El ácido ribonucleico (ARN) se presenta en diferentes formas dentro de los organismos y cumple muchas funciones diferentes. Aquí se enumeran los tipos de ARN, agrupados por función. Se enumeran y explican las abreviaturas de los diferentes tipos de ARN.
Por rol
Tipo | Abbr. | Función | Distribución | Árbitro. |
---|---|---|---|---|
ARN mensajero | ARNm | Códigos de proteína | Todos los organismos | |
ARN ribosómico | ARNr | Traducción | Todos los organismos | |
RNA de partículas de reconocimiento de señales | ARN 7SL o ARN SRP | Integración de membranas | Todos los organismos | [1] |
Transferencia de ARN | ARNt | Traducción | Todos los organismos | |
ARN mensajero de transferencia | tmRNA | Rescatar ribosomas estancados | Bacterias | [2] |
Tipo | Abbr. | Función | Distribución | Árbitro. |
---|---|---|---|---|
ARN nuclear pequeño | snRNA | Empalme y otras funciones | Eucariotas y arqueas | [3] |
ARN nucleolar pequeño | snoRNA | Modificación de nucleótidos de ARN | Eucariotas y arqueas | [4] |
SmY ARN | SmY | empalme trans de ARNm | Nematodos | [5] |
ARN específico de cuerpo pequeño de Cajal | scaRNA | Tipo de snoRNA; Modificación de nucleótidos de ARN | ||
ARN guía | ARNg | modificación de nucleótidos de ARNm | kinetoplastid mitocondrias | [6] |
Ribonucleasa P | RNasa P | maduración del ARNt | Todos los organismos | [7] |
Ribonucleasa MRP | ARNasa MRP | Maduración de ARNr, replicación de ADN. | Eucariotas | [8] |
Y ARN | Procesamiento de ARN, replicación de ADN. | Animales | [9] | |
Componente de ARN de telomerasa | TERC | Síntesis de telómeros | La mayoría de eucariotas | [10] |
ARN líder empalmado | SL ARN | empalme trans de ARNm, procesamiento de ARN |
Tipo | Abbr. | Función | Distribución | Árbitro. |
---|---|---|---|---|
ARN antisentido | ARNa, ARN as | Atenuación transcripcional / degradación del ARNm / estabilización del ARNm / Bloque de traducción | Todos los organismos | [11] [12] |
Transcripción antisentido cis-natural | cis-NAT | Regulación genética | ||
ARN CRISPR | crRNA | Resistencia a los parásitos, al apuntar a su ADN. | Bacterias y arqueas | [13] |
ARN no codificante largo | lncRNA | Regulación de la transcripción genética, regulación epigenética. | Eucariotas | |
MicroARN | miARN | Regulación genética | La mayoría de eucariotas | [14] |
ARN que interactúa con Piwi | piRNA | Defensa de transposones, tal vez otras funciones | La mayoría de los animales | [15] [16] |
Pequeño ARN interferente | ARNip | Regulación genética | La mayoría de eucariotas | [17] |
ARN de horquilla corta | shRNA | Regulación genética | La mayoría de eucariotas | [18] |
ARNip de acción trans | tasiRNA | Regulación genética | Plantas de tierra | [19] |
Repetir ARNip asociado | rasiRNA | Tipo de piRNA; defensa de transposón | Drosophila | [20] |
ARN 7SK | 7SK | que regula negativamente el complejo CDK9 / ciclina T | ||
ARN potenciador | eRNA | Regulación genética | [21] |
Tipo | Función | Distribución | Árbitro. |
---|---|---|---|
Retrotransposón | Autopropagable | Eucariotas y algunas bacterias | [22] |
Genoma viral | Portador de información | Virus de ARN de doble hebra , virus de ARN de sentido positivo , virus de ARN de sentido negativo , muchos virus satélite y virus de transcripción inversa | |
Viroide | Autopropagable | Plantas infectadas | [23] |
ARN satélite | Autopropagable | Células infectadas |
Tipo | Abbr. | Función | Distribución | Árbitro. |
---|---|---|---|---|
ARN de la bóveda | ARNv, ARNtv | Expulsión de xenobióticos (conjeturado) | [24] |
Abreviaturas de ARN
Abbr. | Nombre | Familia | Descripción | Árbitro. |
---|---|---|---|---|
ncRNA | ARN no codificante | - | ||
nmRNA | ARN no mensajero | - | sinónimo de ncRNA | |
ARNs | pequeño ARN | - | sinónimo de ncRNA | |
smnRNA | pequeño ARN no mensajero | - | sinónimo de ncRNA | |
ARNt | transferir ARN | RF00005 | ||
ARNs | ARN soluble | - | sinónimo de tRNA | |
ARNm | ARN mensajero | - | ||
pcRNA | ARN codificante de proteínas | - | sinónimo de ARNm | |
ARNr | ARN ribosómico | varias familias | ||
ARNr 5S | ARN ribosómico 5S | RF00001 | ||
ARNr 5.8S | ARN ribosómico 5.8S | RF00002 | ||
ARNr de SSU | ARN ribosómico de subunidad pequeña | CL00111 | ||
ARNr de LSU | ARN ribosómico de subunidad grande | CL00112 | ||
ARN NoRC | ARN asociado al complejo de remodelación nucleolar | RF01518 | ||
ARNp | promotor de ARN | RF01518 | sinónimo de ARN NoRC | |
ARN 6S | ARN 6S | RF00013 | ||
ARN ssrS | RF00013 | sinónimo de ARN 6S | ||
ARNa | ARN antisentido | - | sinónimo de asRNA | |
asRNA | ARN antisentido | - | ||
asmiRNA | micro ARN antisentido | - | ||
cis-NAT | transcripción antisentido cis-natural | - | Transcripciones antisentido naturales transcritas del mismo locus genómico que su objetivo pero de la hebra de ADN opuesta y forman pares perfectos | |
crRNA | ARN CRISPR | - | ||
tracrRNA | ARNr trans-activador | - | ||
ARN CRISPR | ARN CRISPR-Cas | varias familias | ||
ARN DD | Respuesta al daño del ADN ARN | - | ARN que activa la respuesta al daño del ADN | |
diARN | ARN pequeños inducidos por DSB | - | ||
dsRNA | ARN bicatenario | - | ||
endo-siRNA | pequeño ARN interferente endógeno | - | ||
exARN | ARN extracelular | - | ||
ARNg | guía de ARN | - | ||
hc-siRNA | pequeño ARN de interferencia heterocromático | - | ||
hcsiRNA | pequeño ARN de interferencia heterocromático | - | sinónimo de hc-siRNA | |
hnRNA | ARN nuclear heterogéneo | - | sinónimo de pre-ARNm (en sentido estricto, puede incluir transcripciones de ARN nuclear que no terminan como ARNm citoplasmático) | |
ARNi | Interferencia de ARN | - | Proceso en el que el ARN inhibe la expresión o traducción de genes al neutralizar moléculas de ARNm diana | |
lincRNA | ARN no codificante intergénico largo | - | ||
lncRNA | ARN largo no codificante | - | ||
miARN | micro ARN | varias familias | ||
ARNm | ribonucleasa de procesamiento de ARN mitocondrial | - | sinónimo de RNase MRP | |
nat-siRNA | ARN interferente corto antisentido natural | - | sinónimo de natsiRNA | |
natsiRNA | ARN interferente corto antisentido natural | - | Reguladores de ARN endógenos, entre 21 y 24 nt de longitud, y se generan a partir de transcripciones de ARNm complementarias que se procesan posteriormente en ARNip | |
ARN OxyS | respuesta al estrés oxidativo ARN | RF00035 | Pequeño ARN no codificante que se induce en respuesta al estrés oxidativo en Escherichia coli | |
piRNA | ARN que interactúa con piwi | varias familias | Pequeños ARN que forman complejos ARN-proteína con proteínas piwi en células animales | |
qiRNA | ARN interferente de QDE-2 | - | ||
rasiRNA | Repetir ARNip asociado | - | ARN pequeño que participa en la vía de interferencia del ARN , un tipo de ARNpi | |
ARNasa MRP | ribonucleasa de procesamiento de ARN mitocondrial | RF00030 | ||
RNasa P | ribonucleasa P | RF00010 | Un tipo de ribonucleasa que escinde el ARN. | |
scaRNA | pequeño ARN específico del cuerpo de Cajal | RF00553 | ||
scnRNA | ARN de barrido pequeño | - | ||
ARNc | pequeño ARN citoplasmático | - | ||
ARNc | pequeño ARN condicional | - | ||
ARN SgrS | ARNs relacionado con el transporte de azúcar | RF00534 | Pequeño ARN que es activado por SgrR en Escherichia coli durante el estrés de glucosa-fosfato | |
shRNA | ARN de horquilla corta | - | ||
ARNip | pequeño ARN interferente | - | ||
SL ARN | ARN líder empalmado | varias familias | ||
SmY ARN | empalme trans de ARNm | RF01844 | Pequeños ARN nucleares encontrados en algunas especies de gusanos nematodos, que se cree que están involucrados en el empalme trans de ARNm | |
snoRNA | pequeño ARN nucleolar | varias familias | ||
snRNA | pequeño ARN nuclear | varias familias | ||
snRNP | pequeñas proteínas ribonucleicas nucleares | - | ||
ARN de SRP | ARN de partículas de reconocimiento de señales | CL00003 | ||
ssRNA | ARN monocatenario | - | ||
stRNA | pequeño ARN temporal | - | ||
tasiRNA | ARNip de acción trans | - | ||
tmRNA | ARN mensajero de transferencia | RF00023 | Molécula de ARN bacteriano con propiedades duales similares a ARNt y ARN mensajero | |
uARN | U ARN espliceosomal | varias familias | ||
ARNv | ARN de bóveda | - | sinónimo de vtRNA | |
vtRNA | ARN de bóveda | RF00006 | ||
ARN Xist | Transcripción específica X-inactiva | |||
Y ARN | Y ARN | RF00019 | Componentes de la partícula de ribonucleoproteína Ro60 y necesarios para la replicación del ADN a través de interacciones con cromatina y proteínas de iniciación. | |
NAT | transcripciones antisentido naturales | - | Transcripciones antisentido naturales codificadas dentro de una célula que tienen complementariedad de transcripciones con otras transcripciones de ARN | |
pre-ARNm | precursor de ARN mensajero | - | Cadena única inmadura de ARN mensajero | |
circRNA | ARN circular | - | ||
msRNA | ARN monocatenario multicopia | Componente de retrones | [25] | |
cfRNA | ARN libre de células |
Ver también
- ARN: tipos de ARN
- ARN no codificante
Referencias
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enlaces externos
- Base de datos Rfam : una colección de familias de ARN
- Base de datos europea de ARN ribosómico