La tercera temporada de Gran Hermano Alemania duró del 27 de enero de 2001 al 12 de mayo de 2001 y se emitió en RTL y RTL Zwei .
Después de una segunda temporada muy exitosa, los productores no dudaron en comenzar la tercera entrega del programa ya un mes escaso después del final de la segunda temporada manteniendo el formato básico igual. Sin embargo, los productores introdujeron tres giros con la esperanza de mantener la emoción: el primero fue que Coco y Katja, una pareja de novios, entraron juntas a la casa, lo que marcó la primera vez que dos compañeros de casa se conocían antes del programa oficialmente (varios concursantes se conocieron en audiciones en temporadas anteriores). Además, cada compañero de casa ahora tenía tres puntos de nominación para dar: dos para la persona menos querida y una para la segunda persona menos querida en la casa. Se hicieron los mismos cambios en las nominaciones de los espectadores. Sin embargo, el giro más grande se anunció después de que los doce compañeros de casa originales ingresaran a la casa la noche del lanzamiento:se reveló que la actriz entrenada Silvia era un topo que trabajaba para Gran Hermano. Como consecuencia de la gran cantidad de salidas voluntarias durante la temporada 2, los concursantes debían pagar una fianza antes de entrar en la casa y recibirían 1.000 euros semanales en su estancia en la casa. Sin embargo, solo recibirían el depósito y el dinero que ganaron cuando los desalojen.
Debido a la falta de diversidad y los conflictos entre los compañeros de casa, que en su mayoría se han considerado "aburridos" y "tontos", los productores deciden hacer una oferta de 100.000 marcos alemanes que ganaría la persona que caminara voluntariamente esa misma noche. Después de que casi todos los compañeros de casa quisieron aceptar la oferta, Anja se fue con el dinero. Esa misma noche, Gran Hermano reveló que habría un topo en la casa y dejó a la especulación de todos quién era esa persona. Algunos días después, el Gran Hermano le pidió al Topo que revelara su identidad a los otros compañeros de casa y que abandonara la casa después. Como reemplazos de Anja y Silvia, la bomba rubia Ana-Marija y Thomas, que estaba sentado en una silla de ruedas y fue elegido por los espectadores para mudarse, entraron a la casa sin que ninguno de ellos tuviera un gran impacto en el programa.
Después de 106 días, Karina Schreiber ganó la temporada, al igual que los dos primeros ganadores John Milz y Alida Kurras, Schreiber se crió en la RDA y fue considerada como la persona más amable de la casa y nunca fue nominada.
La tercera temporada fue una gran decepción en términos de audiencia y entretenimiento y vio que el programa estuvo fuera de la pantalla durante más de dos años y RTL nunca más emitió un programa de Gran Hermano.