Pedro Agustín Morales Hernández (11 de marzo de 1808 - 27 de noviembre de 1872) fue un militar boliviano que se desempeñó como el decimosexto presidente de Bolivia entre 1871 y 1872.
Morales nació en La Paz . Originalmente partidario del presidente José Ballivián (1841-1847), Morales se convirtió en enemigo jurado del general Manuel Belzu , quien en esencia había derrocado a Ballivián en 1847.
Después de muchos años de combatir a Belzu, Morales llegó al poder con el presidente José María Linares (1857–1861). Opuesto al gobierno del general José María de Achá , que había derrocado a Linares, Morales apoyó el golpe de Estado de 1864 que llevó al poder al notorio general Mariano Melgarejo , quien lo recompensó con el generalato y (importantemente) el mando del ejército boliviano. El "Sexenio" de Melgarejo había sido controvertido y brutal, y la oposición se generalizó. Eventualmente, el General Morales cambió de bando y, luego de unir a todas las facciones que luchaban contra el Presidente, destronó a Melgarejo mediante un golpe de Estado en enero de 1871. Así terminó el temido "Sexenio", pero no la era del gobierno militar.
De temperamento legendariamente volcánico, Morales se esforzó por gobernar como dictador, pero quedó expuesto como semianalfabeto cuando, en 1872, una de sus cartas fue publicada en los periódicos por un famoso escritor boliviano. Avergonzado, Morales convocó al Congreso por primera vez desde principios de la administración de Achá y se declaró listo para dejar el cargo si se le consideraba indigno. Mientras el Congreso deliberaba, Morales sufrió rabietas y cambios de humor extremadamente violentos. Esto lo llevó a agredir físicamente a uno de sus ayudantes militares en el Palacio de Gobierno de La Paz el 27 de noviembre de 1872. El sobrino del presidente, Federico Lafaye, trató de detenerlo, pero él mismo se golpeó, por lo que Lafaye disparó y mató al temperamental presidente.
Tras la muerte de Morales, el Congreso proclamó a Tomás Frías como presidente interino, encargado de convocar elecciones en 1873.