La Top League 2012-13 fue la décima temporada de la competición nacional de rugby de Japón , la Top League . Comenzó el 31 de agosto de 2012. La final se llevó a cabo el 27 de enero de 2013 y Suntory Sungoliath la ganó para reclamar su tercer título de la Top League.
Los 4 primeros clasificaron a los play-offs por el título para luchar por la Copa Microsoft y el título de la Top League. Los 4 primeros también clasificaron directamente al All-Japan Rugby Football Championship .
Los equipos clasificados del 5 al 10 pasaron a los play-offs wildcard para clasificarse para el All-Japan Rugby Football Championship . Los equipos clasificados 13 y 14 fueron a los play-offs de ascenso y descenso contra los retadores regionales para luchar por permanecer en la Liga Superior.
• Los 4 mejores equipos clasificaron a los play-offs por el título .
• Los 4 mejores equipos también se clasificaron para entrar en el All-Japan Rugby Football Championship .
• Los equipos del 5 al 10 clasificaron a los play-offs wildcard para ingresar al All-Japan Rugby Football Championship .
• Los equipos 11 y 12 permanecen en la Liga Superior para 2013–14 .
• Los equipos 13 y 14 pasaron a los play-offs de ascenso y descenso contra los retadores regionales.
Cuatro puntos por victoria, dos por empate, un punto de bonificación por cuatro intentos o más (BP1) y un punto de bonificación por perder por siete o menos (BP2).
Si los equipos están empatados en cualquier etapa, los desempates se aplican en el siguiente orden:
• Diferencia entre puntos a favor y en contra
• Número total de puntos a favor
• Número de partidos ganados
• Número total de puntos anotados en partidos entre equipos empatados
• Número de partidos ganados excluyendo el primer partido, luego el segundo y así sucesivamente hasta resolver el empate
Los 4 mejores equipos de la temporada regular compitieron en el torneo eliminatorio de la Copa Microsoft (2013) para luchar por el título de la Liga Superior. Los 4 mejores equipos de 2012-13 fueron Suntory Sungoliath, Toshiba Brave Lupus, Panasonic Wild Knights y Kobe Steel Kobelco Steelers.