Alex K. Shalek
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Alex Shalek
Alex K. Shalek, PhD.jpg
Alex Shalek, agosto de 2019
Nació( 18/12/1981 )18 de diciembre de 1981
PremiosHarold E. Edgerton Faculty Achievement Award, MIT (2020)
Pew Charitable Trust Pew-Stewart Scholar (2018)
Alfred P. Sloan Foundation Sloan Research Fellow (2018)
Searle Scholars Program (2015)
Beckman Young Investigators Award (2015)
NIH Director's New Innovator Premio (2015)
Carrera científica
InstitucionesInstituto de Tecnología de Massachusetts Instituto
Broad Instituto
Koch para la Investigación Integrativa del Cáncer
Instituto Ragon
Hospital General de Masa
Escuela de Medicina de Harvard
Asesor de doctoradoParque Hongkun
Sitio webwww .shaleklab .com

Alex K. Shalek es ingeniero biomédico y miembro principal de la facultad del Instituto de Ingeniería y Ciencia Médica (IMES), profesor asociado de química y miembro extramuros del Instituto Koch para la Investigación Integrativa del Cáncer en el Instituto de Tecnología de Massachusetts. . Además, es miembro del Instituto Ragon y miembro del Instituto del Broad Institute , asistente en inmunología en el Hospital General de Massachusetts e instructor en ciencias y tecnología de la salud en la Facultad de Medicina de Harvard.. La investigación multidisciplinaria del Shalek Lab tiene como objetivo crear e implementar métodos de amplia aplicación para estudiar y diseñar respuestas celulares en tejidos, para impulsar el descubrimiento biológico y mejorar el pronóstico, el diagnóstico y la terapéutica de enfermedades autoinmunes, infecciosas y cancerosas. Shalek y su laboratorio son más conocidos por su trabajo en genómica unicelular y por estudiar una serie de enfermedades humanas devastadoras, pero difíciles de estudiar, con socios de todo el mundo. [1]

Educación e investigaciones previas

Shalek recibió su BA summa cum laude en 2004 de la Universidad de Columbia, donde estudió física química como John Jay Scholar con Richard Bersohn y Louis Brus. Luego realizó un trabajo de posgrado en física química desarrollando matrices de nanocables como "jeringas" celulares y sondas electroquímicas bajo la dirección de Hongkun Park en la Universidad de Harvard. [2] Después, como becario postdoctoral, bajo la dirección de Park y Aviv Regeven el Broad Institute, Shalek ayudó a ser pionero en los patrones unicelulares en las respuestas celulares para estudiar cómo las células responden de manera diferente a la misma condición, lo que demuestra que la covariación de la expresión génica de todo el genoma entre las células podría usarse para definir tipos y estados celulares, sus circuitos internos ", de abajo hacia arriba". [3] [4] [5] [6]

Como investigador independiente, Shalek y su laboratorio han ayudado a escalar y simplificar la genómica unicelular para estudiar muestras clínicas complejas y de bajo ingreso en todo el mundo. [7] [5] [8] En paralelo, han utilizado estos y otros enfoques [8] [9] [10] [11] [12] [13] [14] [ citas excesivas ] para ayudar a examinar las causas y consecuencias de la heterogeneidad celular entre los cánceres, [15] [16] [17] [18] [19] enfermedades infecciosas, [5] [8] [9] [10] [20] [21] [22] [23][24] [25] [26] [27] [ citas excesivas ] e inflamación. [28] [29] [30]

La investigación en curso

El trabajo actual en Shalek Lab incluye tanto el desarrollo de tecnologías de habilitación general como su aplicación para caracterizar, modelar y controlar sistemas multicelulares. Con respecto al desarrollo de tecnología, el laboratorio reúne áreas de investigación en genómica , biología química y nanotecnología para establecer enfoques accesibles para perfilar y controlar las células y sus interacciones.

Además de estas herramientas con la comunidad de investigación global, [31] el laboratorio las está aplicando para diseccionar enfermedades humanas, como COVID-19, [32] [33] vinculando metódicamente características celulares y observaciones clínicas. Las principales áreas de enfoque incluyen cómo: las células inmunes coordinan respuestas equilibradas al estrés ambiental; [28] [29] [8] [34] las interacciones entre la célula huésped y el patógeno se desarrollan durante la infección; [8] [9] [10] [21] [22] [23] [26] [ citas excesivas ] y las células tumorales evaden el tratamiento terapéutico y la inmunidad natural. [15] [17] [18] [19][25] [35] [ citas excesivas ]

A partir de estas observaciones y las de otros, el laboratorio tiene como objetivo comprender cómo la enfermedad altera la función de los tejidos a nivel celular y realizar intervenciones terapéuticas y profilácticas para restablecer o apoyar la salud humana.

Seleccionar honores y premios

Premio al Logro Docente Harold E. Edgerton 2019-20 2020 [36]

Premio Joven Mentor, Facultad de Medicina de Harvard , 2020 [37]

Pew-Stewart Scholar, Pew Charitable Trust Charitable Trust, 2018 - 2022 [38]

Miembro de investigación Sloan en Química, Fundación Alfred P. Sloan , 2018 - 2020 [39]

Cátedra de desarrollo profesional Pfizer-Laubach, MIT, 2017 - 2020 [40]

Asesor científico asociado, Medicina traslacional científica, 2016 [41]

Premio al nuevo innovador del director de los NIH , 2015 - 2020 [42]

Premio Beckman Young Investigators Fundación Arnold y Mabel Beckman, 2015 - 2019 [43]

Programa de becarios Searle , Kinship Foundation, 2015 - 2018 [44]

Primer lugar en la competencia "Follow That Cell" (miembro del equipo), NIH, 2015 [45]

Cátedra de desarrollo profesional Hermann LF von Helmholtz, MIT, 2014 - 2016 [45]

Premio a la excelencia, Broad Institute of Harvard y MIT, 2013 [45]

Premio de enseñanza Dudley R. Herschbach, Universidad de Harvard, 2006 [45]

Beca de investigación para graduados, NSF, 2005 - 2008 [45]

Certificado de distinción en docencia, Universidad de Harvard, 2005 [45]

Phi Beta Kappa, Universidad de Columbia, 2004 [45]

John Jay Scholar, Universidad de Columbia, 2000-2004 [45]

Seleccionar publicaciones

  • Huang, Siyi y col. (21 de enero de 2021). "Los ganglios linfáticos están inervados por una población única de neuronas sensoriales con potencial inmunomodulador". Celular . 184 (2): 441–459.e25 [34]
  • Ziegler, CGK y col. (28 de mayo de 2020). “El receptor ACE2 del SARS-CoV-2 es un gen estimulado por interferón en las células epiteliales de las vías respiratorias humanas y se detecta en subconjuntos celulares específicos en los tejidos”, Cell, 181, 1016 (2020). [20]
  • Hughes, Travis K. y col. (13 de octubre de 2020). "ScRNA-Seq masivamente paralelo basado en síntesis de segunda hebra revela estados celulares y características moleculares de patologías cutáneas inflamatorias humanas". La inmunidad . 53 (4): 878–894.e7. [8]
  • Kotliar, Dylan y col. (25/11/2020). "El perfil unicelular de la enfermedad por el virus del Ébola in vivo revela la dinámica viral y del huésped". Celular . 183 (5): 1383–1401.e19. [10]
  • Kazer, Samuel W. y col. (2020-04). "Análisis integrado unicelular de la dinámica inmunitaria multicelular durante la infección hiperaguda por VIH-1". Medicina de la naturaleza . 26 (4): 511–518. [9]
  • Smillie, C. # y col. (2019). “Recableado intra e intercelular del colon humano durante la colitis ulcerosa” Cell , 178 , 714 (2019). [29]
  • Ordovas-Montanes, J. et al. (2018). "La diversidad celular reducida y un estado celular progenitor basal alterado informan la disfunción de la barrera epitelial en la inmunidad humana tipo 2" , Nature , 560 , 649 (2018). [28]
  • Martin-Gayo, E. et al. (2018). “Un marco racional para modular los comportamientos inmunitarios del conjunto inspirado por el control de élite del VIH-1”, Genome Biol. , 19 , 10 (2018). [26]
  • TM Gierahn y col. (2017) "Seq-Well: una plataforma portátil y de bajo costo para RNA-Seq de una sola celda de muestras de bajo consumo". Nature Meth . 14 (2017): 395. [5]
  • I. Tirosh y col. (2017) "Disección del ecosistema multicelular del melanoma metastásico mediante RNA-seq de una sola célula". Science 352.6282 (2016): 189-96. [15]
  • EZ Macosko y col. (2015). "Perfiles de expresión de todo el genoma de miles de células individuales utilizando gotitas de nanolitros". Cell 161 (2015): 1202-14. [7]
  • AK Shalek y col. (2014). "La secuencia de ARN unicelular a gran escala revela estrategias para regular la variabilidad dinámica de célula a célula a través de la señalización paracrina". Nature 510 (2014): 363. [4]
  • AK Shalek y col. (2013). "La transcriptómica unicelular revela la bimodalidad en la expresión y el empalme en las células inmunes". Nature 498 (2013): 236-40. [3]
  • N. Yosef y col. (2013). "Red reguladora dinámica que controla la diferenciación celular Th17". Nature 496 (2013): 461-68. [46]

Referencias

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  4. ↑ a b Shalek, Alex K .; Satija, Rahul; Shuga, Joe; Trombetta, John J .; Gennert, Dave; Lu, Diana; Chen, Peilin; Gertner, Rona S .; Gaublomme, Jellert T .; Yosef, Nir; Schwartz, Schraga (junio de 2014). "RNA-seq de una sola célula revela el control paracrino dinámico de la variación celular" . Naturaleza . 510 (7505): 363–369. Código Bib : 2014Natur.510..363S . doi : 10.1038 / nature13437 . ISSN 1476-4687 . PMC 4193940 . PMID 24919153 .   
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enlaces externos

  • Publicaciones de Alex K. Shalek indexadas por Google Scholar
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