El clima es principalmente tropical , con variaciones debidas a la altitud. El distrito de Kakamega es principalmente cálido y húmedo la mayor parte del año, mientras que el distrito de Bungoma es más frío pero igual de húmedo. El distrito de Busia es el más cálido, mientras que el montañoso distrito de Vihiga es el más frío. Toda la provincia experimenta lluvias muy intensas durante todo el año, con lluvias prolongadas en los primeros meses del año.