V-ATPasa

Family of transport protein complexes

Este artículo trata sobre la vacuolar H⁺
ATPase. Para el H gástrico⁺
/ K⁺
ATPasa, consulte ATPasa de hidrógeno y potasio . Para la membrana plasmática de plantas / hongos H⁺
ATPasa, consulte Proton ATPasa .

V-ATPasa
Esquema de V-ATPase
Identificadores
Símbolo	V-ATPasa
TCDB	3.A.2
Superfamilia OPM	5
Proteína OPM	2bl2
Membranome	226

V-ATPasa, subunidad c (Vo)
Región que atraviesa la membrana de la ATPasa sódica de tipo V de Enterococcus hirae . Los límites de hidrocarburos calculados de la bicapa lipídica se muestran mediante puntos rojos y azules.
Identificadores
Símbolo	ATP-Synt_C
Pfam	PF00137
InterPro	IPR002379
PROSITE	PDOC00526
SCOP2	1aty / SCOPe / SUPFAM
Estructuras proteicas disponibles: Pfam   estructuras / ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum resumen de estructura

V-ATPasa, subunidad C (V1)
estructura cristalina de la subunidad C (vma5p) de la v-atpasa de levadura
Identificadores
Símbolo	V-ATPase_C
Pfam	PF03223
InterPro	IPR004907
SCOP2	1u7l / SCOPe / SUPFAM
Estructuras proteicas disponibles: Pfam   estructuras / ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum resumen de estructura

V-ATPase, subunidad I / a
Identificadores
Símbolo	V_ATPase_I
Pfam	PF01496
InterPro	IPR002490
SCOP2	3rrk / SCOPe / SUPFAM
TCDB	3.A.2
Estructuras proteicas disponibles: Pfam   estructuras / ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum resumen de estructura

V-ATPasa, subunidad E
Identificadores
Símbolo	vATP-Synt_E
Pfam	PF01991
Clan pfam	CL0255
InterPro	IPR002842
Estructuras proteicas disponibles: Pfam   estructuras / ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum resumen de estructura

V-ATPasa, subunidad d / d2
estructura cristalina de la subunidad C (subunidad d de levadura) de v-atpasa
Identificadores
Símbolo	vATP-Synt_AC39
Pfam	PF01992
InterPro	IPR002843
SCOP2	1r5z / SCOPe / SUPFAM
Estructuras proteicas disponibles: Pfam   estructuras / ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum resumen de estructura

V-ATPasa, subunidad H, N-terminal
estructura cristalina de la subunidad reguladora H de la atpasa tipo v de saccharomyces cerevisiae
Identificadores
Símbolo	V-ATPase_H_N
Pfam	PF03224
Clan pfam	CL0020
InterPro	IPR004908
SCOP2	1ho8 / SCOPe / SUPFAM
Estructuras proteicas disponibles: Pfam   estructuras / ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum resumen de estructura

V-ATPasa, subunidad G
Identificadores
Símbolo	V-ATPase_G
Pfam	PF03179
Clan pfam	CL0255
InterPro	IPR005124
Estructuras proteicas disponibles: Pfam   estructuras / ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum resumen de estructura

La ATPasa de tipo vacuolar ( V-ATPasa ) es una enzima evolutivamente antigua altamente conservada con funciones notablemente diversas en organismos eucariotas . ^{[1] Las} V-ATPasas acidifican una amplia gama de orgánulos intracelulares y bombean protones a través de las membranas plasmáticas de numerosos tipos de células. Las V-ATPasas acoplan la energía de la hidrólisis de ATP al transporte de protones a través de las membranas intracelulares y plasmáticas de las células eucariotas. Generalmente se ve como el polo opuesto de la ATP sintasa.porque la ATP sintasa es un canal de protones que utiliza la energía de un gradiente de protones para producir ATP. Sin embargo, la V-ATPasa es una bomba de protones que utiliza la energía de la hidrólisis de ATP para producir un gradiente de protones.

La ATPasa de tipo Archaea ( A-ATPasa ) es un grupo relacionado de ATPasas que se encuentran en Archaea y que a menudo funcionan como una ATP sintasa . Forma un clado V / A-ATPase con V-ATPase. La mayoría de los miembros de cualquier grupo de protones lanzadera ( H⁺
), pero algunos miembros han evolucionado para utilizar iones de sodio ( Na⁺
) en lugar de.

Roles desempeñados por V-ATPases

Las V-ATPasas se encuentran dentro de las membranas de muchos orgánulos, como endosomas , lisosomas y vesículas secretoras, donde desempeñan una variedad de funciones cruciales para la función de estos orgánulos. Por ejemplo, el gradiente de protones a través de la membrana vacuolar de levadura generado por V-ATPasas impulsa la absorción de calcio en la vacuola a través de un H⁺
/California²⁺
sistema antiportador. ^[2] En la transmisión sináptica en las células neuronales, la V-ATPasa acidifica las vesículas sinápticas. ^[3] La norepinefrina ingresa a las vesículas por la V-ATPasa.

Las V-ATPasas también se encuentran en las membranas plasmáticas de una amplia variedad de células, como las células intercaladas del riñón , los osteoclastos (células de reabsorción ósea), los macrófagos , los neutrófilos , los espermatozoides , las células del intestino medio de los insectos y ciertas células tumorales . ^[4] Las V-ATPasas de la membrana plasmática están involucradas en procesos como la homeostasis del pH , el transporte acoplado y la metástasis tumoral . Las V-ATPasas en la membrana acrosómica de los espermatozoides acidifican el acrosoma . Esta acidificación activaproteasas necesarias para perforar la membrana plasmática del huevo . Las V-ATPasas en la membrana plasmática de los osteoclastos bombean protones hacia la superficie del hueso, lo cual es necesario para la resorción ósea. En las células intercaladas del riñón, las V-ATPasas bombean protones a la orina , lo que permite la reabsorción de bicarbonato en la sangre. Además, otra variedad de procesos biológicos, como la liberación de toxinas, la entrada viral, el direccionamiento a la membrana, la apoptosis, la regulación del pH citoplasmático, el proceso proteolítico y la acidificación de los sistemas intracelulares, son funciones importantes de las V-ATPasas. ^[5]

Las V-ATPasas también juegan un papel importante en el desarrollo de la morfogénesis celular. La alteración del gen vma-1 que codifica la subunidad catalítica (A) de la enzima altera gravemente la tasa de crecimiento, diferenciación y capacidad de producir esporas viables en el hongo Neurospora crassa. ^[6]

Estructura

Se ha sugerido que esta sección sea dividida en artículos titulados V / A-ATPasa subunidad C , V / A-ATPasa subunidades E y G , V / A-ATPasa subunidad H y V / A-ATPasa subunidad d / C . ( Discutir ) ( Septiembre 2020 )

La levadura V-ATPasa es la mejor caracterizada. Hay al menos trece subunidades identificadas para formar un complejo V-ATPasa funcional, que consta de dos dominios. Las subunidades pertenecen al dominio V _o (subunidades asociadas a la membrana, letras minúsculas en la figura) o al dominio V ₁ (subunidades asociadas periféricamente, letras mayúsculas en la figura).

El V ₁ incluye ocho subunidades, AH, con tres copias de las subunidades catalíticas A y B, tres copias de las subunidades del estator E y G, y una copia de las subunidades reguladoras C y H. Además, el dominio V ₁ también contiene las subunidades D y F, que forman un eje de rotor central. ^[7] El dominio V ₁ contiene isoformas de subunidades específicas de tejido que incluyen B, C, E y G. Las mutaciones en la isoforma B1 dan como resultado la enfermedad humana, acidosis tubular renal distal y sordera neurosensorial.

El dominio V _o contiene seis subunidades diferentes, a, d, c, c ', c "y e, y la estequiometría del anillo c sigue siendo un tema de debate y se postula un decamer para el gusano del cuerno del tabaco ( Manduca sexta ) V -ATPasa. El dominio V _{o de} mamíferos contiene isoformas específicas de tejido para las subunidades a y d, mientras que la V-ATPasa de levadura contiene dos subunidades isoformas específicas de orgánulos de a, Vph1p y Stv1p. Las mutaciones en la isoforma a3 dan como resultado la enfermedad infantil humana la osteopetrosis maligna y las mutaciones en la isoforma a4 provocan acidosis tubular renal distal, en algunos casos con sordera neurosensorial.

El dominio V ₁ es responsable de la hidrólisis de ATP, mientras que el dominio V _o es responsable de la translocación de protones. La hidrólisis de ATP en los sitios de unión de nucleótidos catalíticos en la subunidad A impulsa la rotación de un tallo central compuesto por las subunidades D y F, que a su vez impulsa la rotación de un barril de subunidades c en relación con la subunidad a. La estructura compleja de la V-ATPasa se ha revelado a través de la estructura de los complejos M. Sexta y Yeast que se resolvieron mediante crio-EM de una sola partícula y tinción negativa, respectivamente. ^{[8] [9] [10]} Estas estructuras han revelado que la V-ATPasa tiene una red de 3 estatores, unida por un collar de densidad formado por las subunidades C, H y una, que, al dividir la V ₁y los dominios V _o , no interactúan con el eje del rotor central formado por las subunidades F, D y d. La rotación de este eje del rotor central causada por la hidrólisis de ATP dentro de los dominios AB catalíticos da como resultado el movimiento del barril de subunidades c más allá de la subunidad a, lo que impulsa el transporte de protones a través de la membrana. Johnson ha propuesto una estequiometría de dos protones translocados por cada ATP hidrolizado. ^[11]

Además de las subunidades estructurales de la V-ATPasa de levadura, se han identificado proteínas asociadas que son necesarias para el ensamblaje. Estas proteínas asociadas son esenciales para el ensamblaje del dominio V _o y se denominan Vma12p, Vma21p y Vma22p. ^{[12] [13] [14] [15]} Dos de las tres proteínas, Vma12p y Vma22p, forman un complejo que se une transitoriamente a Vph1p (subunidad a) para ayudar a su ensamblaje y maduración. ^{[14] [16] [17] [18]} Vma21p coordina el ensamblaje de las subunidades V _o y escolta el dominio V _o hacia las vesículas para su transporte al Golgi . ^[19]

V ₁

El dominio V ₁ de la V-ATPasa es el sitio de hidrólisis de ATP. A diferencia de V _o , el dominio V ₁ es hidrófobo. ^[5] Este dominio soluble consiste en un hexámero de subunidades alternas A y B, un rotor central D, estatores periféricos G y E, y subunidades reguladoras C y H. La hidrólisis de ATP impulsa un cambio conformacional en las seis interfaces A | B y con su rotación del rotor central D. A diferencia de la ATP sintasa, el dominio V ₁ no es una ATPasa activa cuando se disocia.

Subunidades V ₁ ^[20]

Subunidad	Gen humano	Nota
A, B	ATP6V1A , ATP6V1B1 , ATP6V1B2	Hexámero catalítico.
C	ATP6V1C1 , ATP6V1C2
D	ATP6V1D	Tallo del rotor central, responsable de la especificidad de los iones.
P.EJ	ATP6V1E1 , ATP6V1E2 , ATP6V1G1 , ATP6V1G2 , ATP6V1G3
F	ATP6V1F
H	ATP6V1H

Subunidad C

V-ATPasa (Vacuolar-ATPasa) C representa la subunidad terminal C que forma parte del complejo V1 y se localiza en la interfaz entre los complejos V1 y Vo. ^[21]

Función de la subunidad C

La subunidad C juega un papel esencial en el control del ensamblaje de V-ATPasa, actuando como un estator flexible que mantiene unidos los sectores catalítico (V1) y de membrana (VO) de la enzima. ^[22] La liberación de la subunidad C del complejo ATPasa da como resultado la disociación de los subcomplejos V1 y Vo, que es un mecanismo importante para controlar la actividad de V-ATPasa en las células . Esencialmente, al crear un alto gradiente electroquímico y un pH bajo, esto impulsa a la enzima a crear más ATP.

Subunidades E, G

Estas subunidades relacionadas forman el tallo (s) de A / V-ATPasa. Son importantes en el montaje y pueden funcionar como varillas de empuje en actividad. E tiene una tapa para conectarse a A / B, mientras que G no. ^[20] Probablemente evolucionaron a partir de una sola proteína por duplicación de genes . ^[23]

Subunidad H

Esta subunidad solo está involucrada en la actividad y no en el ensamblaje. Esta subunidad también actúa como inhibidor de las subunidades V1 libres; detiene la hidrólisis de ATP cuando se disocian V1 y Vo. ^[24]

V _o

El dominio V _o es responsable de la translocación de protones. A diferencia de la ATP sintasa de tipo F , el dominio V _o generalmente transporta protones contra su propio gradiente de concentración. La rotación del dominio V _o transporta los protones en movimiento coordinado con el dominio V ₁ , que es responsable de la hidrólisis del ATP. El dominio V _o es hidrófilo y está compuesto por varias subunidades disociables. ^[5] Estas subunidades están presentes en el dominio V _o para hacer de ésta una translocasa funcional de protones; se describen a continuación.

Subunidades V _o ^[20]

Subunidad	Gen humano	Nota
ai	ATP6V0A1 , ATP6V0A2 , ATP6V0A4
C	ATP6V0B , ATP6V0C	Anillo de variada talla.
corriente continua	ATP6V0D1 , ATP6V0D2
mi	ATP6V0E1 , ATP6V0E2	Proteína de ensamblaje hidrofóbico de 9 kDa.
AC45 / S1	ATP6AP1	Subunidad accesoria
S2	ATP6AP2	Subunidad accesoria

Subunidad a / I

La subunidad de 116 kDa (o subunidad a) y la subunidad I se encuentran en el complejo Vo o Ao de V- o A-ATPasas, respectivamente. La subunidad de 116 kDa es una glicoproteína transmembrana necesaria para el ensamblaje y la actividad de transporte de protones del complejo ATPasa. Existen varias isoformas de la subunidad de 116 kDa, que proporcionan un papel potencial en el direccionamiento diferencial y la regulación de la V-ATPasa para orgánulos específicos.

La función de la subunidad de 116 kDa no está definida, pero su estructura predicha consta de 6-8 sectores transmembranosos, lo que sugiere que puede funcionar de manera similar a la subunidad a de FO.

Subunidad d / C

La subunidad d en V-ATPasas, llamada subunidad C en A-ATpasas, es parte del complejo Vo. Encajan en el medio del anillo c, por lo que se cree que funcionan como un rotor. Hay dos versiones de esta subunidad en eucariotas, d / d1 y d2. ^[25]

En los mamíferos, d1 ( ATP6V0D1 ) es la versión expresada de forma ubicua y d2 ( ATP6V0D2 ) se expresa solo en tipos de células específicos. ^[25]

Subunidad c

Similar to the F-type ATP synthase, the transmembrane region of the V-ATPase includes a ring of membrane-spanning subunits that are primarily responsible for proton translocation. Dissimilar from the F-type ATP synthase, however, the V-ATPase has multiple related subunits in the c-ring; in fungi such as yeast there are three related subunits (of varied stoichiometry) and in most other eukaryotes there are two.

V-ATPase assembly

Yeast V-ATPases fail to assemble when any of the genes that encode subunits are deleted except for subunits H and c".^[26][27][28] Without subunit H, the assembled V-ATPase is not active,^[13][29] and the loss of the c" subunit results in uncoupling of enzymatic activity.^[27]

The precise mechanisms by which V-ATPases assembly are still controversial, with evidence suggesting two different possibilities. Mutational analysis and in vitro assays have shown that preassembled V_o and V₁ domains can combine to form one complex in a process called independent assembly. Support for independent assembly includes the findings that the assembled V_o domain can be found at the vacuole in the absence of the V₁ domain, whereas free V₁ domains can be found in the cytoplasm and not at the vacuole.^[30][31] In contrast, in vivo pulse-chase experiments have revealed early interactions between V_o and V₁ subunits, to be specific, the a and B subunits, suggesting that subunits are added in a step-wise fashion to form a single complex in a concerted assembly process.^[32]

V-ATPase evolution

A relatively new technique called ancestral gene resurrection has shed new light on the evolutionary history of the V-ATPase. It has been shown how the V-ATPase structure of the ancestral form consisting of two different proteins evolves into the fungi version with three different proteins.^[33][34][35] The V-Type ATPase is similar to the archaeal (so called) A-Type ATP synthase, a fact that supports an archaeal origin of eukaryotes (like Eocyte Hypothesis, see also Lokiarchaeota). The exceptional occurrence of some lineages of archaea with F-type and of some lineages of bacteria with A-type ATPase respectively is regarded as a result of horizontal gene transfer.^[36]

Regulation of V-ATPase activity

V-ATPases are known to be specifically inhibited by macrolide antibiotics, such as concanamycin (CCA) and balifomycin A1.^[37] In vivo regulation of V-ATPase activity is accomplished by reversible dissociation of the V₁ domain from the V_o domain. After initial assembly, both the insect Manduca sexta and yeast V-ATPases can reversibly disassemble into free V_o and V₁ domains after a 2- to 5-minute deprivation of glucose.^[30] Reversible disassembly may be a general mechanism of regulating V-ATPase activity, since it exists in yeast and insects. Reassembly is proposed to be aided by a complex termed RAVE (regulator of H⁺
-ATPase of vacuolar and endosomal membranes).^[38] Disassembly and reassembly of V-ATPases does not require new protein synthesis but does need an intact microtubular network.^[39]

Human diseases

Osteopetrosis

Osteopetrosis is generic name that represents a group of heritable conditions in which there is a defect in osteoclastic bone resorption. Both dominant and recessive osteopetrosis occur in humans.^[40][41] Autosomal dominant osteopetrosis shows mild symptoms in adults experiencing frequent bone fractures due to brittle bones.^[40] A more severe form of osteopetrosis is termed autosomal recessive infantile malignant osteopetrosis.^[41][42][43] Three genes that are responsible for recessive osteopetrosis in humans have been identified. They are all directly involved in the proton generation and secretion pathways that are essential for bone resorption. One gene is carbonic anhydrase II (CAII), which, when mutated, causes osteopetrosis with renal tubular acidosis(type 3).^[44] Mutations to the chloride channel ClC7 gene also lead to both dominant and recessive osteopetrosis.^[40] Approximately 50% of patients with recessive infantile malignant osteopetrosis have mutations to the a3 subunit isoform of V-ATPase.^{[42] [45][46]} In humans, 26 mutations have been identified in V-ATPase subunit isoform a3, found in osteoclasts, that result in the bone disease autosomal recessive osteopetrosis.^{[42][41][45][47]}

Distal renal tubular acidosis (dRTA)

The importance of V-ATPase activity in renal proton secretion is highlighted by the inherited disease distal renal tubular acidosis. In all cases, renal tubular acidosis results from a failure of the normal renal mechanisms that regulate systemic pH. There are four types of renal tubular acidosis. Type 1 is distal renal tubular acidosis and results from a failure of the cortical collecting duct to acidify the urine below pH 5.^[48] Some patients with autosomal recessive dRTA also have sensorineural hearing loss.^[49] Inheritance of this type of RTA results from either mutations to V-ATPase subunit isoform B1 or isoform a4 or mutations of band 3 (also called AE1), a Cl-/HCO3- exchanger.^[49][50][51] Twelve different mutations to V-ATPase isoform B1^[52] and twenty-four different mutations in a4 lead to dRTA.^[52][49] Reverse transcription polymerase chain reaction studies have shown expression of the a4 subunit in the intercalated cell of the kidney and in the cochlea.^[52] dRTA caused by mutations in the a4 subunit gene in some cases can be associated with deafness due to a failure to normally acidify the endolymph of the inner ear.^[51]

X-linked myopathy with excessive autophagy (XMEA)

X-linked myopathy with excessive autophagy is a rare genetic disease resulting from mutations in the VMA21 gene.^[53] The disease has a childhood onset and results in a slowly progressive muscle weakness, typically beginning in the legs, and some patients can eventually require wheelchair assistance with advanced age. The Vma21 protein assists in assembly of the V-ATPase, and XMEA associated mutations result in decreased activity of the V-ATPase and increased lysosomal pH.^[53]

Nomenclature

The term V_o has a lowercase letter "o" (not the number "zero") in subscript. The "o" stands for oligomycin, which binds to the homologous region in F-ATPase. It is worth noting that the human gene notations at NCBI designate it as "zero" rather than the letter "o". For example, the gene for the human c subunit of Vo is listed in NCBI gene database as "ATP6V0C" (with a zero), rather than "ATP6VOC" (with an "o"). Many pieces of literature make this mistake as well.

See also

• ATP synthase
• ATPases
• F-ATPase
• Na+/K+-ATPase

References

1. Nelson N, Perzov N, Cohen A, Hagai K, Padler V, Nelson H (January 2000). "The cellular biology of proton-motive force generation by V-ATPases". The Journal of Experimental Biology. 203 (Pt 1): 89–95. PMID 10600677.
2. Ohya Y, Umemoto N, Tanida I, Ohta A, Iida H, Anraku Y (July 1991). "Calcium-sensitive cls mutants of Saccharomyces cerevisiae showing a Pet- phenotype are ascribable to defects of vacuolar membrane H(+)-ATPase activity". The Journal of Biological Chemistry. 266 (21): 13971–7. doi:10.1016/S0021-9258(18)92798-5. PMID 1830311.
3. Wienisch M, Klingauf J (August 2006). "Vesicular proteins exocytosed and subsequently retrieved by compensatory endocytosis are nonidentical". Nature Neuroscience. 9 (8): 1019–27. doi:10.1038/nn1739. hdl:11858/00-001M-0000-0012-E436-F. PMID 16845386. S2CID 12808314.
4. Izumi H, Torigoe T, Ishiguchi H, Uramoto H, Yoshida Y, Tanabe M, Ise T, Murakami T, Yoshida T, Nomoto M, Kohno K (December 2003). "Cellular pH regulators: potentially promising molecular targets for cancer chemotherapy". Cancer Treatment Reviews. 29 (6): 541–9. doi:10.1016/S0305-7372(03)00106-3. PMID 14585264.
5. Emma B, Forest O, Barry B (June 1997). "Mutations of pma-1, the Gene Encoding the Plasma Membrane H+ATPase of Neurospora crassa, Suppress Inhibition of Growth by Concanamycin A, a Specific Inhibitor of Vacuolar ATPases". The Journal of Biological Chemistry. 272 (23): 14776–14786. doi:10.1074/jbc.272.23.14776. PMID 9169444. S2CID 29865381.
6. Bowman, E. J., & Bowman, B. J. (2000). Cellular role of the V-ATPase in Neurospora crassa: analysis of mutants resistant to concanamycin or lacking the catalytic subunit A. The Journal of experimental biology, 203(Pt 1), 97–106.
7. Kitagawa N, Mazon H, Heck AJ, Wilkens S (February 2008). "Stoichiometry of the peripheral stalk subunits E and G of yeast V1-ATPase determined by mass spectrometry". The Journal of Biological Chemistry. 283 (6): 3329–37. doi:10.1074/jbc.M707924200. PMID 18055462. S2CID 27627066.
8. Muench SP, Huss M, Song CF, Phillips C, Wieczorek H, Trinick J, Harrison MA (March 2009). "Cryo-electron microscopy of the vacuolar ATPase motor reveals its mechanical and regulatory complexity". Journal of Molecular Biology. 386 (4): 989–99. doi:10.1016/j.jmb.2009.01.014. PMID 19244615.
9. Diepholz M, Börsch M, Böttcher B (October 2008). "Structural organization of the V-ATPase and its implications for regulatory assembly and disassembly". Biochemical Society Transactions. 36 (Pt 5): 1027–31. doi:10.1042/BST0361027. PMID 18793183. S2CID 23852611.
10. Zhang Z, Zheng Y, Mazon H, Milgrom E, Kitagawa N, Kish-Trier E, Heck AJ, Kane PM, Wilkens S (December 2008). "Structure of the yeast vacuolar ATPase". The Journal of Biological Chemistry. 283 (51): 35983–95. doi:10.1074/jbc.M805345200. PMC 2602884. PMID 18955482.
11. Johnson RG, Beers MF, Scarpa A (September 1982). "H+ ATPase of chromaffin granules. Kinetics, regulation, and stoichiometry". The Journal of Biological Chemistry. 257 (18): 10701–7. doi:10.1016/S0021-9258(18)33879-1. PMID 6213624.
12. Hirata R, Umemoto N, Ho MN, Ohya Y, Stevens TH, Anraku Y (January 1993). "VMA12 is essential for assembly of the vacuolar H(+)-ATPase subunits onto the vacuolar membrane in Saccharomyces cerevisiae". The Journal of Biological Chemistry. 268 (2): 961–7. doi:10.1016/S0021-9258(18)54027-8. PMID 8419376.
13. Ho MN, Hirata R, Umemoto N, Ohya Y, Takatsuki A, Stevens TH, Anraku Y (August 1993). "VMA13 encodes a 54-kDa vacuolar H(+)-ATPase subunit required for activity but not assembly of the enzyme complex in Saccharomyces cerevisiae". The Journal of Biological Chemistry. 268 (24): 18286–92. doi:10.1016/S0021-9258(17)46842-6. PMID 8349704.
14. Hill KJ, Stevens TH (September 1994). "Vma21p is a yeast membrane protein retained in the endoplasmic reticulum by a di-lysine motif and is required for the assembly of the vacuolar H(+)-ATPase complex". Molecular Biology of the Cell. 5 (9): 1039–50. doi:10.1091/mbc.5.9.1039. PMC 301125. PMID 7841520.
15. Jackson DD, Stevens TH (October 1997). "VMA12 encodes a yeast endoplasmic reticulum protein required for vacuolar H+-ATPase assembly". The Journal of Biological Chemistry. 272 (41): 25928–34. doi:10.1074/jbc.272.41.25928. PMID 9325326. S2CID 38400074.
16. Hill KJ, Stevens TH (September 1995). "Vma22p is a novel endoplasmic reticulum-associated protein required for assembly of the yeast vacuolar H(+)-ATPase complex". The Journal of Biological Chemistry. 270 (38): 22329–36. doi:10.1074/jbc.270.38.22329. PMID 7673216. S2CID 34639779.
17. Graham LA, Hill KJ, Stevens TH (July 1998). "Assembly of the yeast vacuolar H+-ATPase occurs in the endoplasmic reticulum and requires a Vma12p/Vma22p assembly complex". The Journal of Cell Biology. 142 (1): 39–49. doi:10.1083/jcb.142.1.39. PMC 2133036. PMID 9660861.
18. Graham LA, Flannery AR, Stevens TH (August 2003). "Structure and assembly of the yeast V-ATPase". Journal of Bioenergetics and Biomembranes. 35 (4): 301–12. doi:10.1023/A:1025772730586. PMID 14635776. S2CID 37806912.
19. Malkus P, Graham LA, Stevens TH, Schekman R (November 2004). "Role of Vma21p in assembly and transport of the yeast vacuolar ATPase". Molecular Biology of the Cell. 15 (11): 5075–91. doi:10.1091/mbc.E04-06-0514. PMC 524777. PMID 15356264.
20. Stewart AG, Laming EM, Sobti M, Stock D (April 2014). "Rotary ATPases--dynamic molecular machines". Current Opinion in Structural Biology. 25: 40–8. doi:10.1016/j.sbi.2013.11.013. PMID 24878343.
21. Inoue T, Forgac M (July 2005). "Cysteine-mediated cross-linking indicates that subunit C of the V-ATPase is in close proximity to subunits E and G of the V1 domain and subunit a of the V0 domain". The Journal of Biological Chemistry. 280 (30): 27896–903. doi:10.1074/jbc.M504890200. PMID 15951435. S2CID 23648833.
22. Drory O, Frolow F, Nelson N (December 2004). "Crystal structure of yeast V-ATPase subunit C reveals its stator function". EMBO Reports. 5 (12): 1148–52. doi:10.1038/sj.embor.7400294. PMC 1299189. PMID 15540116.
23. Imada K, Minamino T, Uchida Y, Kinoshita M, Namba K (March 2016). "Insight into the flagella type III export revealed by the complex structure of the type III ATPase and its regulator". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 113 (13): 3633–8. Bibcode:2016PNAS..113.3633I. doi:10.1073/pnas.1524025113. PMC 4822572. PMID 26984495.
24. Jefferies KC, Forgac M (February 2008). "Subunit H of the vacuolar (H+) ATPase inhibits ATP hydrolysis by the free V1 domain by interaction with the rotary subunit F". The Journal of Biological Chemistry. 283 (8): 4512–9. doi:10.1074/jbc.M707144200. PMC 2408380. PMID 18156183.
25. Toei M, Saum R, Forgac M (June 2010). "Regulation and isoform function of the V-ATPases". Biochemistry. 49 (23): 4715–23. doi:10.1021/bi100397s. PMC 2907102. PMID 20450191.
26. Forgac M (January 1999). "The vacuolar H+-ATPase of clathrin-coated vesicles is reversibly inhibited by S-nitrosoglutathione". The Journal of Biological Chemistry. 274 (3): 1301–5. doi:10.1074/jbc.274.3.1301. PMID 9880499. S2CID 21784089.
27. Whyteside G, Gibson L, Scott M, Finbow ME (June 2005). "Assembly of the yeast vacuolar H+-ATPase and ATP hydrolysis occurs in the absence of subunit c"". FEBS Letters. 579 (14): 2981–5. doi:10.1016/j.febslet.2005.04.049. PMID 15907326. S2CID 32086585.
28. Stevens TH, Forgac M (1997). "Structure, function and regulation of the vacuolar (H+)-ATPase". Annual Review of Cell and Developmental Biology. 13: 779–808. doi:10.1146/annurev.cellbio.13.1.779. PMID 9442887.
29. Parra KJ, Keenan KL, Kane PM (July 2000). "The H subunit (Vma13p) of the yeast V-ATPase inhibits the ATPase activity of cytosolic V1 complexes". The Journal of Biological Chemistry. 275 (28): 21761–7. doi:10.1074/jbc.M002305200. PMID 10781598. S2CID 46127337.
30. Kane PM (July 1995). "Disassembly and reassembly of the yeast vacuolar H(+)-ATPase in vivo". The Journal of Biological Chemistry. 270 (28): 17025–32. doi:10.1074/jbc.270.28.17025 (inactive 2021-01-13). PMID 7622524.
31. Sumner JP, Dow JA, Earley FG, Klein U, Jäger D, Wieczorek H (March 1995). "Regulation of plasma membrane V-ATPase activity by dissociation of peripheral subunits". The Journal of Biological Chemistry. 270 (10): 5649–53. doi:10.1074/jbc.270.10.5649. PMID 7890686. S2CID 38963775.
32. Kane PM, Tarsio M, Liu J (June 1999). "Early steps in assembly of the yeast vacuolar H+-ATPase". The Journal of Biological Chemistry. 274 (24): 17275–83. doi:10.1074/jbc.274.24.17275. PMID 10358087. S2CID 42610386.
33. Pearson H (9 January 2012). "Resurrecting extinct proteins shows how a machine evolves". Nature.com News Blog.
34. Finnigan GC, Hanson-Smith V, Stevens TH, Thornton JW (January 2012). "Evolution of increased complexity in a molecular machine". Nature. 481 (7381): 360–4. Bibcode:2012Natur.481..360F. doi:10.1038/nature10724. PMC 3979732. PMID 22230956.
35. Snapshot view of the V-ATPase molecular machine: animals vs. fungi, University of Oregon (Accessed 2012-01-11)
36. Hilario E, Gogarten JP (1993). "Horizontal transfer of ATPase genes--the tree of life becomes a net of life" (PDF). Bio Systems. 31 (2–3): 111–9. doi:10.1016/0303-2647(93)90038-E. PMID 8155843.
37. Bowman EJ, O'Neill FJ, Bowman BJ (June 1997). "Mutations of pma-1, the gene encoding the plasma membrane H+-ATPase of Neurospora crassa, suppress inhibition of growth by concanamycin A, a specific inhibitor of vacuolar ATPases". The Journal of Biological Chemistry. 272 (23): 14776–86. doi:10.1074/jbc.272.23.14776. PMID 9169444. S2CID 29865381.
38. Kane PM, Smardon AM (August 2003). "Assembly and regulation of the yeast vacuolar H+-ATPase". Journal of Bioenergetics and Biomembranes. 35 (4): 313–21. doi:10.1023/A:1025724814656. PMID 14635777. S2CID 7535580.
39. Holliday LS, Lu M, Lee BS, Nelson RD, Solivan S, Zhang L, Gluck SL (October 2000). "The amino-terminal domain of the B subunit of vacuolar H+-ATPase contains a filamentous actin binding site". The Journal of Biological Chemistry. 275 (41): 32331–7. doi:10.1074/jbc.M004795200. PMID 10915794. S2CID 2601649.
40. Michigami T, Kageyama T, Satomura K, Shima M, Yamaoka K, Nakayama M, Ozono K (February 2002). "Novel mutations in the a3 subunit of vacuolar H(+)-adenosine triphosphatase in a Japanese patient with infantile malignant osteopetrosis". Bone. 30 (2): 436–9. doi:10.1016/S8756-3282(01)00684-6. PMID 11856654.
41. Frattini A, Orchard PJ, Sobacchi C, Giliani S, Abinun M, Mattsson JP, Keeling DJ, Andersson AK, Wallbrandt P, Zecca L, Notarangelo LD, Vezzoni P, Villa A (July 2000). "Defects in TCIRG1 subunit of the vacuolar proton pump are responsible for a subset of human autosomal recessive osteopetrosis". Nature Genetics. 25 (3): 343–6. doi:10.1038/77131. PMID 10888887. S2CID 21316081.
42. Sobacchi C, Frattini A, Orchard P, Porras O, Tezcan I, Andolina M, et al. (August 2001). "The mutational spectrum of human malignant autosomal recessive osteopetrosis". Human Molecular Genetics. 10 (17): 1767–73. doi:10.1093/hmg/10.17.1767. PMID 11532986.
43. Fasth A, Porras O (1999). "Human malignant osteopetrosis: pathophysiology, management and the role of bone marrow transplantation". Pediatric Transplantation. 3 Suppl 1 (Suppl 1): 102–7. doi:10.1034/j.1399-3046.1999.00063.x. PMID 10587979. S2CID 31745272.
44. Sly WS, Hewett-Emmett D, Whyte MP, Yu YS, Tashian RE (May 1983). "Carbonic anhydrase II deficiency identified as the primary defect in the autosomal recessive syndrome of osteopetrosis with renal tubular acidosis and cerebral calcification". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 80 (9): 2752–6. Bibcode:1983PNAS...80.2752S. doi:10.1073/pnas.80.9.2752. PMC 393906. PMID 6405388.
45. Kornak U, Schulz A, Friedrich W, Uhlhaas S, Kremens B, Voit T, Hasan C, Bode U, Jentsch TJ, Kubisch C (August 2000). "Mutations in the a3 subunit of the vacuolar H(+)-ATPase cause infantile malignant osteopetrosis". Human Molecular Genetics. 9 (13): 2059–63. doi:10.1093/hmg/9.13.2059. PMID 10942435.
46. Frattini A, Pangrazio A, Susani L, Sobacchi C, Mirolo M, Abinun M, Andolina M, Flanagan A, Horwitz EM, Mihci E, Notarangelo LD, Ramenghi U, Teti A, Van Hove J, Vujic D, Young T, Albertini A, Orchard PJ, Vezzoni P, Villa A (October 2003). "Chloride channel ClCN7 mutations are responsible for severe recessive, dominant, and intermediate osteopetrosis". Journal of Bone and Mineral Research. 18 (10): 1740–7. doi:10.1359/jbmr.2003.18.10.1740. PMID 14584882. S2CID 20966489.
47. Susani L, Pangrazio A, Sobacchi C, Taranta A, Mortier G, Savarirayan R, Villa A, Orchard P, Vezzoni P, Albertini A, Frattini A, Pagani F (September 2004). "TCIRG1-dependent recessive osteopetrosis: mutation analysis, functional identification of the splicing defects, and in vitro rescue by U1 snRNA". Human Mutation. 24 (3): 225–35. doi:10.1002/humu.20076. PMID 15300850. S2CID 31788054.
48. Alper SL (2002). "Genetic diseases of acid-base transporters". Annual Review of Physiology. 64: 899–923. doi:10.1146/annurev.physiol.64.092801.141759. PMID 11826292.
49. Karet FE, Finberg KE, Nelson RD, Nayir A, Mocan H, Sanjad SA, et al. (January 1999). "Mutations in the gene encoding B1 subunit of H+-ATPase cause renal tubular acidosis with sensorineural deafness". Nature Genetics. 21 (1): 84–90. doi:10.1038/5022. PMID 9916796. S2CID 34262548.
50. Karet FE, Gainza FJ, Györy AZ, Unwin RJ, Wrong O, Tanner MJ, et al. (May 1998). "Mutations in the chloride-bicarbonate exchanger gene AE1 cause autosomal dominant but not autosomal recessive distal renal tubular acidosis". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 95 (11): 6337–42. Bibcode:1998PNAS...95.6337K. doi:10.1073/pnas.95.11.6337. PMC 27686. PMID 9600966.
51. Stehberger PA, Schulz N, Finberg KE, Karet FE, Giebisch G, Lifton RP, Geibel JP, Wagner CA (December 2003). "Localization and regulation of the ATP6V0A4 (a4) vacuolar H+-ATPase subunit defective in an inherited form of distal renal tubular acidosis". Journal of the American Society of Nephrology. 14 (12): 3027–38. doi:10.1097/01.ASN.0000099375.74789.AB. PMID 14638902.
52. Stover EH, Borthwick KJ, Bavalia C, Eady N, Fritz DM, Rungroj N, et al. (November 2002). "Novel ATP6V1B1 and ATP6V0A4 mutations in autosomal recessive distal renal tubular acidosis with new evidence for hearing loss". Journal of Medical Genetics. 39 (11): 796–803. doi:10.1136/jmg.39.11.796. PMC 1735017. PMID 12414817.
53. Ramachandran N, Munteanu I, Wang P, Ruggieri A, Rilstone JJ, Israelian N, et al. (March 2013). "VMA21 deficiency prevents vacuolar ATPase assembly and causes autophagic vacuolar myopathy". Acta Neuropathologica. 125 (3): 439–57. doi:10.1007/s00401-012-1073-6. PMID 23315026. S2CID 20528180.

External links

• V-Type+ATPase at the US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)