La temporada de béisbol de la NCAA de 1944, juego de béisbol universitario en los Estados Unidos organizado por la Asociación Nacional de Atletismo Colegiado (NCAA) comenzó en la primavera de 1944. El juego consistió principalmente en enfrentamientos regionales, algunos organizados por conferencias, y terminó en junio. Ningún evento de campeonato nacional se llevó a cabo hasta 1947.