El torneo de baloncesto de la NCAA de 1941 involucró a ocho escuelas que jugaron en un juego de eliminación simple para determinar el campeón nacional de baloncesto universitario masculino de la NCAA . Comenzó el 21 de marzo de 1941 y terminó con el juego de campeonato el 29 de marzo en Kansas City, Missouri . Se jugaron un total de nueve partidos, incluido un partido por el tercer puesto en ambas regiones.
Wisconsin , dirigido por Bud Foster , ganó el título nacional con una victoria de 39-34 en la final sobre el estado de Washington , dirigido por Jack Friel . John Kotz de Wisconsin fue nombrado el jugador más destacado del torneo .