La movilidad de este género es facultativa , lo que significa que tienen la capacidad de moverse, pero no siempre la exhibirán. Heterocyathus podría tener zooxantelas en aguas poco profundas, sin embargo, pueden vivir sin algas simbióticas en profundidades más profundas. [4] La especie Heterocyathus es a veces hermatípico o un coral duro principalmente responsable de la formación de arrecifes. En el caso de Heterocyathus, los arrecifes se forman a medida que la especie produce capas de carbonato de calcio debajo de sus cuerpos. [5] Muestran características de epifauna y, por lo tanto, se ven en áreas de agua más profundas. Son microcarnívoros [6] que se alimentan de organismos diminutos. [7]Una especie de cangrejos ermitaños, Diogenidae Heteropsammia, permite que el Heterocyathus deambule por el lecho marino. [8]
Heterocyathus tiene una relación tanto de mutualismo como de parasitismo con otro organismo llamado escleractiniano-sipunculano del Albiano (comúnmente conocido como un tipo de gusano). El coral se beneficia ya que la lombriz le ofrece nutrientes y alimento, mientras que la lombriz se beneficia ya que el coral es una forma de protección o refugio. Sin embargo, si el caparazón del coral crece más que el gusano, el gusano se beneficia al obtener una protección total, creando así una relación de parasitismo [9]