Archaeopteryx es un programa informático interactivo , escrito en Java , para ver , editar y analizar árboles filogenéticos . Este tipo de programa se puede utilizar para una variedad de análisis de conjuntos de datos moleculares , pero está especialmente diseñado para la filogenómica . Además de los formatos de descripción de árbol con expresividad limitada (como Newick/New Hamphshire, Nexus), también implementa el formato phyloXML [1] . Archaeopteryx es el sucesor del programa Java A Tree Viewer (ATV). [2]