Las orcas residentes del sur sufrieron una disminución significativa de la población a fines de la década de 1990 y ahora figuran como en peligro de extinción según la Ley de especies en peligro de extinción de EE. UU. Las orcas están expuestas a perturbaciones de embarcaciones comerciales y privadas durante la temporada de observación de ballenas de verano, y aún se desconoce si dichas embarcaciones modifican el comportamiento de las orcas. En julio de 2006, la tripulación a bordo del buque del Servicio Nacional de Pesquerías Marinas Noctiluca observó una orca residente del sur que "saltaba espía" frente a la isla de San Juan, Washington. El programa de mamíferos marinos del Centro de Ciencias Pesqueras del Noroeste también lleva a cabo investigaciones innovadoras para comprender mejor la ecología, la taxonomía, la fisiología y el comportamiento de las orcas.
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