La Copa Chile 2012-13 , (oficialmente conocida como Copa Chile MTS 2012/13 debido a su patrocinio), es la 33ª edición de la Copa Chile , el torneo de copa nacional del país. La competencia comenzó el 23 de junio de 2012 con la Primera Ronda y concluye el 8 de mayo de 2013 con la Final. El ganador clasifica a la Copa Sudamericana 2013 .
Un total de 46 clubes fueron aceptados para la competencia. Los equipos de esta edición son los equipos de Primera División, Primera B, Segunda División y equipos seleccionados de Tercera División.
La Segunda Ronda marca el inicio de la competencia por equipos de Primera División. Esta ronda estuvo compuesta por los ganadores de la Primera Ronda y los equipos de Primera División 2012. Cada equipo juega en casa y fuera contra todos los demás equipos de su grupo. Los 2 mejores equipos de cada grupo avanzan a la siguiente ronda.