IF1 se asocia con la subunidad ribosomal 30S en el sitio A y evita que entre un aminoacil-tRNA . Modula la unión de IF2 al ribosoma aumentando su afinidad. También puede evitar que la subunidad 50S se una , deteniendo la formación de la subunidad 70S . También contiene un pliegue de dominio β común para las proteínas de unión a ácidos nucleicos.