El Torneo de Hockey sobre Hielo Masculino de la División III de la NCAA de 2004 fue la culminación de la temporada 2003-04 , el vigésimo primer torneo de este tipo en la historia de la NCAA . Concluyó con Middlebury derrotando a St. Norbert en el juego de campeonato 1-0 en tiempo extra. Todos los enfrentamientos de la Primera Ronda y los Cuartos de Final se llevaron a cabo en las sedes del equipo local, mientras que todos los juegos posteriores se jugaron en Norwich, Vermont .
Los siguientes equipos se clasificaron para el torneo. Se ofrecieron ofertas automáticas al campeón del torneo de conferencias de siete conferencias diferentes con una oferta general para el mejor equipo restante de cada región.
El torneo contó con cuatro rondas de juego. Todas las rondas fueron eliminaciones en un solo juego . Para los tres cuartos de final del este, los equipos fueron sembrados de acuerdo con su clasificación con los tres mejores equipos como anfitriones. Para los cuartos de final del oeste, el equipo mejor clasificado esperaba al ganador de un juego de entrada entre los equipos peor clasificados.