El Torneo de Béisbol de la Conferencia Big Ten 1999 se llevó a cabo en el Estadio Bill Davis en el campus de la Universidad Estatal de Ohio en Columbus, Ohio, del 15 al 19 de mayo. Los cuatro mejores equipos de la temporada regular participaron en el torneo de doble eliminación , el decimoctavo torneo anual torneo patrocinado por la Conferencia Big Ten para determinar el campeón de la liga. Michigan ganó su sexto campeonato del torneo y ganó la oferta automática de la Conferencia Big Ten para el Torneo de Béisbol de la División I de la NCAA de 1999 . [3]
El torneo de 1999 fue un torneo de doble eliminación de 4 equipos , con cabezas de serie determinadas únicamente por el porcentaje de victorias de la temporada regular de la conferencia. [3]