Marot llegó a Acadia alrededor de 1610 y se ubicó en Port-Royal como cirujano calificado. En 1630, se encargó de repoblar Charles de Saint-Étienne de la Tour en Cap de Sable para la Compagnie des Cent-Associés .
También sirvió a Isaac de Razilly y, después de la muerte de Razilly, a Charles de Menou d'Aulnay . En 1640, fue a reforzar la guarnición en Fort Pentagouet para Charles de Menou.
Marot también actuó como corsario, comerciante y pescador durante sus últimos 20 años conocidos en Acadia, a menudo sin el conocimiento de las autoridades. Marot, y otros como él, fueron importantes para la historia de la época al realizar tareas vitales para asegurar los asentamientos y promover la importancia de la economía.