] Las actualizaciones posteriores han sido trimestrales y bianuales. La versión actual es una revisión de la actualización de 2010. [ cita requerida ]

  • CF
    • F (L132.1, M89 / PF2746).
      • F1 (P91, P104)
      • F2 (M427, M428)
      • F3 (M481)
      • Macrohaplogrupo GHIJK (F1329 / M3658 / PF2622 / YSC0001299).

Historia filogenética [ editar ]

Artículo principal: Tabla de conversión para haplogrupos del cromosoma Y

Antes de 2002, había en la literatura académica al menos siete sistemas de nombres para el árbol filogenético del cromosoma Y. Esto provocó una confusión considerable. En 2002, los principales grupos de investigación se unieron y formaron el Y-Chromosome Consortium (YCC). Publicaron un artículo conjunto que creó un único árbol nuevo que todos aceptaron usar. Posteriormente, un grupo de científicos ciudadanos interesados ​​en la genética de poblaciones y la genealogía genética formó un grupo de trabajo para crear un árbol amateur con el objetivo de ser sobre todo oportuno. La siguiente tabla reúne todos estos trabajos en el punto del histórico YCC Tree 2002. Esto permite que un investigador que revisa la literatura publicada más antigua se mueva rápidamente entre las nomenclaturas.

YCC 2002/2008 (taquigrafía)(α)(β)(γ)(δ)(ε)(ζ)(η)YCC 2002 (mano a mano)YCC 2005 (mano a mano)YCC 2008 (mano a mano)YCC 2010r (mano a mano)ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
F-M892VI1R20Eu10H4BF*FFFFFFFFFF
F-APT / H-APT15VI1R20Eu10H4BF1H2H2H2H2H2H2H2H2H2H2

Ver también [ editar ]

Genética [ editar ]

  • Genética y arqueogenética del sur de Asia
  • Historia genética del Medio Oriente
  • Tabla de conversión para haplogrupos del cromosoma Y
  • Genealogía genética
  • Haplogrupo
  • Haplotipo
  • Haplogrupo de ADN del cromosoma Y humano
  • Filogenia molecular
  • Paragrupo
  • Subclade
  • Aaron cromosómico Y
  • Haplogrupos del cromosoma Y en poblaciones del mundo
  • Haplogrupos de ADN-Y por grupo étnico
  • Haplogrupos de ADN-Y en poblaciones del sur de Asia

Árbol de la columna vertebral [ editar ]

Árbol filogenético de haplogrupos de ADN del cromosoma Y humano [χ 1] [χ 2] Este artículo debe actualizarse . Actualice este artículo para reflejar los eventos recientes o la información disponible recientemente. ( Febrero de 2021 )
" Adán cromosómico Y "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BConnecticut
DelawareCF
DmiCF
F1 F2 F3 GHIJK
GRAMOHIJK
IJKH
IJK
I  J    LT  [χ 5]      K2  [χ 6]
L    T   K2a  [χ 7]       K2b  [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313  [χ 10]    K2b1  [χ 11]P  [χ 12]
NO  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
norteOQR
Y-DNA por población Haplogrupos de ADN-Y de personas históricas Notas al pie  ^ Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). "Ver la madera para los árboles: una filogenia de referencia mínima para el cromosoma Y humano". Mutación humana . 35 (2): 187–91. doi : 10.1002 / humu.22468 . PMID  24166809 . ^ Sociedad Internacional de Genealogía Genética (ISOGG; 2015), Y-DNA Haplogroup Tree 2015 . (Fecha de acceso: 1 de febrero de 2015.) ^ El haplogrupo A0-T también se conoce como A-L1085 (y anteriormente como A0'1'2'3'4). ^ El haplogrupo A1 también se conoce como A1'2'3'4. ^ Haplogroup LT (L298 / P326) también se conoce como Haplogroup K1. ^ Entre 2002 y 2008, Haplogroup T-M184 se conocía como "Haplogroup K2". Desde entonces, ese nombre ha sido reasignado a K-M526 , el hermano de Haplogroup LT. ↑ Haplogroup K2a (M2308) y su subclade primario K-M2313 se separaron del Haplogroup NO (F549) en 2016. (Esto siguió a la publicación de: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016). " Ráfagas puntuadas en demografía varón humano inferido a partir de secuencias del cromosoma Y 1244 en todo el mundo" . Nature Genetics . 48 (6): 593-9. doi : 10.1038 / ng.3559 . PMC 4.884.158 . PMID 27111036 .   En el pasado, otros haplogrupos, incluidos NO (M214) y K2e, también se habían identificado con el nombre "K2a". ^ Haplogroup K2b (M1221 / P331 / PF5911) también se conoce como Haplogroup MPS. ^ El haplogrupo K2e (K-M147) se conocía anteriormente como "Haplogrupo X" y "K2a" (pero es un subclade hermano del actual K2a). ^ K-M2313 *, que aún no tiene nombre filogenético, se ha documentado en dos individuos vivos, que tienen vínculos étnicos con la India y el sudeste asiático. Además, se ha encontrado K-Y28299, que parece ser una rama principal de K-M2313, en tres individuos vivos de la India. Ver: Poznik op. cit. ; YFull YTree v5.08 , 2017, "K-M2335" y; PhyloTree , 2017, "Detalles de los marcadores Y-SNP incluidos en el árbol Y mínimo" (Fecha de acceso a estas páginas: 9 de diciembre de 2017) ^ Haplogroup K2b1 (P397 / P399) también se conoce como Haplogroup MS, pero tiene una estructura interna más amplia y compleja. ^ El haplogrupo P (P295) también se conoce como K2b2. ^ Haplogroup S, a partir de 2017, también se conoce como K2b1a. (Anteriormente, el nombre Haplogroup S se asignaba a K2b1a4). ^ Haplogrupo M, a partir de 2017, también se conoce como K2b1b. (Anteriormente, el nombre Haplogroup M se asignaba a K2b1d).

Referencias [ editar ]

  1. ^ Tiempo estimado en que F se separó de C = 70.000–75.000 BP; tiempo estimado cuando G se separó de HIJK = 45.000-50.000 Raghavan, M .; et al. (2014). "El genoma siberiano del Paleolítico superior revela la ascendencia dual de los nativos americanos" . Naturaleza . 505 (7481): 87–91. Código Bibliográfico : 2014Natur.505 ... 87R . doi : 10.1038 / nature12736 . PMC 4105016 . PMID 24256729 .  
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  7. ^ Arunkumar et al 2012
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Enlaces externos [ editar ]

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