La temporada 2008-09 Championnat de France Amateurs fue la undécima edición de la competición desde su creación. La competición comenzó oficialmente el 9 de agosto de 2008 y finalizó el 30 de mayo de 2009. La competición consta de 72 clubes repartidos en cuatro grupos paralelos de 18.
Está abierto a equipos de reserva en Francia y clubes amateurs en Francia, aunque solo los clubes amateurs son elegibles para el ascenso al Championnat National . El equipo amateur mejor clasificado de cada grupo asciende, reemplazado por los cuatro peor clasificados de la Championnat.
Nota: A diferencia de las ligas superiores, una victoria en la CFA vale 4 puntos, con 2 puntos por empate y 1 por derrota.
Los playoffs de Championnat de France Amateurs están designados solo para los equipos profesionales de clubes B que juegan en la liga. El club de reserva profesional con mejor resultado en cada grupo avanzará a los playoffs donde se enfrentarán en un sitio por determinar. Los oponentes de la semifinal están determinados por el mejor lugar de llegada. El club de reserva con mejor resultado recibirá el primer sembrado, mientras que el club de reserva con peor resultado de los cuatro recibirá el cuarto sembrado.