Circovirus canino
El circovirus canino (CaCV o DogCV), aislado por primera vez en 2012, es un pequeño virus de ADN monocatenario, icosaédrico y sin envoltura que infecta exclusivamente a perros domésticos y cánidos salvajes. Es miembro de la familia Circoviridae y del género Circovirus . Actualmente hay 11 especies de circovirus conocidos que se han identificado que afectan a una amplia variedad de aves y mamíferos. Como se ve con todos los circovirus ampliamente estudiados, el diámetro varía entre aproximadamente 15 y 25 nanómetros. [1] El número de triangulación icosaédrica es 1, el tamaño más pequeño que puede tener una cápside viral, en el que hay un total de 60 subunidades de proteínas que forman la cápside. El CaCV no debe confundirse con el coronavirus canino., otro agente causante de diarrea dentro de la familia Coronaviridae , o circovirus porcinos que son miembros del mismo género que CaCV pero que solo se observan en cerdos. El CaCV (genoma 1) fue el primer circovirus identificado que infecta una especie de mamífero distinta a los cerdos.
El genoma del CaCV está formado por una única hebra circular de ADN de 2.063 nucleótidos de longitud. El ADN en general se compone de cuatro bases nitrogenadas: adenina (A), timina (T), citosina (C) y guanina (G) en las que A se empareja con T y G se empareja con C a través de hebras complementarias en ADN de doble hebra y ocasionalmente en ADN monocatenario con una secuencia específica que promueve el apareamiento de bases de la misma cadena. CaCV exhibe este comportamiento en forma de estructuras de tallo. El emparejamiento de bases de nucleótidos guanina-citosina constituye un poco más de la mitad de los pares totales que están presentes en CaCV y los dinucleótidos más abundantes (cuando los nucleótidos adyacentes en la misma hebra se unen covalentemente entre sí) observados son TG y GG. [2]El genoma se compone de dos secciones codificantes y dos no codificantes. Solo hay dos marcos de lectura abiertos (ORF) que codifican para proteínas de la cápside y la replicasa viral específicas. Las proteínas de la replicasa viral están formadas por 303 aminoácidos y la cápside viral está formada por 270 aminoácidos. El gen que codifica la cápside contiene la secuencia de 30 aminoácidos de arginina que se originan en el extremo amino. Se ha planteado la hipótesis de que este tramo inusual es importante para la unión del ADN. Las dos porciones no codificantes intergénicas del genoma están formadas por 135 y 203 nucleótidos. Estas regiones contienen secuencias distintivas para las estructuras de tallo en bucle, en las que el ADN monocatenario se empareja y se forma un anillo al final, así como segmentos de palíndromos.Hay una región no codificante entre los dos ORF que contiene una estructura de tallo en bucle y la secuencia TAGTATTAC utilizada para el inicio de la replicación del genoma. El origen del sitio de replicación (ori) se encuentra dentro de la región intergénica entre las dos regiones codificantes en el extremo 5 '. Las secuencias palindrómicas son una característica importante allí. Una nota interesante sobre el genoma de CaCV es que una de las regiones no codificantes intergénicas comparte 91% de identidad de nucleótidos con el virus teno de torsión de marta de pino de la familia Anelloviridae, lo que proporciona evidencia de una posible relación evolutiva entre los dos virus.Una nota interesante sobre el genoma de CaCV es que una de las regiones no codificantes intergénicas comparte 91% de identidad de nucleótidos con el virus teno de torsión de marta de pino de la familia Anelloviridae, lo que proporciona evidencia de una posible relación evolutiva entre los dos virus.Una nota interesante sobre el genoma de CaCV es que una de las regiones no codificantes intergénicas comparte 91% de identidad de nucleótidos con el virus teno de torsión de marta de pino de la familia Anelloviridae, lo que proporciona evidencia de una posible relación evolutiva entre los dos virus.
La replicación en círculo rodante [3] es un método para replicar genomas que se observa con mayor frecuencia en plásmidos circulares y genomas de bacterias y virus. El dímero proteico importante que debe codificarse en el ADN es la proteína de replicación, Rep. Rep escinde una ubicación del ADN exponiendo un 3 'OH libre para que actúe la polimerasa viral o celular. La replicación del ADN ocurre en el núcleo de la célula en la que este virus es lo suficientemente pequeño como para entrar.
