PCNSL es un linfoma de células grandes; consiste en células linfoides neoplásicas con cromatina pálida ("abierta"), nucléolos prominentes y escaso citoplasma basófilo. Las células tienen aproximadamente ~3-4 veces el tamaño de un linfocito "en reposo". Por lo general, las mitosis no son difíciles de encontrar. Tiene una distribución perivascular característica y es clásicamente periventricular.
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