El 2006 Torneo de Baloncesto de América del este de los hombres se llevó a cabo a partir de marzo 3-5 en la Universidad de Binghamton Events Center . La final se llevó a cabo el 11 de marzo en el Centro de Recreación y Convocatoria de la Universidad de Albany . Albany ganó su primer lugar en el Torneo de la NCAA con su victoria sobre Vermont. Albany obtuvo el puesto 16 en el Torneo Regional de la NCAA de Washington DC y perdió en la primera ronda ante Connecticut 72-59, después de que Albany casi se convirtiera en el primer puesto 16 en derrotar a un sembrado 1 con una ventaja de doce puntos con poco más de once minutos para jugar.