El Torneo de Baloncesto de la División II de la NCAA de 1979 involucró a 32 escuelas que jugaban en un torneo de eliminación simple para determinar el campeón nacional de baloncesto universitario de la División II de la NCAA como culminación de la temporada de baloncesto de la División II de la NCAA de 1978-79. Fue ganado por la Universidad de Alabama del Norte y Perry Oden de Alabama del Norte fue el Jugador Más Destacado.