Los 400 metros de los Juegos de la Commonwealth de 2006 como parte del programa de atletismo se llevaron a cabo en el Melbourne Cricket Ground del lunes 20 al miércoles 22 de marzo de 2006.
Los dos primeros corredores en cada una de las ocho eliminatorias se clasificaron automáticamente para las semifinales. Los siguientes ocho corredores más rápidos de todas las eliminatorias también clasificaron. Esos 24 corredores compitieron en 3 semifinales, con los dos primeros corredores de cada uno y los siguientes dos más rápidos clasificándose para la final.
Antes del evento, los diez mejores atletas de la Commonwealth según la clasificación de la Asociación Internacional de Federaciones de Atletismo fueron: