Anatomography es un sitio web interactivo que admite la generación de diagramas anatómicos y animaciones del cuerpo humano . El sitio web de Anatomografía es mantenido por el instituto de investigación sin fines de lucro DBCLS (Centro de bases de datos para las ciencias de la vida) ubicado en la Universidad de Tokio . Los diagramas anatómicos generados por Anatomography y los datos poligonales 3D utilizados en el sitio web (llamado BodyParts3D) están disponibles gratuitamente bajo la licencia Creative Commons Attribution-ShareAlike . [2]
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| Disponible en | Ingles o japones |
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| Dueño | Centro de bases de datos para ciencias biológicas |
| Creado por | Kousaku Okubo |
| URL | lifesciencedb.jp/bp3d |
| Comercial | No |
| Lanzado | 2009-02-09 [1] |
| Estado actual | Activo |
| Licencia de contenido |  CC-BY-SA 2.1-ja [2] |
Descripción
La anatomografía fue lanzada el 9 de febrero de 2009 [1] por el fundador y director en jefe Kousaku Okubo (大 久保 公 策), profesor del Banco de datos de ADN de Japón en el Instituto Nacional de Genética .
Los datos poligonales del cuerpo humano que se utilizan en el sitio se denominan " BodyParts3D ". [3] Los datos de polígonos de BodyParts3D se extraen de imágenes de resonancia magnética de cuerpo completo . El conjunto de imágenes de resonancia magnética en el que se basa BodyParts3D se llama "TARO". Taro es un nombre de pila común para los hombres en japonés, como lo es John en inglés. Taro es un 2 mm * 2 mm * 2 mm voxel conjunto de datos del varón humano creado por el Instituto Nacional de Tecnología de la Información y Comunicaciones . [4] TARO se publicó gratuitamente en noviembre de 2004. [5] [6]
El proceso de construcción de BodyParts3D es el siguiente. [3]
- Fase 1: Se introdujeron segmentaciones anatómicas adicionales en los datos TARO originales.
- Fase 2: Luego, los detalles faltantes se complementaron y los contornos borrosos se aclararon utilizando un programa de edición 3D haciendo referencia a libros de texto, atlas [7] y modelos de maquetas de ilustradores médicos.
- Fase 3: Continuará la segmentación y la modificación de datos en colaboración con los investigadores clínicos hasta que se logre una cobertura de concepto suficiente.
Los datos poligonales de BodyParts3D se distribuyen en el formato de archivo OBJ . El tamaño del archivo de datos completo es 127 MB (polígono reducido) y 521 MB (alta calidad) a partir de la versión 3.0. [8] El número de partes del cuerpo (órganos) registradas en BodyParts3D es de 1.523 a partir de la versión 3.0. [7]
Licencia
Las imágenes generadas por Anatomography y los datos poligonales incluidos en BodyParts3D tienen licencia Creative Commons , [2] con la esperanza de ampliar el uso y democratizar el conocimiento médico. [9]
Fondos
El proyecto BodyParts3D / Anatomography fue financiado por MEXT ( Ministerio de Educación, Cultura, Deportes, Ciencia y Tecnología de Japón ) desde el año fiscal 2007 hasta el año fiscal 2010. [10] [11] A partir del año fiscal 2011, el proyecto ha sido financiado por la JST ( Agencia de Ciencia y Tecnología de Japón ). [11]
Recepción
Los diagramas de anatomografía se utilizan, por ejemplo, en el programa de televisión de ciencia canadiense Le code Chastenay , [12] enciclopedia de Internet Wikipedia, como material de conferencias en universidades y en otros lugares para compartir conocimientos. [9] Sobre el uso de Anatomografía en sitios web como Wikipedia y Wikimedia Commons, los desarrolladores dicen que "la difusión de usos por parte de usuarios anónimos en Wikipedia y Wikimedia Commons es lo que esperábamos". [9]
Características técnicas
El proyecto BodyParts3D / Anatomography utiliza el modelo fundamental de anatomía (FMA). La FMA es una ontología anatómica de código abierto desarrollada y mantenida por el Grupo de Informática Estructural de la Universidad de Washington . En BodyParts3D, cada parte del cuerpo es administrada por un identificador FMA (FMAID) definido por FMA. Por ejemplo, la columna vertebral se registra como FMA13478 , el lóbulo temporal se registra como FMA61825 , y así sucesivamente.
Historial de versiones
Servicios similares
- Zygote Body : servicio web gratuito proporcionado por Zygote Media Group ubicado en American Fork, Utah, EE. UU. Zygote Body se lanzó como Google Body el 15 de diciembre de 2010. Los datos poligonales utilizados en el sitio web son un producto comercial. En octubre de 2012, el precio de sus datos de polígono de cuerpo completo es $ 13,995. [dieciséis]
- BioDigital Human : servicio web gratuito y producto comercial proporcionado por BioDigital , Inc. con sede en Nueva York, Nueva York, EE. UU. The BioDigital Human se publicó en 2011. El sitio web ganó un premio SXSW Interactive Award en 2013.
Otros
Algunos videos tutoriales sobre el uso de la anatomografía están disponibles en YouTube , [17] ver enlaces externos .
Imágenes Adicionales
Huesos y músculos.
Corazón y sus vasos sanguíneos .
Cráneo y globos oculares.
Cerebro y lóbulo frontal .
Impresión 3D de datos óseos del pie BodyParts3D.
Pintar colores en datos de polígonos de vértebras cervicales , incluidos en los datos de BodyParts3D, utilizando MeshLab .
Datos poligonales de BodyParts3D descargados, editados con Blender .
El director en jefe Kousaku Okubo en la conferencia de la Universidad de Tokio. [18]
Ver también
- Anatomía humana
- Ciencia abierta
- Información abierta
- Ciencia común
- Democratización del conocimiento
Referencias
- ^ a b c Notas de la versión (en japonés). DBCLS. Consultado el 12 de octubre de 2012.
- ^ a b c Preguntas frecuentes: crédito. (en japonés) DBCLS. Consultado el 12 de octubre de 2012.
- ^ a b Mitsuhashi, N; Fujieda, K; Tamura, T; Kawamoto, S; Takagi, T; Okubo, K (2009). "BodyParts3D: base de datos de estructura 3D para conceptos anatómicos" . Investigación de ácidos nucleicos . 37 (Problema de la base de datos): D782–5. doi : 10.1093 / nar / gkn613 . PMC 2686534 . PMID 18835852 .
- ^ Nagaoka, T; Watanabe, S; Sakurai, K; Kunieda, E; Watanabe, S; Taki, M; Yamanaka, Y (2004). "Desarrollo de modelos realistas de voxel de cuerpo entero de alta resolución de hombres y mujeres japoneses adultos de altura y peso promedio, y aplicación de modelos a la dosimetría de campo electromagnético de radiofrecuencia". Física en Medicina y Biología . 49 (1): 1-15. doi : 10.1088 / 0031-9155 / 49/1/001 . PMID 14971769 .
- ^ 日本人 の 数 値 人体 モ デ ル DB 「TARO」 と 「HANAKO」 公開 2004/11/10 (en japonés). ITMedia. Consultado el 12 de octubre de 2012.
- ^ 報道 発 表: 日本人 平均 成人 男女 の 数 値 人体 モ デ ル デ ー タ ベ ー ス 公開 の お 知 ら せ 2004-11-10 (en japonés). Instituto Nacional de Tecnología de la Información y las Comunicaciones. Consultado el 12 de octubre de 2012.
- ^ a b c Nota de la versión de BodyParts3D (versión 3.0, 20/06/2011) DBCLS. Consultado el 15 de octubre de 2012.
- ^ Descargar - BodyParts3D DBCLS. Consultado el 15 de octubre de 2012.
- ^ Un b c 三橋信孝,藤枝香,今井紫緒,武藤勇,田村卓郎,川本祥子,高木利久,大久保公策「BodyParts3DとAnatomography:医学での情報共有を「動機付ける」素材」(en japonés) [ enlace inactivo permanente ]シ ン ポ ジ ウ ム 「ラ イ フ サ イ エ ン ス の 未来 へ ～ 10 年 先 の デ ー タ ベ ー ス を 考 え る」 」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Tahuro Imakura, Kakuchi y Kakujō, Kaori Fujieda. Materiales que motivan el intercambio de información en medicina "Presentación de póster en el" Simposio: Hacia el futuro de las ciencias de la vida - Bases de datos de pensamiento de 10 años después "celebrado en la Universidad de Tokio el 2010-10-05. Consultado el 12 de octubre de 2012.
- ^ Descripción de la base de datos BodyParts3D Archivo de la base de datos de ciencias biológicas. Consultado el 19 de octubre de 2012.
- ^ a b Preguntas frecuentes: sobre el Centro de bases de datos para las ciencias de la vida (DBCLS) Archivado el 30 de enero de 2013 en Wayback Machine DBCLS. Consultado el 19 de octubre de 2012.
- ^ 「LE CODE CHASTENAY」 Emisión 48 , 2010-01-19 transmitido
- ^ Actualizaciones de "BodyParts3D / Anatomography" Archivado el 5 de junio de 2010 en la Wayback Machine Publicado el 28 de abril de 2010. DBCLS. Consultado el 16 de octubre de 2012.
- ^ Nota de la versión de BodyParts3D (versión 2.0, 28/4/2010) DBCLS. Consultado el 15 de octubre de 2012.
- ^ "Notas de la versión de BodyParts3D, v4.0" . Consultado el 18 de noviembre de 2015.
- ^ Colección de anatomía masculina 5.0 3Dscience.com. (Zygote Media Group, Inc.). Consultado el 19 de octubre de 2012.
- ^ Kawano, S; Ono, H; Takagi, T; Bono, H (2012). "Vídeos tutoriales de recursos bioinformáticos: ensayo de distribución online en Japón llamado TogoTV" . Sesiones informativas en bioinformática . 13 (2): 258–68. doi : 10.1093 / bib / bbr039 . PMC 3294242 . PMID 21803786 .
- ^ Conferencia "Equilibrio de la protección de la propiedad intelectual y el intercambio de datos en la ciencia" celebrada en la Universidad de Tokio, 2009-10-05. Presentación de Okubo en japonés Archivado el 10 de junio de 2013 en Wayback Machine , justo antes dela conferencia de Lawrence Lessig . Los videos completos de cada conferencia están disponibles en la página de programación del programa del sitio web de la conferencia (en parte en japonés, en parte en inglés). Archivado el 4 de febrero de 2013 en Wayback Machine .
enlaces externos
- Anatomografia
- BodyParts3D datos de polígono
- Introducción a BodyParts3D / Anatomography en YouTube
- Cómo utilizar BodyParts3D / Anatomography 2010 en YouTube
- Centro de bases de datos para ciencias biológicas