Los campeonatos de atletismo bajo techo de la NCAA de 1965 se disputaron en la primera reunión anual de atletismo autorizada por la NCAA para determinar los campeones nacionales individuales y por equipos de los eventos de atletismo bajo techo de la división universitaria universitaria masculina en los Estados Unidos .
Por primera vez, la NCAA organizó un campeonato separado solo para eventos de pista y campo bajo techo. La competencia al aire libre original se había llevado a cabo anualmente desde 1921. A diferencia del campeonato al aire libre, que se llevó a cabo más tarde en el año durante la primavera, el título bajo techo se disputó durante la temporada de deportes de invierno.