La Tercera División chipriota de 1987–88 fue la decimoséptima temporada de la liga de fútbol de tercer nivel chipriota . Digenis Akritas Morphou FC ganó su primer título.
Catorce equipos participaron en la Tercera División chipriota de 1987–88. Todos los equipos jugaron dos veces entre sí, una vez en casa y otra fuera. El equipo con más puntos al final de la temporada se coronó campeón. Los dos primeros equipos fueron ascendidos a la Segunda División chipriota de 1988–89 . Los últimos tres equipos fueron relegados a la Cuarta División chipriota de 1988–89 .