El Cork Junior Hurling Championship de 2016 fue la 119.ª edición del Cork Junior Hurling Championship desde su establecimiento por la Junta del condado de Cork en 1895. El campeonato comenzó el 10 de septiembre de 2016 y finalizó el 15 de octubre de 2016.
El 15 de octubre de 2016, Mayfield ganó el campeonato tras una derrota de 1-16 a 1-13 de Sarsfields en la final. [1] Este fue su segundo título de campeonato en el grado y el primero desde 1978.