El Campeonato de fútbol masculino de la División II de la NCAA de 2000 fue el 29º torneo anual realizado por la NCAA para determinar el mejor programa de fútbol universitario masculino de la División II en los Estados Unidos.
Cal State Dominguez Hills (23-1-1) derrotó al anfitrión Barry , 2-1, en la final del torneo, después de cuatro períodos de tiempo extra.