El equipo de baloncesto masculino de los Piratas de Seton Hall de 2012-13 representó a la Universidad de Seton Hall durante la temporada de baloncesto masculino de la División I de la NCAA de 2012-13 . Los Piratas, dirigidos por el entrenador en jefe Kevin Willard , jugaron sus partidos de local en Newark, Nueva Jersey en el Prudential Center y fueron miembros de la Conferencia Big East . Terminaron la temporada 15-18, 3-15 en el juego Big East para terminar empatados en el puesto 13. Perdieron en la segunda ronda del Torneo Big East ante Syracuse.