El equipo de fútbol americano Wagner Seahawks de 2000 representó a Wagner College en la temporada de fútbol americano de la División I-AA de la NCAA de 2000 como miembro de la Conferencia del Noreste (NEC). Los Seahawks fueron dirigidos por el entrenador en jefe de 20 años, Walt Hameline, y jugaron sus partidos en casa en el Wagner College Stadium . Wagner terminó la temporada 6-5 en general y 6-2 en NEC para quedar tercero.