El Torneo de Béisbol de la Conferencia Sur de 2000 se llevó a cabo en Joseph P. Riley, Jr. Park en Charleston, Carolina del Sur, del 17 al 21 de mayo. El primer cabeza de serie Georgia Southern ganó el torneo y obtuvo la candidatura automática de la Conferencia Sur a la División I de la NCAA de 2000. Torneo de Beisbol . Fue la segunda victoria de Eagles en el torneo.
El torneo utilizó un formato de doble eliminación. Solo participan los ocho mejores equipos, por lo que VMI, Western Carolina y Wofford no estaban en el campo. Western Carolina obtuvo el primer puesto al ganar la serie de la temporada sobre el co-campeón de la temporada regular The Citadel. College of Charleston obtuvo el séptimo sembrado al ganar la serie de la temporada sobre Davidson.