Magowski comenzó su carrera en Bydgoszcz con el BKS Bydgoszcz. No se sabe cuánto tiempo pasó con el BKS, pero se sabe que se mudó al Polonia Bydgoszcz en 1985, a los 19 años. Después de 4 temporadas con el Polonia, Magowski se unió a Elana Toruń por una temporada, [1] antes de asegurar una transferencia al I liga lado Olimpia Poznań .
Durante su primera etapa en el Olimpia, disputó un total de 43 partidos en la máxima categoría con el club a lo largo de dos temporadas y media. [2] [3] [4] Durante las vacaciones de invierno se unió al Igloopol Dębica en apuros , pero no pudo evitar el descenso en sus 14 apariciones con el club. [5] Como resultado, Magowski fue relegado con los dos equipos en los que jugó durante la temporada 1992–93, Olimpia de la I liga e Igloopol de la II liga. Magowski regresó a Olimpia durante el verano y pasó la siguiente temporada con Olimpia en la II liga, haciendo otras 25 apariciones para el club y anotando 3 goles [6] mientras Olimpia ganaba la liga. [7]
A pesar de haber sido ascendido la temporada anterior con Olimpia, Magowski se unió a los rivales de la ciudad Warta Poznań para el comienzo de la temporada 1994-1995. A medida que avanzaba la temporada, estaba claro que Magowski iba a tener otro descenso en su historial y optó por reincorporarse a Olimpia hacia el final de la temporada. Hizo 26 apariciones con Warta y otras 5 con Olimpia esa temporada, y Warta terminó último en la I liga. Al comienzo de la temporada 1995–96, Olimpia Poznań se fusionó con Lechia Gdańsk creando el equipo Olimpia-Lechia Gdańsk , y con el equipo jugando en la ciudad de Gdańsk . Magowski hizo una aparición con Olimpia-Lechia [8] antes de optar por mudarse a Alemania para las próximas 4 temporadas.
Inicialmente se unió al VfL Herzlake en Alemania, tuvo una primera temporada impresionante y terminó como el máximo goleador del club con 10 goles. [9] A pesar del impresionante comienzo en Alemania de Magowski, solo logró 9 apariciones en la temporada siguiente y se unió al VfL Osnabrück , donde luchó aún más, haciendo solo 3 apariciones en toda la temporada. [10] Regresaría al VfL Herzlake por una última temporada, haciendo 26 apariciones y anotando 5 goles, para llevar su total en Alemania durante las cuatro temporadas a 70 apariciones en la liga y 16 goles. Regresó a Polonia, jugando su última temporada con Pomerania Police antes de retirarse en 2000. En total hizo 75 apariciones en la primera división de Polonia anotando 4 goles.
Después de su carrera como jugador, ha ocupado puestos directivos en clubes como; Comienza Radziejów , Pomowiec Kijewo, Mień Lipno, Unia Solec Kujawski y Dąb Barcin . En 2013 se convirtió en coordinador de la Asociación de Fútbol de Kuyavia y Pomerania. [11]