El béisbol fue uno de los 19 deportes incluidos en los Juegos All-Africa de 1999 celebrados durante septiembre de ese año en Johannesburgo , Sudáfrica . Marcó la primera de dos ediciones de los Juegos durante las cuales se incluiría el béisbol. Seis equipos participaron en el torneo, y el ganador se clasificó para un desempate con el campeón de Oceanía , cuyo ganador se clasificaría luego para los Juegos Olímpicos de verano de 2000 en Australia .
Sudáfrica dominó el torneo cómodamente, superando a sus oponentes por dos dígitos. Pasaron al desempate de clasificación olímpica contra Guam, donde también tuvieron éxito, arrasando en una serie al mejor de cinco disputada en Johannesburgo en diciembre de 1999, ganando la primera y única clasificación del equipo para el béisbol olímpico . Los jugadores sudafricanos lideraron la mayoría de las categorías estadísticas del torneo, incluido el máximo bateador, Ian Holness, quien bateó .909 con 10 hits en 11 turnos al bate.
El torneo se jugó en un solo formato de todos contra todos, con cada equipo jugando entre sí una vez.