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Proteobacterias
EscherichiaColi NIAID.jpg
Escherichia coli
clasificación cientifica mi
Dominio:Bacterias
Filo:Proteobacteria
Stackebrandt y col., 1988, [1] Garrity y col. 2005 [2]
Clases

Alphaproteobacteria [3]
Betaproteobacteria [4]
Gammaproteobacteria [5]
Deltaproteobacteria [6]
Epsilonproteobacteria [7]
zetaproteobacteria [8]
Acidithiobacillia [5]
Hydrogenophilalia [4]
Oligoflexia [9]
" Candidatus lambdaproteobacteria "
" muproteobacteria Candidatus "

Las proteobacterias son un filo importante de bacterias gramnegativas . Incluyen una amplia variedad de géneros patógenos , como Escherichia , Salmonella , Vibrio , Helicobacter , Yersinia , Legionellales y muchos otros. [10] Otras son de vida libre (no parasitarias ) e incluyen muchas de las bacterias responsables de la fijación de nitrógeno .

Carl Woese estableció este grupo en 1987, llamándolo informalmente "la bacteria púrpura y sus parientes". [11] Debido a la gran diversidad de formas encontradas en este grupo, recibió el nombre de Proteus , un dios griego del mar capaz de asumir muchas formas diferentes y no lleva el nombre del género Proteobacteria Proteus . [1] [12]

Características [ editar ]

Todas las "proteobacterias" son Gram-negativas (aunque algunas pueden teñir Gram-positivas o Gram-variables en la práctica), con una membrana externa compuesta principalmente por lipopolisacáridos . Muchos se mueven usando flagelos , pero algunos no son móviles o dependen del deslizamiento bacteriano . Entre las últimas se incluyen las mixobacterias , un orden de bacterias que pueden agregarse para formar cuerpos fructíferos multicelulares. Además, existe una amplia variedad en los tipos de metabolismo . La mayoría de los miembros son facultativa o obligatoriamente anaeróbicos , quimiolitoautótrofos y heterótrofos., pero ocurren numerosas excepciones. Una variedad de géneros, que no están estrechamente relacionados entre sí, convierten la energía de la luz a través de la fotosíntesis y la fotosíntesis anoxigénica .

Las "proteobacterias" están asociadas con el desequilibrio de la microbiota del tracto reproductivo inferior de la mujer. Estas especies están asociadas con la inflamación. [13]

Algunas Alphaproteobacteria pueden crecer a niveles muy bajos de nutrientes y tener una morfología inusual, como tallos y brotes. Otros incluyen bacterias de importancia agrícola capaces de inducir la fijación de nitrógeno en simbiosis con las plantas. El tipo de orden es Caulobacterales , que comprende bacterias formadoras de tallos como Caulobacter . Se cree que las mitocondrias de los eucariotas son descendientes de una alfaproteobacteria. [14]

Las Betaproteobacterias son metabólicamente muy diversas y contienen quimiolitoautótrofos , fotoautótrofos y heterótrofos generalistas . El tipo de orden es Burkholderiales , que comprende una enorme variedad de diversidad metabólica, incluidos los patógenos oportunistas .

Las Gammaproteobacteria son la clase más grande en términos de especies con nombres publicados válidamente. El orden de tipo es el Pseudomonadales , que incluye los géneros Pseudomonas y Azotobacter fijador de nitrógeno .

Las Deltaproteobacteria incluyen bacterias que son depredadoras de otras bacterias y contribuyen de manera importante al lado anaeróbico del ciclo del azufre. El orden de tipo es el Myxococcales , que incluye organismos con capacidades de autoorganización como Myxococcus spp.

Las Epsilonproteobacteria son a menudo bacilos gramnegativos delgados que son helicoidales o curvos. El orden de tipo es Campylobacterales , que incluye importantes patógenos alimentarios como Campylobacter spp.

Las Zetaproteobacteria son quimiolitoautótrofos neutrófilos oxidantes de hierro , distribuidos en todo el mundo en estuarios y hábitats marinos. El tipo de orden es el Mariprofundales .

Los Hydrogenophilalia son termófilos obligados e incluyen heterótrofos y autótrofos. El orden de tipo es Hydrogenophilales .

Los Acidithiobacillia contienen sólo autótrofos oxidantes de azufre, hierro y uranio . El orden de tipo es Acidithiobacillales , que incluye organismos de importancia económica utilizados en la industria minera como Acidithiobacillus spp.

Las oligoflexias son aerobios filamentosos. El orden de tipo es Oligoflexales , que contiene el género Oligoflexus .

Taxonomía [ editar ]

Filogenia de las "proteobacterias"
 

Acidobacterias

 
 
 

Deltaproteobacteria

 
 
 

Epsilonproteobacteria

 
 
 

Alfaproteobacterias

 
 
 

Zetaproteobacteria

 
 
 

Gammaproteobacteria

 
 

Betaproteobacterias

 
 
 
 
 
 
Filogenia de las "Proteobacterias" según ARB living tree, iTOL, Bergey's y otros. Acidobacteria (que no debe confundirse con Acidithiobacillia) se usa como grupo externo.

El grupo se define principalmente en términos de secuencias de ARN ribosómico (ARNr). Las "Proteobacterias" se dividen en nueve clases con nombres válidamente publicados, a los que se hace referencia con las letras griegas alfa a zeta, Acidithiobacillia, Hydrogenophilalia y Oligoflexia. Estos se consideraban anteriormente como subclases del filo, pero ahora se tratan como clases . Estas clases son monofiléticas . [15] [16] [17] El género Acidithiobacillus , parte de Gammaproteobacteria hasta que se transfirió a la clase Acidithiobacillia en 2013, [18] se consideraba anteriormente como parafilético para elBetaproteobacteria según estudios de alineación multigenómica . [19] En 2017, Betaproteobacteria fue objeto de importantes revisiones y se creó la clase Hydrogenophilalia para contener el orden Hydrogenophilales [20]

Las clases de proteobacterias con nombres publicados válidamente incluyen algunos géneros destacados: [21] por ejemplo:

  • Alphaproteobacteria : Brucella , Rhizobium , Agrobacterium , Caulobacter , Rickettsia , Wolbachia , etc.
  • Betaproteobacterias : Bordetella , Ralstonia , Neisseria , Nitrosomonas , etc.
  • Gammaproteobacteria : Escherichia , Shigella , Salmonella , Yersinia , Buchnera , Haemophilus , Vibrio , Pseudomonas , etc.
  • Deltaproteobacteria : Desulfovibrio , Geobacter , Bdellovibrio , etc.
  • Epsilonproteobacteria : Helicobacter , Campylobacter , Wolinella , etc.
  • Zetaproteobacteria : Mariprofundus , Ghiorsea
  • Oligoflexia : Oligoflexus .
  • Acidithiobacillia : Acidithiobacillus thiooxidans , Thermithiobacillus tepidarius
  • Hydrogenophilalia : Hydrogenophilus thermoluteolus , Tepidiphilus margaritifer

Transformación [ editar ]

La transformación , un proceso en el que el material genético pasa de una bacteria a otra, [22] se ha informado en al menos 30 especies de "Proteobacterias" distribuidas en las clases alfa, beta, gamma y épsilon. [23] Las "proteobacterias" mejor estudiadas con respecto a la transformación genética natural son los patógenos humanos de importancia médica Neisseria gonorrhoeae (clase beta), Haemophilus influenzae (clase gamma) y Helicobacter pylori (clase épsilon). [24] La transformación genética natural es un proceso sexual que implica la transferencia de ADN de una célula bacteriana a otra a través del medio intermedio y la integración de la secuencia del donante en el genoma del receptor. En las "proteobacterias" patógenas, la transformación parece servir como un proceso de reparación del ADN que protege el ADN del patógeno del ataque de las defensas fagocíticas de su huésped que emplean radicales libres oxidativos . [24]


Referencias [ editar ]

  1. ^ a b Stackebrandt, E .; Murray, RGE; Truper, HG (1988). "Proteobacteria classis nov., Un nombre para el taxón filogenético que incluye las" bacterias púrpuras y sus parientes " " . Revista Internacional de Bacteriología Sistemática . 38 (3): 321–325. doi : 10.1099 / 00207713-38-3-321 .
  2. ^ Garrity, GM, Bell, JA y Lilburn, T. (2005). Phylum XIV. Proteobacteria phyl. nov. En: Manual de Bergey de bacteriología sistemática , 2ª ed., Vol. 2 (Las proteobacterias), parte B (Las gammaproteobacterias), pág. 1. Editado por DJ Brenner, NR Krieg, JT Staley y GM Garrity. Nueva York: Springer.
  3. ^ Garrity GM, Bell JA, Lilburn T (2005). "Clase I. Clase de alfaproteobacterias . Nov.". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds.). Bergey Manual of Systematic Bacteriology Volume 2: The Proteobacteria Part C (The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria (2nd ed.). Springer. P. 1. doi : 10.1002 / 9781118960608.cbm00041 . ISBN 9781118960608.
  4. ↑ a b Boden R, Hutt LP, Rae AW (2017). "Reclasificación de Thiobacillus aquaesulis (Wood & Kelly, 1995) como Annwoodia aquaesulis gen. Nov., Comb . Nov., Transferencia de Thiobacillus (Beijerinck, 1904) de Hydrogenophilales a Nitrosomonadales , propuesta de clase Hydrogenophilalia . Nov. Dentro del" Proteobacterias ", y cuatro nuevas familias dentro de los órdenes Nitrosomonadales y Rhodocyclales " . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 67 (5): 1191–1205. doi: 10.1099 / ijsem.0.001927 . hdl : 10026,1 / 8740 . PMID  28581923 .
  5. ↑ a b Williams KP, Kelly DP (2013). "Propuesta de nueva clase dentro del filo Proteobacteria , Acidithiobacillia classis nov., Con el orden tipo Acidithiobacillales , y descripción modificada de la clase Gammaproteobacteria " . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 63 (Parte 8): 2901–2906. doi : 10.1099 / ijs.0.049270-0 . PMID 23334881 . S2CID 39777860 .  
  6. ^ Kuever J, Rainey FA, ​​Widdel F (2005). "Clase IV. Clase Deltaproteobacteria . Nov.". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds.). Bergey Manual of Systematic Bacteriology Volume 2: The Proteobacteria Part C (The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria (2nd ed.). Springer. P. 922. doi : 10.1002 / 9781118960608.cbm00043 . ISBN 9781118960608.
  7. ^ Garrity GM, Bell JA, Lilburn T (2005). "Clase V. Clase Epsilonproteobacteria . Nov.". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds.). Bergey Manual of Systematic Bacteriology Volume 2: The Proteobacteria Part C (The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria (2nd ed.). Springer. P. 1145. doi : 10.1002 / 9781118960608.cbm00044 . ISBN 9781118960608.
  8. ^ Emerson, D .; Rentz, JA; Lilburn, TG; Davis, RE; Aldrich, H .; Chan, C .; Moyer, CL (2007). Reysenbach, Anna-Louise (ed.). "Un nuevo linaje de proteobacterias implicadas en la formación de comunidades de esterilla microbiana oxidante de Fe marino" . PLOS ONE . 2 (8): e667. Código bibliográfico : 2007PLoSO ... 2..667E . doi : 10.1371 / journal.pone.0000667 . PMC 1930151 . PMID 17668050 .  
  9. ↑ Nakai R, Nishijima M, Tazato N, Handa Y, Karray F, Sayadi S, Isoda H, Naganuma T (2014). " Oligoflexus tunisiensis gen. Nov., Sp. Nov., Una bacteria gramnegativa, aeróbica, filamentosa de un nuevo linaje proteobacteriano, y descripción de Oligoflexaceae fam. Nov., Oligoflexales ord. Nov. Y Oligoflexia classis nov" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 64 (Pt 10): 3353–3359. doi : 10.1099 / ijs.0.060798-0 . PMC 4179278 . PMID 25013226 .  CS1 maint: uses authors parameter (link)
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  11. ^ Woese, CR (1987). "Evolución bacteriana" . Revisiones microbiológicas . 51 (2): 221–71. doi : 10.1128 / MMBR.51.2.221-271.1987 . PMC 373105 . PMID 2439888 .  
  12. ^ "Proteobacterias" . Descubre la vida: árbol de la vida . Consultado el 9 de febrero de 2007 .
  13. ^ Bennett, John (2015). Principios y práctica de las enfermedades infecciosas de Mandell, Douglas y Bennett . Filadelfia, PA: Elsevier / Saunders. ISBN 9781455748013; Acceso proporcionado por la Universidad de Pittsburgh
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Enlaces externos [ editar ]

  • Información de proteobacterias de Palaeos .
  • Proteobacterias. - JP Euzéby: Lista de nombres procarióticos con posición en nomenclatura.