El Campeonato de Fútbol Masculino de la División II de la NCAA de 1990 fue el 19º torneo anual realizado por la NCAA para determinar el mejor programa de fútbol universitario de la División II para hombres en los Estados Unidos.
Southern Connecticut State derrotó a Seattle Pacific en la final, ganando en una tanda de penaltis luego de que el partido por el campeonato terminara 0-0 en cuatro períodos de tiempo extra. Este fue el segundo título nacional de los Owls (22-0-1) y el primero para el entrenador Ray Reid . [1]