El Torneo de Baloncesto Masculino de la Conferencia del Medio Continente de 1999 se llevó a cabo del 28 de febrero al 2 de marzo de 1999 en The MARK of the Quad Cities en Moline, Illinois . [2] Esta fue la 16ª edición del torneo de la Asociación de Universidades del Continente Medio / Conferencia del Continente Medio , ahora conocida como Summit League .
El segundo sembrado Valparaiso derrotó al primer sembrado Youngstown State 73–69 para ganar un puesto automático en el Torneo de la NCAA de 1999 .