Egipto se clasificó por defecto después de que tanto Marruecos como Nigeria se retiraron. Egipto también se retiró más tarde debido al deterioro de sus relaciones diplomáticas con Túnez tras un discurso en Jericó del presidente tunecino Bourguiba , quien llamó a los países árabes a reconocer a Israel . [1]
El partido en Nairobi entre Kenia y Etiopía fue otorgado como una victoria por 0-2, luego de que Etiopía presentara una protesta ante la Confederación Africana de Fútbol (CAF) porque Kenia había presentado a dos jugadores (Moses Wabwayi y Stephen Baraza) que no eran elegibles porque había representado a Uganda anteriormente. El walkover permitió a Etiopía clasificarse por delante de Sudán . coste y fletetambién suspendió a los dos jugadores por un año (retrocediendo a partir de septiembre de 1964) después de que Uganda protestó porque todavía estaban registrados en la Uganda FA y no habían recibido transferencias oficiales. Kenia se opuso al fallo y envió documentos para probar que los dos eran ciudadanos kenianos, habiendo nacido en Kenia. El caso también fue remitido a la FIFA . [1]
Después de que Egipto se retirara, la CAF anunció que habría un desempate entre los equipos en segundo lugar en las otras tres Zonas para determinar el reemplazo de Egipto en el torneo final. Sudán declinó la invitación a participar por lo que se programó un único partido de desempate en Accra (Ghana) el 31-10-65 entre Congo-Léopoldville y Guinea. Sin embargo, Guinea se retiró poco antes de esta fecha, dejando que Congo-Léopoldville se clasificara por defecto.