De Wikipedia, la enciclopedia libre
  (Redirigido desde PMC (identificador) )
Saltar a navegación Saltar a búsqueda

PubMed Central ( PMC ) es un repositorio digital gratuito que archiva artículos académicos de texto completo de acceso abierto que se han publicado en revistas biomédicas y de ciencias de la vida . Como una de las principales bases de datos de investigación desarrolladas por el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), PubMed Central es más que un repositorio de documentos. Los envíos a PMC están indexados y formateados para mejorar los metadatos , la ontología médica y los identificadores únicos que enriquecen los datos estructurados XML de cada artículo. [1] El contenido dentro de PMC se puede vincular a otras bases de datos de NCBI y se puede acceder a través deEntrez sistemas de búsqueda y recuperación, mejorando aún más la capacidad del público para descubrir, leer y desarrollar su conocimiento biomédico. [2]

PubMed Central es distinto de PubMed . [3] PubMed Central es un archivo digital gratuito de artículos completos, accesible para cualquier persona desde cualquier lugar a través de un navegador web (con diversas disposiciones para su reutilización). Por el contrario, aunque PubMed es una base de datos en la que se pueden realizar búsquedas de citas y resúmenes biomédicos, el artículo de texto completo se encuentra en otro lugar (en forma impresa o en línea, gratis o detrás de un muro de pago para suscriptores ).

A diciembre de 2018 , el archivo de PMC contenía más de 5.2 millones de artículos, [4] con contribuciones provenientes de editores o autores que depositaban sus manuscritos en el repositorio de acuerdo con la Política de Acceso Público de los NIH . Los datos anteriores muestran que desde enero de 2013 hasta enero de 2014 los depósitos iniciados por los autores superaron los 103.000 artículos durante un período de 12 meses. [5] PMC identifica alrededor de 4.000 revistas que participan en alguna capacidad para depositar su contenido publicado en el repositorio de PMC. [6]Algunos editores retrasan la publicación de sus artículos en PubMed Central durante un tiempo determinado después de la publicación, lo que se conoce como "período de embargo", que va desde unos meses hasta unos años, según la revista. (Los embargos de seis a doce meses son los más comunes). PubMed Central es un ejemplo clave de "distribución externa sistemática por parte de un tercero" [7] que todavía está prohibida por los acuerdos de colaboración de muchos editores.

Adopción [ editar ]

Lanzado en febrero de 2000, el repositorio ha crecido rápidamente a medida que la Política de acceso público de los NIH está diseñada para hacer que todas las investigaciones financiadas por los Institutos Nacionales de Salud (NIH) sean de libre acceso para cualquier persona y, además, muchos editores están trabajando en cooperación con los NIH. para brindar acceso gratuito a sus obras. A fines de 2007, la Ley de Apropiaciones Consolidadas de 2008 (HR 2764) se convirtió en ley e incluyó una disposición que requiere que los NIH modifiquen sus políticas y requieran la inclusión en PubMed Central de copias electrónicas completas de sus investigaciones revisadas por pares y hallazgos de investigación. Estos artículos deben incluirse dentro de los 12 meses posteriores a su publicación. Esta es la primera vez que el gobierno de EE. UU. Solicita a una agencia que brinde acceso abiertoa la investigación y es una evolución de la política de 2005, en la que el NIH pidió a los investigadores que agreguen voluntariamente su investigación a PubMed Central. [8]

Una versión del Reino Unido del sistema PubMed Central, UK PubMed Central (UKPMC) , ha sido desarrollada por Wellcome Trust y la Biblioteca Británica como parte de un grupo de nueve financiadores de investigación del Reino Unido. Este sistema se puso en marcha en enero de 2007. El 1 de noviembre de 2012, se convirtió en Europe PubMed Central . El miembro canadiense de la red PubMed Central International, PubMed Central Canada , se lanzó en octubre de 2009.

El lenguaje de marcado de artículos de revistas "NLM Journal Publishing Tag Set" de la Biblioteca Nacional de Medicina está disponible gratuitamente. [9] La Association of Learned and Professional Society Publishers comenta que "es probable que se convierta en el estándar para la preparación de contenido académico tanto para libros como para revistas". [10] Una DTD relacionada está disponible para libros. [11] La Biblioteca del Congreso y la Biblioteca Británica han anunciado su apoyo a la NLM DTD. [12] También ha sido popular entre los proveedores de servicios de revistas. [13]

Con el lanzamiento de planes de acceso público para muchas agencias más allá de los NIH, PMC está en proceso de convertirse en el repositorio de una variedad más amplia de artículos. [14] Esto incluye contenido de la NASA, con la interfaz marcada como "PubSpace". [15] [16]

Tecnología [ editar ]

Los editores envían los artículos a PubMed Central en XML o SGML , utilizando una variedad de DTD de artículos . Los editores mayores y más grandes pueden tener sus propios DTD internos establecidos, pero muchos editores utilizan el DTD de publicación de revistas de NLM (ver arriba).

Los artículos recibidos se convierten a través de XSLT a la DTD de intercambio y archivado de NLM muy similar. Este proceso puede revelar errores que se informan al editor para su corrección. Los gráficos también se convierten a formatos y tamaños estándar. Los formularios originales y convertidos se archivan. El formulario convertido se mueve a una base de datos relacional, junto con los archivos asociados para gráficos, multimedia u otros datos asociados. Muchos editores también proporcionan PDF de sus artículos, y estos están disponibles sin cambios. [17]

Las citas bibliográficas se analizan y se vinculan automáticamente a los resúmenes relevantes en PubMed, los artículos en PubMed Central y los recursos en los sitios web de los editores. Los enlaces de PubMed también conducen a PubMed Central. Las referencias irresolubles, como las de revistas o artículos particulares que aún no están disponibles en una de estas fuentes, se registran en la base de datos y automáticamente se "activan" cuando los recursos están disponibles.

Un sistema de indexación interno proporciona capacidad de búsqueda y conoce la terminología biológica y médica , como nombres de medicamentos genéricos frente a patentados, y nombres alternativos para organismos, enfermedades y partes anatómicas.

Cuando un usuario accede a un número de una revista, se genera automáticamente una tabla de contenido al recuperar todos los artículos, cartas, editoriales, etc. de ese número. Cuando se llega a un elemento real, como un artículo, PubMed Central convierte el marcado NLM a HTML para su entrega y proporciona enlaces a objetos de datos relacionados. Esto es factible porque la variedad de datos entrantes se ha convertido primero a DTD estándar y formatos gráficos.

En un flujo de envío separado, los autores financiados por los NIH pueden depositar artículos en PubMed Central utilizando el envío de manuscritos de los NIH (NIHMS). Los artículos que se envían de este modo suelen pasar por un marcado XML para convertirse a NLM DTD.

Recepción [ editar ]

Las reacciones a PubMed Central entre la comunidad editorial académica oscilan entre el entusiasmo genuino de algunos, [18] y la preocupación cautelosa de otros. [19]

Si bien PMC es un socio bienvenido para los editores de acceso abierto en su capacidad de aumentar el descubrimiento y la difusión del conocimiento biomédico, esa misma verdad hace que otros se preocupen por el desvío del tráfico de la versión publicada del registro , las consecuencias económicas de menos lectores, también. como el efecto sobre el mantenimiento de una comunidad de académicos dentro de las sociedades científicas. [20] [21] Un análisis de 2013 encontró pruebas sólidas de que los repositorios públicos de artículos publicados eran responsables de "alejar a un número significativo de lectores de los sitios web de las revistas" y que "el efecto de PMC está creciendo con el tiempo". [22]

Bibliotecas, universidades, partidarios del acceso abierto, grupos de defensa de la salud del consumidor y organizaciones de derechos de los pacientes han aplaudido a PubMed Central y esperan ver repositorios de acceso público similares desarrollados por otras agencias de financiación federal para compartir libremente cualquier publicación de investigación que sea el resultado del apoyo de los contribuyentes. . [23]

El estudio de Antelman sobre publicaciones de acceso abierto encontró que en filosofía, ciencias políticas, ingeniería eléctrica y electrónica y matemáticas, los artículos de acceso abierto tenían un mayor impacto de investigación. [24] Un ensayo aleatorizado encontró un aumento en las descargas de contenido de artículos de acceso abierto, sin ventaja de citas sobre el acceso por suscripción un año después de la publicación. [25]

La política de los NIH y el trabajo del repositorio de acceso abierto han inspirado una directiva presidencial de 2013 que también ha provocado acciones en otras agencias federales.

En marzo de 2020, PubMed Central aceleró sus procedimientos de depósito para el texto completo de las publicaciones sobre coronavirus . El NLM lo hizo a pedido de la Oficina de Política Científica y Tecnológica de la Casa Blanca y de científicos internacionales para mejorar el acceso de científicos, proveedores de atención médica, innovadores de minería de datos , investigadores de atención médica de IA y el público en general. [26]

PMCID [ editar ]

El PMCID (identificador de PubMed Central), también conocido como el número de referencia de PMC, es un identificador bibliográfico para la base de datos de PubMed Central, al igual que el PMID es el identificador bibliográfico para la base de datos de PubMed . Sin embargo, los dos identificadores son distintos. Consiste en "PMC" seguido de una cadena de siete números. El formato es: [27]

  • PMCID: PMC1852221

Los autores que soliciten premios de los NIH deben incluir el PMCID en su solicitud.

Ver también [ editar ]

  • Europa PubMed Central
  • JATS (tecnología)
  • MEDLINE , una base de datos de literatura internacional sobre ciencias de la vida e información biomédica
  • PMID (identificador de PubMed)
  • PubMed Central Canada
  • Redalyc (proyecto similar enfocado en América Latina)
  • SciELO (servicio similar)

Referencias [ editar ]

  1. ^ Beck J (2010). "Informe del campo: PubMed Central, un archivo de artículos de revistas de ciencias biológicas basado en XML". Actas del Simposio internacional sobre XML para el largo plazo: cuestiones en la preservación a largo plazo de XML . 6 . doi : 10.4242 / BalisageVol6.Beck01 . ISBN 978-1-935958-02-4.
  2. ^ Maloney C, Sequeira E, Kelly C, Orris R, Beck J (5 de diciembre de 2013). PubMed Central . Centro Nacional de Información Biotecnológica (EE. UU.).
  3. ^ "MEDLINE, PubMed y PMC (PubMed Central): ¿En qué se diferencian?" . www.nlm.nih.gov . 9 de septiembre de 2019.
  4. ^ "Apertura por defecto", Inside Higher Ed , 16 de enero de 2017.
  5. ^ "Estadísticas de NIHMS" . nihms.nih.gov .
  6. ^ "Inicio - PMC - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov .
  7. ^ Ouerfelli N. "Derechos de autor: de qué se trata" (PDF) .
  8. ^ "El acceso público a la investigación de los NIH hizo ley" . Códice científico . 2007. Archivado desde el original el 4 de marzo de 2016 . Consultado el 6 de noviembre de 2013 .
  9. ^ "Conjunto de etiquetas de publicación de revistas" . Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 6 de noviembre de 2013 .
  10. ^ Francés D (4 de agosto de 2006). "Actualización de la tecnología ALPSP: un formato de documento XML estándar: el caso para la adopción de NLM DTD" . ALPSP . Consultado el 6 de noviembre de 2013 .
  11. ^ "Conjunto de etiquetas de libro NCBI" . dtd.nlm.nih.gov .
  12. ^ "Noticias de la Biblioteca del Congreso" . Biblioteca del Congreso . 19 de abril de 2006 . Consultado el 6 de noviembre de 2013 .
  13. ^ "Inera Inc. - NLM DTD Resources" . 19 de febrero de 2013. Archivado desde el original el 19 de febrero de 2013 .
  14. ^ "Planes de acceso público de agencias federales de Estados Unidos" . cendi.gov .
  15. ^ Kovo Y (22 de julio de 2016). "Acceso público a los resultados de la investigación financiada por la NASA" . nasa.gov .
  16. ^ "NASA en PMC" . preview.ncbi.nlm.nih.gov .
  17. ^ Conjunto de etiquetas de intercambio y archivado de revistas de NLM , Centro nacional de información biotécnica, Biblioteca Nacional de Medicina
  18. ^ "PLOS aplaude al Congreso por la acción sobre el acceso abierto" . Archivado desde el original el 7 de mayo de 2016 . Consultado el 7 de febrero de 2014 .
  19. ^ "Presentación de la ACS a la solicitud de política de la Oficina de ciencia y tecnología para obtener información sobre el acceso público a publicaciones académicas revisadas por pares resultantes de investigaciones financiadas con fondos federales" (PDF) . whitehouse.gov . Archivado desde el original (PDF) el 11 de julio de 2012 . Consultado el 7 de febrero de 2014 .
  20. ^ Davis PM (octubre de 2012). "El efecto del depósito público de artículos científicos en los lectores". El fisiólogo . 55 (5): 161, 163–5. PMID 23155924 . 
  21. ^ Davis PM (julio de 2013). "La accesibilidad pública de los artículos biomédicos de PubMed Central reduce el número de lectores de revistas - análisis de cohorte retrospectivo" . Revista FASEB . 27 (7): 2536–41. doi : 10.1096 / fj.13-229922 . PMC 3688741 . PMID 23554455 .  
  22. ^ Davis PM (julio de 2013). "La accesibilidad pública de los artículos biomédicos de PubMed Central reduce el número de lectores de revistas - análisis de cohorte retrospectivo" . Revista FASEB . 27 (7): 2536–41. doi : 10.1096 / fj.13-229922 . PMC 3688741 . PMID 23554455 .  
  23. ^ "Autism Speaks anuncia una nueva política para brindar a las familias acceso fácil y gratuito a los hallazgos clave de la investigación - Comunicado de prensa - Autism Speaks" . www.autismspeaks.org . 25 de julio de 2012.
  24. ^ Antelman, Kristin (2004). "¿Los artículos de acceso abierto tienen un mayor impacto en la investigación?" . Bibliotecas universitarias y de investigación . 65 (5): 372–382. doi : 10.5860 / crl.65.5.372 ., resumido por Stemper J, Williams K (2006). "Comunicación académica: convertir la crisis en oportunidad" . Noticias de bibliotecas universitarias y de investigación . 67 (11): 692–696. doi : 10.5860 / crln.67.11.7720 .
  25. ^ Davis PM, Lewenstein BV, Simon DH, Booth JG, Connolly MJ (julio de 2008). "Publicación de acceso abierto, descargas de artículos y citas: ensayo controlado aleatorio" . BMJ . 337 : a568. doi : 10.1136 / bmj.a568 . PMC 2492576 . PMID 18669565 .  
  26. ^ "La Biblioteca Nacional de Medicina amplía el acceso a la literatura sobre el coronavirus a través de PubMed Central" . Institutos Nacionales de Salud (NIH) . 2020-03-25 . Consultado el 31 de marzo de 2020 . Para apoyar esta iniciativa, NLM está adaptando sus procedimientos estándar para depositar artículos en PMC para proporcionar una mayor flexibilidad que garantizará que la investigación sobre el coronavirus esté disponible fácilmente.
  27. ^ "Incluir PMCID en citas | publicaccess.nih.gov" . publicaccess.nih.gov . Consultado el 1 de julio de 2017 .

Enlaces externos [ editar ]

  • Página web oficial
  • Sistema de presentación de los Institutos Nacionales de Salud (NIHMS)
  • Política de acceso público de los NIH