El evento de espalda de 100 metros masculino en los Juegos Maccabiah de 2009 se llevó a cabo el 9 de julio en el Instituto Wingate . Este evento de natación utilizó la espalda . Debido a que una piscina de tamaño olímpico tiene 50 metros de largo, esta carrera consistió en dos longitudes de la piscina.
Se llevaron a cabo tres eliminatorias. La serie en la que competía un nadador no importaba formalmente para el avance, ya que los nadadores con los dieciséis mejores tiempos de todo el campo se clasificaron para las semifinales. Se llevaron a cabo dos eliminatorias de semifinales de ocho nadadores cada una. Los nadadores con los ocho tiempos más rápidos avanzaron nuevamente a la final; allí, todos compitieron en una sola serie final para ganar las ubicaciones finales.
Las naciones con tres o más nadadores que cumplan con el estándar podrían ingresar solo tres de esos nadadores en la final.