Alexander van Oudenaarden (19 de marzo de 1970) es un biofísico y biólogo de sistemas holandés . Es un investigador líder en biología de células madre , especializado en técnicas unicelulares. En 2012 comenzó como director del Instituto Hubrecht y recibió dos veces una ERC Advanced Grant, en 2012 y en 2017. Recibió el Premio Spinoza en 2017.
Alexander van Oudenaarden | |
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Nació | |
Ciudadanía | Reino de los Países Bajos |
alma mater | Universidad Tecnológica de Delft (MSc, MSc, PhD) |
Carrera científica | |
Campos | Biofísica , Biología de sistemas , Biología sintética |
Instituciones | Instituto Hubrecht |
Biografía
Van Oudenaarden nació el 19 de marzo de 1970 en Zuidland , una pequeña ciudad de la provincia holandesa de Holanda Meridional . Estudió en la Universidad Tecnológica de Delft , donde obtuvo una maestría en Ciencia e Ingeniería de Materiales ( cum laude ) y una maestría en Física, ambas en 1993, y posteriormente un doctorado en Física ( cum laude ) en 1998 en experimentación. física de la materia condensada, bajo la supervisión del profesor JE Mooij . Recibió el premio Andries Miedema (mejor investigación doctoral en el campo de la física de la materia condensada en los Países Bajos) por su tesis sobre "Vórtices cuánticos y efectos de interferencia cuántica en circuitos de uniones de túneles pequeños". En 1998, se trasladó a la Universidad de Stanford , donde fue investigador postdoctoral en los departamentos de Bioquímica y de Microbiología e Inmunología, trabajando en la generación de fuerza de filamentos polimerizantes de actina en el laboratorio Theriot e investigador postdoctoral en el departamento de Química, trabajando en Micropatrón de bi-capas de fosfolípidos soportados en el laboratorio de Boxer . En 2000 se incorporó al departamento de Física del MIT como profesor asistente, fue titular en 2004 y ahora es profesor titular. En 2001 recibió el premio NSF CAREER, y fue a la vez Alfred Sloan Research Fellow y Profesor Keck Career Development Career Development en Ingeniería Biomédica. En 2012, Alexander se convirtió en director del Instituto Hubrecht como sucesor de Hans Clevers . En 2017 recibió su segunda ERC Advanced Grant , por su estudio titulado "un enfoque de genómica unicelular que integra la expresión génica, el linaje y las interacciones físicas".
En 2014, van Oudenaarden se convirtió en miembro de la Real Academia de Artes y Ciencias de los Países Bajos . [1] En 2017 fue uno de los cuatro ganadores del Premio Spinoza . [2]
Está casado y tiene tres hijos.
Trabaja
Durante su tiempo en el MIT, su laboratorio comenzó con líneas paralelas de investigación en la dinámica de la actina [3] [4] y el ruido en las redes de genes, [5] [6] [7] y luego se centró en la estocasticidad en las redes de genes [8] [9 ] [10] [11] redes biológicas como sistemas de control, [12] [13] [14] y la evolución de las redes pequeñas.
En la actualidad, el trabajo de Van Oudenaardens en el Instituto Hubrecht se centra en la expresión de genes estocásticos, [15] [16] desarrollando nuevas herramientas para cuantificar la expresión de genes en células individuales [17] [18] y microARN [19] [20]
Referencias
- ^ "Alexander van Oudenaarden" . Real Academia de las Artes y las Ciencias de los Países Bajos. Archivado desde el original el 18 de septiembre de 2020.
- ^ "Prof. dr. Ir. A. (Alexander) van Oudenaarden" . Organización de los Países Bajos para la Investigación Científica. Archivado desde el original el 6 de noviembre de 2020.
- ^ Upadhyaya, A; Chabot, JR; Andreeva, A .; Samadani, A .; van Oudenaarden, A. (2003). "Sondeo de las fuerzas de polimerización mediante el uso de vesículas lipídicas impulsadas por actina" . PNAS USA . 100 (8): 4521–6. Código bibliográfico : 2003PNAS..100.4521U . doi : 10.1073 / pnas.0837027100 . PMC 153588 . PMID 12657740 .
- ^ Upadhyaya, A; A. van Oudenaarden (2003). "Sistemas biomiméticos para el estudio de la motilidad basada en actina". Biología actual . 13 (18): R734–44. doi : 10.1016 / j.cub.2003.08.051 . PMID 13678615 . S2CID 7557122 .
- ^ Thattai, M; A. van Oudenaarden (2001). "Ruido intrínseco en redes reguladoras de genes" . PNAS USA . 98 (15): 8614–9. Código Bibliográfico : 2001PNAS ... 98.8614T . doi : 10.1073 / pnas.151588598 . PMC 37484 . PMID 11438714 .
- ^ Ozbudak, E .; Thattai, M .; Kurtser, I .; Grossman, AD; van Oudenaarden, A. (2002). "Regulación del ruido en la expresión de un solo gen" . Genética de la naturaleza . 31 (1): 69–73. doi : 10.1038 / ng869 . PMID 11967532 . S2CID 205357854 .
- ^ Thattai, M; A. van Oudenaarden (2002). "Atenuación de ruido en cascadas de señalización ultrasensibles" . Revista biofísica . 82 (6): 2943–50. Código Bibliográfico : 2002BpJ .... 82.2943T . doi : 10.1016 / S0006-3495 (02) 75635-X . PMC 1302082 . PMID 12023217 .
- ^ Pedraza, JM; A. van Oudenaarden (2005). "Propagación de ruido en redes de genes". Ciencia . 307 (5717): 1965–9. Código bibliográfico : 2005Sci ... 307.1965P . doi : 10.1126 / science.1109090 . PMID 15790857 . S2CID 18629554 .
- ^ Becskei, A; BB Kaufmann; A. van Oudenaarden (2005). "Contribuciones del bajo número de moléculas y posicionamiento cromosómico a la expresión de genes estocásticos". Genética de la naturaleza . 37 (9): 937–44. doi : 10.1038 / ng1616 . PMID 16086016 . S2CID 7301259 .
- ^ Acar, M; A. Becskei; A. van Oudenaarden (2005). "Mejora de la memoria celular mediante la reducción de las transiciones estocásticas". Naturaleza . 435 (7039): 228–32. Código bibliográfico : 2005Natur.435..228A . doi : 10.1038 / nature03524 . PMID 15889097 . S2CID 4429383 .
- ^ Chabot, JR; JM Pedraza; P. Luitel; A. van Oudenaarden (2007). "Expresión de genes estocásticos fuera de estado estable en el reloj circadiano de cianobacterias". Naturaleza . 450 (7173): 1249–52. Código Bibliográfico : 2007Natur.450.1249C . doi : 10.1038 / nature06395 . PMID 18097413 . S2CID 1670452 .
- ^ Thattai, M; A. Becskei; A. van Oudenaarden (2005). "Un sistema de contrarrestar los bucles de retroalimentación regula la actividad de Cdc42p durante la polarización celular espontánea". Célula de desarrollo . 9 (4): 565–71. doi : 10.1016 / j.devcel.2005.08.014 . PMID 16198298 .
- ^ Tsang, J; J. Zhu; A. van Oudenaarden (2007). "La retroalimentación mediada por microARN y los bucles de retroalimentación son motivos de red recurrentes en los mamíferos" . Célula molecular . 26 (5): 753–67. doi : 10.1016 / j.molcel.2007.05.018 . PMC 2072999 . PMID 17560377 .
- ^ Mettetal, J; D. Muzzey; C. Gómez-Uribe; A. van Oudenaarden (2008). "La dependencia de la frecuencia de la osmoadaptación en Saccharomyces cerevisiae" . Ciencia . 319 (5862): 482–4. Código Bibliográfico : 2008Sci ... 319..482M . doi : 10.1126 / science.1151582 . PMC 2916730 . PMID 18218902 .
- ^ Junker, Philipp; Alejandro (2014). "Cada célula es especial: los estudios de todo el genoma añaden una nueva dimensión a la biología unicelular" . Celular . 157 (1): 8-11. doi : 10.1016 / j.cell.2014.02.010 . PMID 24679522 .
- ^ Ji, Ni; Middelkoop, Teije; Mentink, Remco; Betist, Marco; Tonegawa, Satto; Mooijman, Dylan; Korswagen, Hendrik; Alejandro (2013). "Control de retroalimentación de la variabilidad de la expresión génica en la vía Wnt de Caenorhabditis elegans" . Celular . 155 (4): 869–880. doi : 10.1016 / j.cell.2013.09.060 . PMID 24209624 .
- ^ Grün, Dominic; Kester, Lennart; Alejandro (2014). "Validación de modelos de ruido para transcriptómica unicelular". Métodos de la naturaleza . 11 (6): 637–640. doi : 10.1038 / nmeth.2930 . PMID 24747814 . S2CID 26868243 .
- ^ Klemm, Sandy; Semrau, Stefan; Wiebrands, Kay; Mooijman, Dylan; Faddah, Dina; Jaenisch, Rudolf; Alejandro (2014). "Perfil transcripcional de células ordenadas por abundancia de ARN" . Métodos de la naturaleza . 11 (5): 549–551. doi : 10.1038 / nmeth.2910 . PMC 4174458 . PMID 24681693 .
- ^ Polla; Kim, Dominic Grün; Alejandro (2013). "Amortiguación de las oscilaciones de expresión mediante la regulación sincrónica de un microARN y su objetivo" . Genética de la naturaleza . 45 (11): 1337-1344. doi : 10.1038 / ng.2763 . PMC 3812263 . PMID 24036951 .
- ^ Mukherji, Shankar; Ebert, Margaret; Zheng, Grace; Tsang, John; Sharp, Phil; Alejandro (2011). "Los microARN pueden generar umbrales en la expresión de genes diana" (PDF) . Genética de la naturaleza . 43 (9): 854–859. doi : 10.1038 / ng.905 . PMC 3163764 . PMID 21857679 .
enlaces externos
- Laboratorio de Alex van Oudenaarden @ MIT
- Perfil de la facultad de Alex van Oudenaarden @ MIT