Las Finales del Campeonato de Fútbol Masculino de la CEI de 2006 se llevaron a cabo del 9 al 12 de noviembre de 2006 en la Universidad de Alberta en Edmonton, Alberta. Estará compuesto por 8 equipos de las distintas conferencias del Canadian Interuniversity Sport.
Todos canadienses
Primer equipo (1–11) y segundo equipo (12–22) con escuela y ciudad natal. Nota: Las banderas indican la selección nacional según se define en las reglas de elegibilidad de la FIFA . Los jugadores pueden tener más de una nacionalidad ajena a la FIFA.
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Nacionales
Junto con el anfitrión Alberta Golden Bears, los equipos que se clasificaron para las Finales Nacionales son UNB Varsity Reds, Trinity Western Spartans, Montreal Carabins, Western Ontario Mustangs, St. Mary's Huskies, Toronto Varsity blues y Laval Rouge et Or.