Antes de 1800, Altfrauhofen fue gobernado por el "Barón de Fraunhofen". Sin embargo, la inmediatez imperial de Fraunhofen no fue reconocida por los príncipes electores bávaros. Cuando Napoleón estableció la Confederación del Rin en 1806, la ciudad pasó a formar parte de Baviera. La ciudad fue trasladada a su distrito actual durante las reformas administrativas bávaras de 1818.