Los primeros jueces de la Corte Africana de Derechos Humanos y de los Pueblos fueron elegidos el 22 de enero de 2006 en la Octava Sesión Ordinaria del Consejo Ejecutivo de la Unión Africana , celebrada en Jartum, Sudán . Los jueces, provenientes de 11 de los 53 estados miembros de la Unión Africana, tienen diferentes antecedentes de experiencia judicial y conocimiento del derecho internacional y de los derechos humanos.
Cada juez sirve por un período de seis años y puede ser reelegido una vez. El presidente y el vicepresidente son elegidos por períodos de dos años y solo pueden ser reelegidos una vez.
- Dr. Gerard Niyungeko (Presidente)
- Modibo Tounty Guindo (Vicepresidente)
- Dr. Fatsah Ouguergouz
- Jean Emile Somda
- Sophia AB Akuffo
- Kellelo Justina Mafoso-Guni
- Hamdi Faraj Fanoush
- Jean Mutsinzi
- El Hadj Guissé
- Bernard Ngoepe
- George W. Kanyeihamba