Sant'Agapito es una comuna (municipio) en la provincia de Isernia en la región italiana de Molise , ubicada a unos 40 kilómetros (25 millas) al oeste de Campobasso y a unos 6 kilómetros (4 millas) al sur de Isernia .
Sant'Agapito limita con los siguientes municipios: Isernia , Longano , Macchia d'Isernia y Monteroduni .