El equipo de baloncesto masculino Northern Iowa Panthers representa a la Universidad de Northern Iowa ubicada en Cedar Falls, Iowa . UNI es actualmente miembro de la Conferencia del Valle de Missouri .
El mayor logro de Jacobson como entrenador hasta la fecha fue en la temporada 2009-10, cuando los Panthers llegaron a los Sweet Sixteen del Torneo de la NCAA destacados por una victoria sobre el principal favorito nacional Kansas. El columnista de ESPN.com, Pat Forde, calificó la victoria de los Panthers como "la mayor sorpresa de un torneo en años" y calificó el tiro decisivo del escolta de los Panthers, Ali Farokhmanesh , como "el tiro más valiente en la primera ronda en la historia del torneo de la NCAA".
Jacobson también entrenó a UNI, ya que se convirtió en el primer programa universitario en representar a los Estados Unidos de América en una competencia internacional de baloncesto. En agosto de 2007, UNI fue elegida para formar parte del Equipo de EE. UU. en los Juegos Mundiales Universitarios en Bangkok, Tailandia. Vistiendo el rojo, blanco y azul, UNI obtuvo 5-1 en el torneo, perdiendo solo ante el eventual medallista de oro Lituania, mientras que logró victorias sobre Angola, Turquía, China, Finlandia e Israel.
El 15 de noviembre de 2014, Jacobson se convirtió en el líder de victorias de todos los tiempos para un entrenador en la historia del baloncesto masculino de UNI. Después de registrar una victoria sobre su alma mater , la Universidad de Dakota del Norte , logró su victoria número 167 en UNI. Además, en la temporada 2014-15, Jacobson llevó a los Panthers a su clasificación más alta en la historia de la escuela (# 10) en AP y (# 9) en la encuesta de entrenadores. UNI también en esa temporada logró la mayor cantidad de victorias en la historia de la escuela con 31. Jacobson también recibió el premio al entrenador del año de la Conferencia del Valle de Missouri en 2009, 2010 y 2015.
El 21 de noviembre de 2015, Jacobson llevó a UNI a una victoria sobre el #1 de Carolina del Norte . La victoria fue una de las más grandes en la historia del programa y se produjo solo en el primer encuentro de los dos programas de baloncesto. Solo cuatro días después, el entrenador alcanzó otro hito en su carrera. Después de derrotar a la Universidad de Dubuque de manera contundente, el entrenador registró su victoria número 200 en la universidad.
En la primera ronda del torneo MVC, Jacobson logró la victoria número 250 de su carrera en el norte de Iowa contra Evansville el 1 de marzo de 2018.